miR-106b-25基因簇在肝泡型包虫病肝组织中的表达及意义

目的 检测肝泡型包虫病肝组织中miR-106b-25基因簇(miR-106b、miR-93、miR-25)的表达水平,分析3者在肝纤维化进程中的作用及其相互关系。方法 将20例经手术治疗的肝泡型包虫病肝组织匹配后分为病灶旁肝组织和正常肝组织,RT-PCR技术检测miR-106b-25基因簇的表达水平。HE和Masson染色观察病理变化与纤维化程度。结果 病灶旁肝组织纤维化程度高于正常肝组织;miR-106b-25基因簇在病灶旁肝组织的表达量均高于正常肝组织;miR-106b-25基因簇表达量与肝纤维化程度呈正相关;随着纤维化程度加重,miR-106b-25基因簇各成员的表达量也增加;3种miRNA之间表达呈正相关。结论 泡型包虫病病灶旁肝组织比正常肝组织纤维化程度严重,miR-106b-25基因簇参与肝泡型包虫病致肝纤维化。     

椎管内神经鞘瘤中miR-17-92基因簇表达及意义

目的探讨椎管内神经鞘瘤中微小RNA(miR)-17-92基因簇的表达及意义。方法收集20例经术后病理证实的椎管内神经鞘瘤组织标本(实验组)和部分正常神经组织(对照组)。提取两组标本RNA后进行cDNA合成及实时荧光定量聚合酶链反应,采用相对定量法测定组织中miR-17-92基因簇的表达水平,用2~(-ΔΔCt)表示。比较分析实验组miR-17-92基因簇的表达水平与患者年龄、肿瘤大小的相关性。结果对照组miR-17-92基因簇表达水平(1.414±0.152)显著高于实验组(1.048±0.168,t=3.582,P0.05)。miR-17-92基因簇表达水平与肿瘤直径、患者年龄并无明显相关性(P0.05)。结论 miR-17-92基因簇在椎管内神经鞘瘤中的表达高于正常神经,提示该基因簇可能参与了椎管内神经鞘瘤的发生、发展,但具体作用机制还需进一步探索。     

激活沉默基因簇发掘微生物次级代谢产物的研究进展

<正>天然产物是指动物、植物、昆虫、海洋生物和微生物体内的组成成分或其代谢产物以及人和动物体内许许多多内源性的化学成分的总称。在医药产业,天然产物已是新药的重要来源之一,新的化学单体中,40%以上都由天然产物衍生而来,而天然产物多数是由微生物的次级代谢过程产生[1]。自20世纪70年代以来,尽管人们对治疗传染性疾病和癌症的药物需求越来越多,但是,发现新的活性天然产     

海洋青铜小单孢菌FIM 02-523全基因组测序及分析

青铜小单孢菌(Micromonospora chalcea, M. chalcea)FIM 02-523能够合成对乏氧肿瘤细胞、艰难梭菌等具有活性的环脂肽类化合物rakicidins。利用Illumina HiSeq高通量测序平台,本研究首次对M. chalcea FIM 02-523进行全基因组测序,得到总长约6.74Mb的序列信息。分析表明基因组GC含量为72.89%,包含了6167个蛋白编码序列。利用AntiSMASH预测基因组中存在19个生物合成基因簇。结合PKS/NRPS生物合成特征和rakicidins化学结构特点,定位到了rakicidins的生物合成基因簇,并初步推测其生物合成途径。研究为M. chalcea FIM 02-523的功能基因组学研究和代谢调控提供了理论基础。     

海洋芽孢杆菌B-9987中macrolactin生物合成基因簇分析及反式酰基转移酶高表达

目的 对海洋芽孢杆菌B-9987中macrolactin生物合成基因簇及其关键基因进行分析、鉴定及功能研究。方法 通过生物信息学手段对基因簇的基因组成和功能结构域进行了分析;构建了用于酰基转移酶基因高表达的大肠杆菌—芽孢杆菌穿梭载体,采用电击转化方法导入B-9987之中进行高表达。 结果 macrolactins是由位于同一个操纵子的8个基因bmmA-I所编码的反式酰基转移酶聚酮合酶体系组装而成,反式酰基转移酶(trans-acyltransferase,trans-AT)BmmA的高表达使macrolactin A的产量提高了约0.6倍。结论 macrolactin生物合成基因簇在具有生物防治活性的芽孢杆菌中普遍存在,且高度保守;反式酰基转移酶的高表达能够增加macrolactin A的产量。     

