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肝炎基因诊断芯片对丙型肝炎病毒基因分型检测的初步研究
作者姓名:Zhao W  Liu W  Liu Q  Zhang L  Zhou Z  Liu X  Zhang H
作者单位:1. 南京,210003,东南大学医学院附属南京市第二医院
2. 东南大学分子与生物电子国家重点实验室
基金项目:江苏省科技厅、江苏省卫生厅重点资助项目 (BS2 0 0 0 0 2 8)
摘    要:目的 研究丙型肝炎病毒(HCV)基因分型诊断芯片的制备和其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的准确性。方法 根据丙型肝炎病毒5′端非编码区末端(5UTR)和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成浓度为50μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成丙型肝炎病毒基因分型诊断芯片,收集HCVRNA阳性的丙型肝炎患者血清60份作为实验组,健康人血清60份作为对照组,用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCVRNA定量检测,实验组血清HCVRNA含量均大于500拷贝/ml,对照组血清HCVRNA含量均小地500拷贝/ml,两组血清进行HCVRNA分离纯化,逆转录反应,巢式PCR扩增后,分别用基因芯片,HCVRNA核酸序列测定法(美国Li-Cor核酸序列测定仪)进行双盲丙型肝炎基因分型检测。结果 实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型;1b型46例,3a型3例。3b型3例,2a型2例,2b型2例,混合型1b 2a2例。1b 3b型2例;核酸序列测定分型1b型50例,3a型3例,3b型3例,2a型2例,2b型2例;基因诊断芯片检测和核酸序列测定检测的基因分型结果符合率为93.3%。对照组血清基因芯片检测匀阴性。结论 肝炎病毒基因诊断芯片可以用于检测血清HCVRNA,并进行基因诊断分型,准确率较率。

关 键 词:C型肝炎样病毒属  基因型  基因芯片  丙型肝炎  诊断
修稿时间:2002年1月16日

Genotyping of hepatitis C virus by hepatitis gene diagnosis microarray
Zhao W,Liu W,Liu Q,Zhang L,Zhou Z,Liu X,Zhang H.Genotyping of hepatitis C virus by hepatitis gene diagnosis microarray[J].National Medical Journal of China,2002,82(18):1249-1253.
Authors:Zhao Wei  Liu Wei  Liu Quanjun  Zhang Lin  Zhou Zhenxian  Liu Xinjue  Zhang Hanrong
Institution:Department of Pathology, Nanjing Second Hospital, Medical College of Southeast University, Nanjing 210003, China.
Abstract:
Keywords:Hepatitis C-Like viruses  Genotype
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