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何海  郭继云  马毅平  周梦春  王沫  舒少华 《中草药》2015,46(23):3558-3563
目的分析茯苓转录组中简单重复序列(SSR)信息,以及含SSR的基因功能,为开发茯苓新型分子标记奠定基础。方法利用MISA软件搜索转录组Unigene及基因组scaffold中SSR,对含SSR的Unigene使用Blast X比对nr及KEGG数据库,注释其功能,并聚类分析。结果在转录组序列中发现4.57%的Unigene序列含有2 075个SSR,平均17 010条Unigene出现1个SSR,SSR的平均长度19.59 bp;而基因组中SSR的平均密度54.00个/Mb,平均长度20.74 bp。在转录组中发现的241种碱基重复模式中,以(CG/CG)n比例最高(10.97%);以六核苷酸类重复数量最多(35.64%),以(ACCACG/CGTGGT)14最长(84 bp)。在1 887条含SSR的Unigene中,115条能被基因本体(GO)分类注释到细胞代谢进程、核酸结合等;1 223条Unigene能被注释到219个KEGG通路图中,其中314条注释到新陈代谢,297条注释到遗传信息处理。结论茯苓转录组SSR的类型丰富、多态性潜能较高,关联功能相关基因的SSR开发对茯苓目的性状的分子标记辅助育种具有巨大潜力。  相似文献   
2.
目的:总结我国南方区域半夏生态种植模式,为提高半夏药材质量,减轻环境污染,保障临床用药安全提供新的种植模式。方法:在收集半夏种植历史、技术及模式的基础上,结合理论研究成果,进行种植模式的整理、技术的集成及原理的总结。结果:整理归纳了半夏一种多收的种植模式,并分析探讨了其特点和原理。结论:半夏一种多收模式充分利用生态学原理,根据半夏生长、繁殖特点及对环境条件的要求,运用农业生产技术,合理调配半夏田间生态因子,在实现半夏优质、高产目的的同时,减少农药、化肥等的使用,达到节本、增收、环保的目的。  相似文献   
3.
目的 总结归纳蕲春县蕲艾新型种植模式及其技术要点。方法 通过实地调研和课题组在蕲艾种植方面的相关研究总结,对蕲春县蕲艾传统种植方式进行改进和修正,并采用新的种植模式在蕲春县进行示范推广,探讨该种植模式的可行性。结果 总结出蕲春县蕲艾“五改两促”的新型种植模式,其核心技术包括改春种为秋(冬)种、改栽苗为植根(根状茎)、改宽畦为窄垄、改化肥为配施、改单茬为多茬、促进农机农艺融合和促进综合开发利用。结论 该模式在一定程度上解决了蕲艾传统种植模式中存在的问题,提供了蕲艾产业提质增效的有效手段,为蕲艾规模化种植和经济效益提高提供参考。  相似文献   
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