HCV HVR1准种在不同基因型丙型肝炎患者中的分布

目的:通过研究丙型肝炎病毒高变区1(HCV HVR1)准种复杂性与基因型之间的关系,探讨不同基因型HCV致病性差异的机制.方法:采用C区型特异性引物PCR法进行HCV基因分型,采用单链构象多态性聚合酶链反应法(SSCP法)检测HCV HVR1准种.结果:68例丙型肝炎患者中,Ⅱ型49例(72%),Ⅲ型13例(19%),Ⅱ、Ⅲ混合型6例(9%).Ⅱ型和Ⅱ、Ⅲ混合型HCV感染患者的HCV HVR1准种复杂性(SSCP条带数)明显高于Ⅲ型感染的患者,且与疾病严重程度关系密切.结论:HCV HVR1准种复杂性的差异可能是导致不同基因型HCV致病性差异的因素之一.     

早期HIV-1感染env基因的动态变异研究

目的 追踪观察HIV-1新发感染者体内CRF07_BC重组毒株膜蛋白基因的变异性.方法 从HIV-1感染者血浆中提取总RNA,通过逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)获得HIV-1 gp120全长及C2-C5区段基因.纯化后装入T载体,转化至Top10大肠埃希菌内增殖,通过蓝白斑筛选获得阳性克隆,运用PCR方法进行鉴定,最后对所获得的目的克隆测序.结果从两个感染者血浆样品中获得感染后半年到2年半间多个时间点的gp120基因克隆共135个及gp120基因C2-C5区段克隆15个,分析显示这些克隆均为HIV-1 CRF07_BC亚型.随感染时间的延长,HIV-1 env基因的离散率与多样性均有增加的趋势.env基因同义突变与非同义突变比较结果显示,C1、C3与V4区段非同义突变比率比gp120基因的其他区域都高.基因多态性分析的结果显示,同一时间点内不同毒株基因在不同区段的变异是不同的,基因多样性介于0与0.066±0.028之间.结论 随着患者感染时间的推移,HIV-1膜蛋白基因的变异逐渐增大.C1、C3和V4区的高突变率提示,该基因区可能是HIV-1病毒生存与宿主免疫压力相互作用的主要位点.     

HIV-1准种的变化与疾病进展关系的研究

目的　研究HIV 1准种的变化对疾病进展的影响。方法　PCR方法扩增HIV 1V3～V5区片段 ,采用HMA(异源双链泳动分析 )的方法分析 4 8例HIV/AIDS准种的变化 ,并结合HIV/AIDSCD4 T淋巴细胞计数及病毒载量的结果分析HIV 1准种的变化对疾病进程的影响。结果　在不同的疾病状态下 ,体内病毒变异是不相同的 ,在体内CD4 T淋巴细胞计数较高 ,血浆病毒载量低的个体内 ,病毒毒株有很强的变异特征 ,体内具有很高的准种复杂度 ;而在CD4 细胞数很低 ,病毒载量较高的个体 ,病毒基因变异较少 ,病毒准种较为单一。结论　HIV 1准种的变化与疾病进展相关。     

HCV准种复杂性与干扰素疗效关系的初步探讨

目的　探讨丙型肝炎病毒 (HCV) 1b型患者HVR1 ,NS5A区准种复杂性与干扰素疗效的关系。方法　应用单链构象多态性聚合酶链反应 (SSCP)法检测慢性丙型肝炎患者干扰素治疗前后HCV准种的动态变化。结果　治疗前HCVHVR1准种的SSCP条带数 (复杂性 )≤ 3者在经干扰素治疗后HCVRNA阴转率为 71 .4 3% ,>3者HCVRNA阴转率为 1 5 .38% ,两者相比 ,差异有显著性 (P <0 .0 5 ) ;治疗有效组SSCP条带数为 2 .4 3± 0 .98( x±s) ,无效组为 4 .4 6± 0 .88,两者相比 ,差异亦具显著性 (P <0 .0 1 )。而NS5A区SSCP条带数则无差异。结论　HCV1b型慢性丙型肝炎患者HVR1区准种的复杂性与干扰素疗效有关 ;而NS5A区准种的复杂性与干扰素疗效无关。     

