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肉桂和大叶清化桂内参基因的筛选和验证
引用本文:许丹芸,张辉菊,刘基柱,高弘扬,杨全.肉桂和大叶清化桂内参基因的筛选和验证[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(4):137-144.
作者姓名:许丹芸  张辉菊  刘基柱  高弘扬  杨全
作者单位:广东药科大学,广州 510000
基金项目:罗定肉桂产业发展基础研究项目(2018-082);广东省普通高校青年创新人才类项目(2019KQNCX057);广东省基础和应用基础研究基金联合基金项目(2019A1515111043)
摘    要:目的 筛选适用于肉桂和大叶清化桂不同部位进行实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)分析的稳定内参基因,为肉桂和大叶清化桂皮枝叶3个不同部位的基因表达分析提供稳定的内参基因。方法 以肉桂和大叶清化桂两种植物的皮、枝、叶等6个不同组织器官为实验材料,使用Real-time PCR技术对甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH),肌动蛋白(actin),泛素结合酶(UBE),组蛋白(histone)和微管蛋白(TUB)共5个内参基因的表达情况进行分析,进而使用3个常用的内参基因分析软件geNorm,NormFinder,BestKeeper,对候选内参基因的稳定性进行分析评价。结果 5个内参基因在2种植物的皮、枝、叶中均有表达,但稳定性存在差异,综合分析得出候选内参基因表达稳定性顺序依次为GAPDH>actin>UBE>histone>TUB。对2种植物的内参基因分别进行分析,最优内参基因依然是GAPDH,表明GAPDH是最合适的内参基因。TUB和histone在3个软件中的排名均靠后,在内参基因的筛选中应被剔除,不适合在肉桂和大叶清化桂基因表达分析中使用。结论 肉桂和大叶清化桂皮、枝、叶不同部位最适的内参基因为GAPDH,为后期开展这两种植物不同部位有效成分积累过程中基因的功能调控和表达研究提供了理论依据。

关 键 词:实时荧光定量聚合酶链式反应  肉桂  大叶清化桂  内参基因
收稿时间:2020/6/5 0:00:00
修稿时间:2020/6/5 0:00:00

Selection and Validation of Appropriate Reference Genes of Cinnamomum cassia and Cinnamomum cassia var. macrophyllum
XU Dan-yun,ZHANG Hui-ju,LIU Ji-zu,GAO Hong-yang,YANG Quan.Selection and Validation of Appropriate Reference Genes of Cinnamomum cassia and Cinnamomum cassia var. macrophyllum[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2021,27(4):137-144.
Authors:XU Dan-yun  ZHANG Hui-ju  LIU Ji-zu  GAO Hong-yang  YANG Quan
Abstract:
Keywords:quantitative real-time polymerase chain reaction  Cinnamomum cassia  C  cassia var  macrophyllum  reference gene
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