LncRNA HOTTIP调节miR-615/IGF2分子轴促进肺癌细胞增殖和侵袭的实验研究

目的 探讨长链非编码RNA同源异型基因簇A远端转录本(lncRNA HOTTIP)对肺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及可能机制.方法 体外培养A549细胞,构建HOTTIP敲降载体、miR-615 inhibitor转染A549细胞,分为空白对照组、阴性对照组、HOTTIP shRNA组、HOTTIP shRNA+无序序...     

miR-20a在妇科常见恶性肿瘤中的作用机制

宫颈癌、子宫内膜癌及卵巢癌作为妇科最常见的三大恶性肿瘤,其发病率近年来在各年龄段中呈上升趋势,已严重威胁我国女性健康。尽管多种靶向药物的应用已使该类患者的生存期明显延长,但其仍是一类无法被精准诊断和治疗的疾病。miR-17-92基因簇作为最早被确定为癌基因的微小RNA(micro RNA,miRNA)家族,其作用机制一直被广泛关注。miR-20a是miR-17-92基因簇中的一员,可通过降低或上调表达的方式发挥转录后调控功能,进而影响下游基因通路,调控恶性肿瘤细胞的增殖、侵袭及转移,并最终实现恶性肿瘤的发生及进展。根据目前研究进展,miR-20a在宫颈癌、子宫内膜癌及卵巢癌中表达特异性升高通常与疾病的恶性进展有关,综述miR-20a在妇科常见三大恶性肿瘤发病机制中作用的最新研究。     

多不饱和脂肪酸代谢与动脉粥样硬化的关系

动脉粥样硬化是多因素共同作用引起的,其发病机制复杂,目前尚未完全阐明。多不饱和脂肪酸作为脂肪酸家族中的一员,是哺乳动物生长发育的关键营养物质,其摄入种类和摄入量以及脂肪酸去饱和酶均能影响动脉粥样硬化性疾病的进程。脂肪酸去饱和酶基因簇能够调控脂肪酸去饱和酶的活性并进一步影响动脉粥样硬化。基于代谢和遗传学的观点,本文综述了多不饱和脂肪酸在脂肪酸去饱和酶的调节下对动脉粥样硬化影响的研究进展,并总结了脂肪酸去饱和酶基因簇变异与动脉粥样硬化性心血管疾病之间的关系。     

miR-144/451基因簇在肿瘤组织中对相关基因调控概述

微RNA(microRNAs,miRNA)是真核生物中广泛存在的一种内生的小RNA分子,在基因表达、细胞周期、生物体发育时序调控等多方面发挥重要作用。在肿瘤中,miRNA参与调控肿瘤细胞的增殖、凋亡和自噬等过程。miR-144/451基因簇在多种肿瘤组织中低表达,然而其在肿瘤组织中的调控情况还不清楚。本实验室构建了转染空表达载体和过表达miR-451载体的HCT116稳转细胞株的抑制消减杂交文库,从文库中筛选得到B细胞受体相关蛋白31、真核翻译延伸因子1A1、细胞分裂周期蛋白20等基因。本文将对这些受miR144/451调控的基因和其可能参与的调控网络进行阐述。     

5′HOXD基因与单纯性马蹄内翻足的相关性分析

目的检测HOXD10、HOXD12、HOXD13基因内4个已知单核苷酸多态(single nucleotide poly-morphisms,SNP)rs2593778、rs847154、rs847151、rs13392701在单纯性马蹄内翻足核心家系中的分布情况,分析各个SNP位点及所构成单倍型与单纯性马蹄内翻足的相关性。方法应用限制性片段长度多态性技术结合测序,分析84个单纯性马蹄内翻足核心家系4个SNP位点基因型;应用ETDT软件统计分析各SNP位点基因型与单纯性马蹄内翻足的相关性;应用TRANSMIT软件构建单倍型并统计分析单倍型频率是否存在差异。结果位于HOXD12基因5′侧翼序列的SNP位点rs847154和位于HOXD13第1外显子的SNP位点rs13392701在单纯性马蹄内翻核心家系中存在传递不平衡(P<0.05);位于HOXD12基因第1外显子的SNP位点rs847151未检测到多态;位于HOXD10第1外显子的SNP位点rs2593778经ETDT分析无统计学意义。结论HOXD12基因5′侧翼序列的SNP位点rs847154和位于HOXD13第1外显子的SNP位点rs13392701与单纯性先天性马蹄内翻足有明显的相关性,提示HOXD12、HOXD13可能是单纯性马蹄内翻足重要的易感基因。