脓毒症患者外周血中lncRNA和miRNA表达谱及功能分析题录 |
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引用本文: | 李兴,宋春梅,卢文辉,穆根华,卢仲谦,邓义军.脓毒症患者外周血中lncRNA和miRNA表达谱及功能分析题录[J].中华急诊医学杂志,2024(1). |
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作者姓名: | 李兴 宋春梅 卢文辉 穆根华 卢仲谦 邓义军 |
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作者单位: | 1. 徐州医科大学附属盐城临床学院重症医学科;2. 盐城市第三人民医院重症医学科 |
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摘 要: | 目的本研究利用二代测序(next-generation sequencing, NGS)技术, 对脓毒症患者外周血液进行测序分析, 探讨非编码小RNA(microRNA, miRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)的差异表达及其功能网络。方法本研究采集2021年6月至9月在盐城市第一人民医院招募的重症医学科7例泌尿系统感染的脓毒症患者和3例健康职工志愿者的全血进行NGS分析, 筛选差异表达的mRNA、lncRNA和miRNA, 并对差异表达进行生物信息学分析(差异倍数FC>2, P<0.01)。本研究筛选并下载GEO数据库中4个脓毒症患者基因组数据集, 筛选共同差异表达基因, 对筛选基因进行京都基因组百科全书分析。使用Cytoscape 3.7.0进行构建miRNA-mRNA和IncRNA-miRNA-mRNA网络。结果差异表达mRNAs主要富集于炎症反应相关通路。131个差异基因显著富集在PD-1/PD-L1信号通路, 发现调控PD-1/PD-L1信号通路的TLR2、LAT和CD247等靶基因, 以及参与调控的miRNA(hsa...
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关 键 词: | 脓毒症 微小RNA 长链非编码RNA 二代测序 PD-1/PD-L1 |
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