丹参治疗微循环障碍作用机制的“成分-靶点-通路”多层次互作网络模型研究

目的基于网络药理学分析丹参治疗微循环障碍的分子生物学机制。方法借助TCMSP、PubChem Search、Genecards数据库和Swiss target prediction在线工具得到丹参的活性成分治疗微循环障碍的作用靶标,利用Cytoscape 3.3.0软件构建丹参活性成分-微循环障碍作用靶标网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体(GO)生物学过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果从丹参中共筛选出治疗微循环障碍的65个相关活性成分,并发现微循环障碍相关的9个关键靶点。GO和KEGG通路富集分析发现,丹参治疗微循环障碍可能与氧化还原、钙离子稳态等生物过程有关,能够调节血管内皮生长因子信号通路、神经突触信号传导、催产素信号通路、醛固酮-调节钠重吸收等信号通路。结论丹参治疗微循环障碍体现了多成分、多靶点、多途径的作用特点,为进一步开展丹参治疗微循环障碍作用机制研究提供了新的思路和方法。     

基于糖脂代谢病创新理论探讨参芪降糖颗粒调节血脂异常分子机制

目的基于糖脂代谢病(GLMD)理论和网络药理学方法研究参芪降糖颗粒治疗脂代谢紊乱性疾病的潜在分子机制。方法借助PubChem Search、Genecards数据库和Swiss target prediction在线工具得到参芪降糖颗粒药效成分治疗脂代谢紊乱性疾病共性靶点;通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape 3.3.0软件构建"疾病-参芪降糖颗粒潜在活性成分-潜在靶点"网络;利用Clue GO插件进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果从参芪降糖颗粒共有115个活性成分与22个与脂代谢紊乱性疾病靶点相互作用。参芪降糖颗粒治疗脂代谢紊乱性疾病参与中等密度脂蛋白颗粒重塑、RNA聚合酶II启动子转录调控糖酵解、白三烯产生和炎症反应等生物过程;并与AGE-RAGE信号通路、NF-κB信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、胆汁分泌多条信号通路相关。结论参芪降糖颗粒治疗脂代谢紊乱性疾病具有多成分-多靶点-多途径的作用特点,其作用机制与糖脂代谢病的基本理论相吻合,能为参芪降糖颗粒临床新应用提供了借鉴和参考。     

参芪降糖颗粒通过多层次互作网络治疗糖尿病微循环障碍作用机制研究

目的基于网络药理学方法研究参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍的潜在分子机制。方法通过GeneCards数据库查询糖尿病肾脏病、糖尿病视网膜病变、糖尿病神经病变、糖尿病足病和糖尿病合并脑小血管病的疾病靶点,整合为糖尿病微循环障碍疾病靶点。借助PubChemSearch和Swisstargetprediction在线工具得到参芪降糖颗粒药效成分治疗糖尿病微循环障碍的作用靶标,利用Cytoscape 3.3.0软件构建参芪降糖颗粒化学成分-糖尿病微循环障碍作用靶标网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,利用Clue GO插件进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果从参芪降糖颗粒中共筛选出85个化学成分,以及10个与糖尿病微循环障碍相关的作用靶点,分别为ACE、VEGFA、TNF、IL6、STAT3、ALB、PON1、PTPN22、PPARG、NOS3。经GO和KEGG通路富集分析,发现参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍可能参与HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、AGE-RAGE信号通路、炎症性肠病、类风湿性关节炎、肥厚性心肌病信号通路等多条信号通路。结论参芪降糖颗粒治疗糖尿病微...