| 基于生物信息学分析类风湿关节炎与动脉粥样硬化相互作用的分子机制 |
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| 引用本文： | 裴吉翔,周宏稷,安毅.基于生物信息学分析类风湿关节炎与动脉粥样硬化相互作用的分子机制[J].中国动脉硬化杂志,2024(3):194-202. |
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| 作者姓名： | 裴吉翔 周宏稷 安毅 |
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| 作者单位： | 青岛大学附属医院心血管内科,山东省青岛市 266000;抚顺市中心医院心血管内科,辽宁省抚顺市 113000 |
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| 基金项目： | 青岛市高血压病重点实验室科研基金项目(1016)；国家自然科学基金项目(81071246) |
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| 摘 要： | 目的]基于生物信息学分析探寻类风湿关节炎(RA)和动脉粥样硬化(As)相互影响及作用的分子机制。 方法]从GEO数据库下载RA和As的基因表达谱,通过测试集发现RA和As之间的差异表达基因,通过富集分析探讨常见差异表达基因的生物学作用。利用Cytoscape软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用网络并筛选核心基因。TRRUST数据库揭示的转录调控关系预测转录因子。转录因子在测试集中验证,核心基因通过验证集和血液样本验证。 结果]本研究共鉴定出198个差异表达基因。差异表达基因功能富集分析主要在细胞因子调控的信号通路、白细胞迁移、白细胞正向调控以及细胞因子与细胞因子受体相互作用中。Cytoscape展示了差异表达基因和基因聚类模块,得到核心基因CCL5、CCR1、CCR2、CCR5、IRF8、ITGAM、ITGB2、LCP2、NCF2和PTPRC,验证集结果显示基因尚且可靠。通过TRRUST预测出可调控CCR1和IRF8的转录调控因子STAT1,且验证结果可靠。qPCR验证结果显示,As合并RA的患者CCR1和IRF8的表达水平显著高于健康者。 结论]CCR1和IRF8产生的调节作用很可能是RA合并As的核心因素。
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| 关 键 词： | 动脉粥样硬化 类风湿关节炎 STAT1 CCR1 IRF8 |
| 收稿时间： | 2023/6/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/12/12 0:00:00 |
Molecular mechanism of interaction between rheumatoid arthritis and atherosclerosis based on bioinformatics |
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| PEI Jixiang,ZHOU Hongji,AN Yi.Molecular mechanism of interaction between rheumatoid arthritis and atherosclerosis based on bioinformatics[J].Chinese Journal of Arteriosclerosis,2024(3):194-202. |
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| Authors: | PEI Jixiang ZHOU Hongji AN Yi |
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| Institution: | Department of Cardiology, Affiliated Hospital of Qingdao University, Qingdao, Shangdong 266000, China;Department of Cardiology, Fushun Central Hospital, Fushun, Liaoning 113000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | atherosclerosis rheumatoid arthritis STAT1 CCR1 IRF8 |
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