| 珊瑚菜GlPS1、GlPS2基因克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 宋洁洁,罗红梅,马小晶,高婷.珊瑚菜GlPS1、GlPS2基因克隆及表达分析[J].中草药,2018,49(5):1139-1145. |
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| 作者姓名： | 宋洁洁 罗红梅 马小晶 高婷 |
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| 作者单位： | 青岛农业大学生命科学学院, 山东省高校植物重点实验室, 山东 青岛 266109,中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室, 北京 100193,青岛农业大学生命科学学院, 山东省高校植物重点实验室, 山东 青岛 266109,青岛农业大学生命科学学院, 山东省高校植物重点实验室, 山东 青岛 266109;上海市资源植物功能基因组学重点实验室(上海辰山植物园), 上海 201602 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目（31500230）；上海市资源植物功能基因组学重点实验室开放课题（PFGR20170）；山东省青岛市青年教师成长计划经费资助项目 |
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| 摘 要： | 目的克隆珊瑚菜Glehnia littoralis补骨脂素合成酶(psoralen synthase,PS)基因全长cDNA序列,并进行生物信息学和表达量分析。方法在前期珊瑚菜转录组测序的基础上,筛选出表达量较高的2条PS基因GlPS1和GlPS2序列。利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法对2个基因cDNA序列3’端进行克隆,DNAMAN拼接后得到基因全长cDNA序列,并对其编码蛋白进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测GlPS1和GlPS2基因的组织特异性表达。结果 GlPS1和GlPS2基因cDNA序列全长分别为1 885 bp和1 971 bp,编码495和502个氨基酸残基,蛋白相对分子质量分别为55 740.7和56 363.9,等电点为8.28和6.62,均属于细胞色素P450超家族,含有1个跨膜区,为亲水性蛋白。系统进化分析表明,GlPS1和GlPS2与伞形科欧防风Pastinaca sativa、旱芹Apium graveolens、大阿米芹Ammi majus PS蛋白亲缘关系较近。RT-qPCR结果显示GlPS1基因在根中表达量较高,在叶中表达量较低,而GlPS2基因在花中表达量较高,在根中表达量较低。结论首次获得珊瑚菜GlPS1和GlPS2基因的全长cDNA序列并进行了表达分析,为进一步开展珊瑚菜补骨脂素合成酶基因的功能和遗传调控机制研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 珊瑚菜 补骨脂素合成酶 RACE 生物信息学分析 组织特异性表达 |
| 收稿时间： | 2017/8/9 0:00:00 |
Cloning and expression analysis of GlPS1, GlPS2 gene in Glehnia littoralis |
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| SONG Jie-jie,LUO Hong-mei,MA Xiao-jing and GAO Ting.Cloning and expression analysis of GlPS1, GlPS2 gene in Glehnia littoralis[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2018,49(5):1139-1145. |
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| Authors: | SONG Jie-jie LUO Hong-mei MA Xiao-jing and GAO Ting |
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| Institution: | Key Laboratory of Plant Biotechnology in Universities of Shandong Province, College of Life Sciences, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China,Key Laboratory of Bioactive Substances and Resources Utilization of Chinese Herbal Medicine, Ministry of Education, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & amp;Peking Union Medical College, Beijing 100193, China,Key Laboratory of Plant Biotechnology in Universities of Shandong Province, College of Life Sciences, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China and Key Laboratory of Plant Biotechnology in Universities of Shandong Province, College of Life Sciences, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China;Shanghai Key Laboratory of Plant Functional Genomics and Resources(Shanghai Chenshan Botanical Garden), Shanghai 201602, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Glehnia littoralis Fr Schmidt ex Miq psoralen synthase RACE bioinformatics analysis tissue specific expression |
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