通过miRNA‐TF‐mRNA调控网络揭示儿童1型糖尿病的潜在生物标志物 |
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作者姓名: | 赵威 魏广友 |
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作者单位: | 安徽理工大学,安徽理工大学亳州医学院,亳州市人民医院 |
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摘 要: | 目的 通过miRNA-TF-mRNA调控网络来预测儿童1型糖尿病(T1D)的潜在生物标志物。方法 以基因表达综合数据库(GEO)的GSE33440数据集为基因表达阵列。利用R包微阵列数据线性模型(LIMMA)识别差异表达基因(DEG)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选最重要模块,共同基因(CGs)被确定为DEG和最重要模块中的基因的交叉点;对CGs进行GO、KEGG通路富集分析;通过miRNA-TF-mRNA调控网络预测潜在生物标志物。结果 识别出51个DEG和9个重要模块;筛选出了12个CGs; CGs富集在腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路以及胰岛素受体底物2基因(IRS2);在miRNA-TF-mRNA调控网络中miR-499b-5p可靶向IRS2,通过AMPK信号通路调节儿童T1D。结论 研究揭示了miR-499b-5p/IRS2可能被视为儿童T1D的潜在治疗靶点。
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关 键 词: | 儿童 1型糖尿病 GEO数据库 miRNA-TF-mRNA 生物标志物 |
收稿时间: | 2022-10-17 |
修稿时间: | 2022-10-17 |
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