咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析，明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果，利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异；用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测，其中检测咽拭子标本158人次，痰液标本144人次，鼻拭子标本35人次；ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%），其次是鼻拭子标本（34.3%），咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次，2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%， N基因检出率分别为89.6%、42.4%，差异均有统计学意义（P均＜0.05），ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4），N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0），痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本；同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次，2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%，N基因检出率分别为81.8%、40.9%，差异均有统计学差异（P均＜0.05），ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4），N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0），痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本；同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次，鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本，2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%，N基因检出率分别为51.4%、34.3%，但差异均无统计学意义（P均＞0.05），一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4），因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义，但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异，即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本，在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。

Analysis of consistency and positive rate of SARS-CoV-2 nucleic acid test results in oropharyngeal swabs, nasal swabs and sputum