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Airway microbiota signals anabolic and catabolic remodeling in the transplanted lung
Authors:Stéphane Mouraux  Eric Bernasconi  Céline Pattaroni  Angela Koutsokera  John-David Aubert  Johanna Claustre  Christophe Pison  Pierre-Joseph Royer  Antoine Magnan  Romain Kessler  Christian Benden  Paola M. Soccal  Benjamin J. Marsland  Laurent P. Nicod
Affiliation:1. Service de Pneumologie, Centre Hospitalier Universitaire Vaudois, Lausanne, Switzerland;2. Clinique Universitaire de Pneumologie, Pôle Thorax et Vaisseaux, Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes, Grenoble, France;3. Université Grenoble Alpes, Grenoble, France;4. Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale 1055, Saint Martin d''Hèes, France;5. L''institut du Thorax, Service de Pneumologie, Centre Hospitalier Universitaire de Nantes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Nantes, Nantes, France;6. Service de Pneumologie, Nouvel Hôpital Civil, Centre Hospitalier Universitaire, Strasbourg, France;g. Division of Pulmonology, University Hospital Zurich, Zurich, Switzerland;h. Division of Pulmonary Medicine, Geneva University Hospitals, Geneva, Switzerland
Abstract:
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  • Keywords:Airway remodeling  fibroblasts  macrophages  matrix  microbiota  BAL  Bronchoalveolar lavage  CFU  Colony-forming unit  CHI3L1  Chitinase 3-like 1  CLAD  Chronic lung allograft dysfunction  COPD  Chronic obstructive pulmonary disease  GO  Gene Ontology  IGF  Insulin-like growth factor  IQR  Interquartile range  KEGG  Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes  KO  KEGG ortholog  MMP  Matrix metallopeptidase  PDGFD  Platelet-derived growth factor D  rRNA  Ribosomal RNA  SPP1  Secreted phosphoprotein 1  SysCLAD  System prediction of Chronic Lung Allograft Dysfunction  THBS1  Thrombospondin 1  THP-DM  THP1-derived macrophages
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