基于TCGA 数据库卵巢癌患者的miR-301b 表达量与生存状况生物信息学分析

目的 研究肿瘤基因图谱（the cancer genome atlas，TCGA）数据库中microRNA-301b（miR-301b）在478 例卵巢癌患者中的表达量与卵巢癌患者生存状况的关系。方法 对TCGA 数据库中478 例卵巢癌患者的miR-301b 表达量与生存状况进行分析，预测其靶基因及生物学活性。结果 miR-301b 高表达患者具有更长的生存时间, 是卵巢癌患者预后的保护因素（OS:P<0.001, DFS:P<0.05），综合3 个靶基因数据库的预测结果得到12 个靶基因，编码的蛋白多数与肿瘤的发生发展有关，其中靶基因TEA 结构域家族成员1（TEA domain family member 1，TEAD1） 与胞质多糖基化元件结合蛋白4(cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, CPEB4)的表达量与卵巢癌患者的预后相关（TEAD1:P<0.05，CPEB4:P<0.05）。结论 miR-301b 表达对卵巢癌患者的预后具有重要的意义，表现出抑癌因子的作用，对卵巢癌的预后评估和治疗具有重要的指导意义。     

DNA测序建立甘肃当归、大黄种子rRNA基因图谱的研究

目的：对甘肃地道性中药材当归、大黄种子中rRNA基因内转录间隔区进行碱基序列测定，以期建立从分子水平对中草药种子进行鉴定的一种新方法。方法：提取当归、大黄种子中核DNA，利用特异性引物对其rRNA基因内转录间隔区进行套式PCR扩增，并将扩增产物进行碱基序列测定。结果：经琼脂糖凝胶电泳证实：以上述方法可获得当归、大黄种子DNA中rRNA基因内转录间隔区PCR扩增产物；并经测序后得到了当归、大黄种子rRNA基因内转录间隔区的碱基序列，且具有明显的差异和可对比性。结论：不同植物性中药材种子rRNA基因内转录间隔区碱基序列可做为从分子水平进行鉴定的标记。     

基因检测预知未来健康

传统体检主要针对人体已经出现的临床病变进行诊断和检查,其任务是配合疾病的治疗,而疾病易感基因检测的目的是预防疾病,尽量让本来要生病的人不生病。在上海复旦生物科技的实验室里,科学家们通过一滴血,用高倍显微镜将人的细胞打开,细胞内有一个格室,名曰细胞核,里面包含着人的染色体,而基因就像项链上的明珠,一颗颗排列在染色体上。科学家根据对基因图谱点位的分析,就能发现隐藏在人体深处的遗传易感基因,而这就是引发重大疾病的原因。疾病易感基因检测能在发病前找到这些隐藏的基因地雷,能让人对自己可能发生的疾病进行预防,可以寻求自己…     

自杀未遂危险因素的配对病例对照研究

目的了解汉族人群自杀未遂的环境危险因素、儿茶酚胺-氧位-甲基转移酶(COMT)158／108基因多态性与自杀未遂有无关联。方法采用配对的病例对照研究，对205例自杀未遂者(男性89例、女性116例)与相应对照(与病例同性别、年龄相差3岁以内、同地区)进行COMT158／108基因型测定、环境因素与自杀未遂的关系研究。结果病例组与对照组在COMT基因型、基因频率上差别无统计学意义；多因素条件logistic回归模型分析显示，COMT158／108Val／Val、文化程度低、吸烟、情感冲突、精神障碍、抑郁皆为自杀未遂的危险因素，OR值分别为2．43(95％CI：1．10～5．40)、5．70(95％CI：1．88～17．27)、3．54(95％CI：1．02～12．36)、10．96(95％CI：4．74～25．34)、6．35(95％CI：1．68～24．05)、11．30(95％Ci：4．58～27．89)；且因素间无相乘模型一级交互作用。结论研究表明，文化程度低、吸烟、情感冲突、精神障碍、抑郁为自杀未遂的危险因素；支持COMT158／108Val／val为自杀未遂的易感基因型。并提示基因图谱上116bp片段可能与COMT高活性相关。     

FGFR4在结直肠癌组织中表达及其对SW620细胞生物学功能的影响

目的 探究成纤维细胞生长因子受体4(fibroblast growth factor receptor 4,FGFR4)在结直肠癌组织中的表达情况及其对SW620细胞生物学功能的影响。方法 利用癌症基因图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中结直肠癌的数据分析FGFR4 mRNA在结直肠癌组织中的表达。使用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)进行生物信息学分析寻找FGFR4影响的相关信号通路。构建pcDNA3.1-FGFR4过表达载体，分为实验组与对照组。分别采用细胞计数试剂盒8(cell counting kit-8,CCK-8)实验、流式细胞凋亡检测、细胞划痕实验和Transwell实验检测过表达FGFR4对SW620细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响。结果 TCGA数据库数据分析结果显示FGFR4 mRNA在结直肠癌中的表达高于癌旁组织(P<0.05),GSEA结果显示FGFR4高表达在碱基切除修复、谷胱甘肽代谢、磷酸戊糖途径、核糖核酸聚合酶、硒氨酸代谢等通路富集(P<0.05)。C...     

抗衰老,只是一个传说

《桃姐》带热抗衰老话题电影《桃姐》反映老人院生活的片段让人难忘,当片中一群老人机械地张着嘴巴,护工挨个喂饭过去的场景出现,许多观众欷歔不已。人口老龄化是一个全球性的问题,中国也不例外。按照人口学家的预测,     

单核苷酸多态性与疾病易感性

连锁分析方法的发现给基因研究带来巨大进展 .任何易感基因的探测都应被已知基因组学图谱的基因标记 .研究人员必须建立一张包含有数百对作为标记物基因的基因图谱 .在随后发现的更精确的标记物包括Alps(限制断片长度多态性 ) ,Vntrs(变数串联重复体 )和最近发现的Snps(单核苷酸多态性 ) .将来 ,更多数量更有价值的基因标记物在不断发现 .同时 ,遗传流行病学已发展新的更有效的统计学方法和生物信息处理工具来分析基因数据 ,这些先进的研究方法的高效率在以往是不能想像的 .这能让我们从有限的研究对象中得到更多的有用数据 .将来 ,可望基…     

生物芯片

生物芯片是世纪之交迅速发展起来的一项分子生物学新技术 ,因具有与芯片相似的微型化和大规模分析、处理生物信息的特点而得名 ,它能在一块或若干块芯片上完成生物样品的分离、制备及生化反应的进行如核酸产物的分离、杂交以及ＰＣＲ等诸多生物学过程 ,显示出快速、高效率、高通量处理生物学信息的能力[1 ] 。1　生物芯片的概念生物芯片技术的发展最初得益于Ｓｏｕｔｈｅｒｎ提出的核酸杂交理论 ,即标记的核酸分子能与被固化的、与之互补配对的核酸分子杂交。 1 989年 ,Ｓｏｕｔｈｅｒｎ提出了利用在玻片表面固定的寡核苷酸探针杂交进行基因…