氯化镉诱发16HBE细胞系恶性转化过程中TIF3 p36的变化

目的 探讨氯化镉诱发人支气管上皮细胞（16HBE）恶性转化过程中不同阶段蛋白翻译起始因子（TIF3）p36 mRNA表达水平的变化,为进一步阐明氯化镉的分子致癌机制提供线索.方法 应用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）技术,以及敏感先进的Taqman荧光定量PCR方法,检测并分析氯化镉诱发16HBE恶性转化不同阶段即转化期间细胞、转化细胞和成瘤细胞的TIF3 p36 mRNA表达量的变化.结果 相对于非转化对照细胞（16HBE）,氯化镉诱发恶性转化不同阶段细胞（转化期间细胞、转化细胞和成瘤细胞）的TIF3 p36 mRNA基因表达水平均明显升高（P＜0.01或P＜0.05）,其中低剂量组（5 μmol/L）所转化的各阶段细胞的eIF3 p36 mRNA平均表达量分别是对照细胞的3.1、5.9和9.9倍,中剂量组（10 μmol/L）的各阶段转化细胞的TIF3平均表达量分别是对照细胞的7.1、6.8和14.8倍,高剂量组（15 μmol/L）的各阶段转化细胞的TIF3 p36平均表达量分别是对照细胞的3.6、3.0和9.1倍.这些不同剂量组的研究结果提示,eIF3 p36的异常表达量与氯化镉诱发16HBE细胞恶变程度之间有正相关关系,但与镉的剂量无关.结论 氯化镉在诱发16HBE细胞恶变过程中,存在明显的蛋白翻译启动因子eIF3 p36异常表达现象,其表达水平与细胞的恶变程度密切相关,这可能是氯化镉诱发人细胞肿瘤的重要分子致癌机制之一.     

登革病毒Taqman双重荧光PCR分型研究

目的建立鉴定登革病毒型别的双重实时Taqman PCR反应体系,以准确快速鉴定登革病毒型别。方法根据GenBank上已发表的登革病毒四个型别的全基因序列,进行对比分析,分别设计登革病毒的四个型别引物和探针,登革I、III型探针用FAM-TAMARA标记,登革II、IV型探针用JOE-TAMARA标记。经过条件优化后,建立检测登革病毒I/II型和III/IV型的两套双重实时荧光RT-PCR方法,扩增四型登革病毒RNA、登革病毒阴性样本和登革病毒RNA稀释样本,检测方法的特异性、重复性和检测限性。结果通过设计筛选序列和优化反应条件,建立登革病毒I、II型和登革病毒III、IV型的双重荧光PCR反应体系,通过试验证明,所建立的方法具有良好的特异性、重复性和检测限性,能准确快速地对登革病毒进行分型。结论建立了一种快速双重荧光PCR方法能同时对登革病毒进行分型和鉴定。     

实时荧光PCR快速检测粪便中艰难梭菌方法

目的:建立实时荧光PCR快速检测艰难梭菌的方法。方法:以艰难梭菌磷酸丙糖异构酶(tpi)基因的保守序列为模板设计和合成特异性引物和荧光标记探针,建立实时荧光PCR检测体系,通过检测含有艰难梭菌标准菌株浓度为106-10 CFU/ml的细菌培养物及加标模拟样本进行敏感性分析,并对其特异性和干扰性进行评价。结果:该方法只对艰难梭菌进行特异性扩增,其他常见的病原菌均不能扩增;整个检测过程只需要2 h,对艰难梭菌菌悬液可检测至10 CFU/ml细菌,对加标粪便样本可检测至1000 CFU/ml细菌。结论:本研究建立的实时荧光PCR检测艰难梭菌方法具有快速、特异、敏感性高等优点,能实现对艰难梭菌的快速检测。     

脊髓灰质炎病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的 建立及应用

摘要:目的　在省级脊髓灰质炎（脊灰）实验室建立一种快速、灵敏、准确的脊灰病毒（Poliovirus,PV）型内鉴定（Intratypic Differentiation,ITD）及基因型鉴定的方法。方法　以PV衣壳蛋白（Capsid Protein）VP1编码区基因序列为目标,设计并合成引物和 Taqman 探针,建立实时荧光定量RT-PCR（Real-time RT-PCR,rRT-PCR）检测体系,并考察该方法的重复性、灵敏性和特异性。结果　该方法能快速、灵敏地鉴定出PV血清型及毒株类型,在1.0×108 copies/μl～1.0×103 copies/μl检测范围之间有良好的线性关系,相关系数为0.993,最低检测限为103.5CCID50/0.1 ml。结论　成功在省级实验室建立了PV的r RT-PCR检测技术,该技术特异性强,敏感性高,操作简便快速,适用于PV的型内鉴定和基因型鉴定,可应用于实验室诊断,为免疫策略快速提供依据。     