HBV准种与耐药相关性进展

准种是指同种遗传差异性的概念,HBV复制途径一个有错误倾向的逆转录酶,潜在产生药物耐药准种。药物耐药与肝内病毒变异有关,而HBV准种产生与抗病毒治疗相关。因此,对使用核苷/核苷类药物治疗产生耐药的患者进行准种检测具有一定的临床意义。本文就HBV准种与耐药相关性进展作一概述。     

对阿德福韦酯不完全应答的慢性乙型肝炎患者在接受替诺福韦联合恩曲他滨治疗与单独替诺福韦治疗具有类似的病毒准种演变

<正>【据《J Hepatol》2013年10月报道】题:对阿德福韦酯不完全应答的慢性乙型肝炎患者在接受替诺福韦联合恩曲他滨治疗与单独替诺福韦治疗具有类似的病毒准种演变(作者Lavocat F等)体外试验表明,阿德福韦酯耐药后诱导替诺福韦交叉耐药率较低。比较对阿德福韦酯不完全应答患者,其单独应用替诺福韦以及应用替诺福韦联合恩曲他滨,两者之间的病毒动力学、核苷类似物耐药突变位点及准种演变。里昂肿瘤学研究中心Lavocat F等人通过随机双盲对阿德福韦酯不完全应答的慢性乙型肝炎患者分为2组,1组替诺福韦治     

不同感染状态下乙型肝炎病毒反转录酶区准种异质性特点及其临床意义

目的 研究乙型肝炎病毒(HBV)感染不同状态下血清病毒反转录酶(RT)区准种异质性特点及临床意义。方法 纳入2019年1月—2021年6月本院就诊治疗的24例患者为研究对象,其中慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者12例和慢加急性肝衰竭(ACLF)患者12例,留取2组患者抗病毒治疗前血清标本,比较2组患者抗病毒治疗前准种异质性差异点,采用Pearson相关性分析准种异质性与HBV DNA病毒载量、基因型的相关性。结果 ACLF患者的准种复杂度(包括核苷酸水平、氨基酸水平)和准种多样性(平均遗传距离、平均同义替换数、平均非同义替换位数)均高于CHB患者,差异有统计学意义(P <0.001)。ACLF组B基因型患者准种平均遗传距离核苷酸水平、平均同义替换数、平均非同义替换数高于C基因型患者,差异有统计学意义(P <0.05)。B基因型患者准种复杂度核苷酸水平高于C基因型患者异有统计学意义(P <0.05),准种复杂度氨基酸水平与C基因型患者比较,差异无统计学意义(P> 0.05)。CHB组患者平均遗传距离的氨基酸水平、复杂度的氨基酸水平与HBV DNA有相关性(r值分别...     

慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究

一、资料与方法1.血清来源和ＤＮＡ分离 :血清来源 :其一为乙型肝炎肝硬化患者 ,其二为病毒性肝炎患者 ,均为女性 ,临床检测ＨＢｓＡｇ、ＨＢｅＡｇ、抗 ＨＢｃ阳性。其他肝炎病毒标志检测阴性。静脉采血 5ｍｌ,提取血清中的ＤＮＡ。2 .ＰＣＲ扩增目的片段 :以Ｇａｎ等[1] 发表的序列为依据 ,参照其他ａｄｒ亚型[2 4 ] 的基因序列设计引物。ＰＣＲ扩增产物 ,按ＴＡ克隆方法亚克隆目的片段。3 .重组质粒提取和限制片段长度多态性 (ＲＦＬＰ) :将所有阳性菌落重新划线增殖后 ,提取质粒 ,ＥｃｏＲＩ酶切质粒 ,以观察酶切片段长度多态性。4.Ｄ…     

急性乙型肝炎患者血清中乙型肝炎病毒序列的研究

目的:研究急性乙型肝炎患者血清中乙型肝炎病毒序列。方法:提取急性乙型肝炎患者血清中HBV DNA,扩增其表面抗原序列,测序并相互比较。结果:测定5例急性乙型肝炎患者血清中乙型肝炎病毒均为adw亚型,其中3例同源性>99%。结论:adw亚型HBV感染后较多为急性病变,由于病毒变异少,机体有可能清除HBV。