基于数据库挖掘和分子生物学探讨白藜芦醇治疗肺腺癌的作用机制 |
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引用本文: | 耿其顺,李依静,沈志博,郑园园,李砺锋,薛文华,赵杰.基于数据库挖掘和分子生物学探讨白藜芦醇治疗肺腺癌的作用机制[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(14):199-207. |
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作者姓名: | 耿其顺 李依静 沈志博 郑园园 李砺锋 薛文华 赵杰 |
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作者单位: | 郑州大学 第一附属医院,郑州 450052 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2017YFC0909900) |
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摘 要: | 目的 结合生物信息学与分子生物学探讨白藜芦治疗肺腺癌的作用机制。方法 从DrugBank获取白藜芦醇作用靶点信息,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。在TCGA数据库中分析靶标基因在肿瘤及正常组织中表达量,预示其在肿瘤发生发展中的影响。然后,运用随机森林和单因素COX回归的分析方法对靶标基因进行筛选。结合生物信息学结果,使用分子生物学探究白藜芦醇治疗肺腺癌的作用机制。结果 基于白藜芦醇作用靶点的PPI网络,筛选出10个Hub基因,其中溶质载体家族2成员1(SLC2A1),花生四烯酸5-脂氧合酶(ALOX5),过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)和花生四烯酸15-脂氧合酶(ALOX15)在肿瘤和正常组织中表达量具有显著差异。然后,随机森林和单因素COX回归分析结果表明SLC2A1对肺腺癌的生存和预后意义重大。KM-plotter生存分析结果显示SLC2A1表达量与肺癌患者的总体生存率(OS),初次进展(FP),进展后生存率(PPS)均紧密相关。分子生物学实验也进一步证明白藜芦醇能够通过降低SLC2A1表达,抑制肺腺癌细胞的增殖和迁移。免疫组化评分显示SLC2A1在肿瘤和正常组织中蛋白表达量具有显著差异。结论 白藜芦醇通过降低SLC2A1表达,抑制肺腺癌细胞的增殖和迁移,在肺腺癌的临床治疗中具有深远意义。
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关 键 词: | 白藜芦醇 肺腺癌 生物信息学 作用机制 分子生物学 |
收稿时间: | 2021/2/22 0:00:00 |
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