Taqman实时定量PCR检测产毒艰难梭菌方法的建立

目的 建立以毒素基因A/B为靶基因的产毒艰难梭菌的快速定量检测方法.方法 通过设计艰难梭菌毒素A/B基因的特异引物及探针,建立标准产毒菌株DNA(ng)含量与Ct值的标准曲线.结果 该方法仅对产毒艰难梭菌进行特异性扩增,11种其他常见的致病菌及非产毒艰难梭菌均不能扩增; tcdA和tcdB基因扩增标准曲线线性关系R值分别为0.9975、0.9984,检测低限均为2.5×10-3ng.结论 该研究建立的方法具有快速、灵敏、特异性高等优点,可用于艰难梭菌毒素基因的定量检测.     

实时荧光定量PCR标准品的制备及应用

目的探讨并建立快速而准确用于实时荧光定量PCR标准品的方法.方法通过培养细胞,提取总RNA并逆转录为cDNA后做PCR,电泳,胶回收,T-A克隆,测序后,大量提取质粒,送公司定量.结果获得了预期希望的质粒.结论该方法能大量制备质粒标准品,在实验中取得较满意的效果.     

Gene and protein expression of protease-activated receptor 2 in structural and inflammatory cells in the nasal mucosa in seasonal allergic rhinitis

BACKGROUND: Protease-activated receptor 2 (PAR 2) has been shown to be responsible for trypsin and mast cell tryptase-induced airway inflammation. Here, the present study aimed to explore the expression of PAR 2 in the nasal mucosa of seasonal allergic rhinitis (SAR). METHODS: Study subjects were recruited for the study by medical history, physical examination and laboratory screening tests. Using immunohistochemistry, laser-assisted cell picking and subsequently real-time PCR, nasal mucosa biopsies of SAR patients were investigated for PAR 2 gene and protein expression in complex tissues of the nasal mucosa. RESULTS: Gene and protein expression of PAR 2 was firstly detected in nasal mucosa of SAR patients. The relative gene expression level of PAR 2 was significantly increased in complex tissues of the nasal mucosa of SAR (6.21+/-4.02 vs. controls: 1.38+/-0.86, P=0.004). Moreover, PAR 2 mRNA expression in epithelial cells (SAR: 4.78+/-4.64 vs. controls: 0.84+/-0.61, P=0.003) but not in mucus (SAR: 1.51+/-1.15 vs. controls: 1.35+/-1.02, P=0.78) and endothelial cells (SAR: 1.20+/-0.57 vs. controls: 1.73+/-1.30, P=0.5) was found to be significantly changed in the nasal mucosa in SAR. Using double immunohistochemistry the present study demonstrated that the total numbers of mast cells (P=0.0003) and eosinophils (P=0.03) and the numbers of eosinophils expressing PAR 2 (P=0.006) were significantly elevated in the nasal mucosa of SAR compared with the controls. CONCLUSION: The abundant presence and distribution of gene and protein expression of PAR 2 in different cell types in the nasal mucosa under normal situation, the increased expression of PAR 2 in epithelial cells and the increased number of eosinophils with PAR 2 suggest that PAR 2 may contribute to the pathogenesis of allergic diseases such as SAR.     

两种实时定量PCR方法检测系统性红斑狼疮患者DNA甲基化状态的比较研究

目的:应用两种不同方法检测系统性红斑狼疮(SLE)患者CD4~+T细胞p16基因甲基化状态,比较两种检测方法的差异。方法:采用以Taqman探针为基础的MSP法(方法1)和以SYBR Green Ⅰ为基础的MSP法(方法2)分别检测40例SLE患者和20例正常人CD4~+T细胞中p16基因启动子区甲基化状态。结果:Taqman探针方法的结果为:SLE患者CD4~+T细胞p16基因甲基化阳性率(35.7%,10/28)高于对照组(10%,2/20),两者比较差异有统计学意义(x~2=4.11,P0.05)。SYBR Green Ⅰ方法的结果为:患者组和对照组的CD4~+T细胞的p16基因均呈高甲基化状态,应用t检验分析发现P0.05,二者无统计学差异。结论:Taqman探针法消除了引物二聚体和非特异性扩增对试验结果的影响,提高了结果的特异性和准确性,被证明是进行DNA甲基化状态检测的可靠方法。