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目的对我国登革2型病毒1993年广东省佛山市流行株GD06/93结构蛋白基因进行序列测定及分析,追踪其地域来源、基因组结构与致病性的关系,为研究开发登革病毒新型疫苗奠定基础。方法根据登革2型国际标准株NGC序列,设计2对重叠引物,RT-PCR扩增,分别克隆到pMD18-T载体,转化受体菌DH5α,挑取阳性克隆进行PCR、酶切鉴定及序列测定。结果GD06/93株结构基因序列长度为2325bp,编码775个氨基酸。与其它登革2型病毒株TSV01、Taiwan-1008DHF、NGC、44、ThD2_0038_74、ThNH81/93、gd08/98、04、Cuba165/97及S1进行比较,其核酸序列同源性分别为97%、96%、95%、95%、95%、94%、94%、92%、92%、91%。结论GD06/93病毒株的结构基因序列与已发表的其它登革2型病毒株同源性很高。在比较的6株登革2型病毒株中,GD06/93株与同期在澳大利亚流行的TSV01株同源性最高。 相似文献
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目的 建立检测基孔肯雅病毒实时荧光定量RT-PCR快检方法,为其实验室诊断与定量分析提供技术方法。方法 基于基孔肯雅及其相近虫媒病毒基因组序列的系统比对分析,筛选、鉴定基孔肯雅病毒特异性核酸序列,并以人GAPDH基因为内参照,设计引物、探针,采用L9(34)正交实验确定最佳反应条件,建立基于TaqMan探针法的基孔肯雅病毒qRT-PCR快检方法,并详细分析所建立方法的灵敏度、特异度、重复性及覆盖面。以克隆的检测靶标核酸片段为阳性品,制作标准曲线,建立绝对定量方法。结果 经系统优化,建立了基孔肯雅病毒实时荧光定量RT-PCR定性、定量检测方法,反应体系包括:基孔肯雅病毒、GAPDH内参照检测引物探针,RT/Taq酶混合液,反应缓冲液及阴阳性参考品。所建立方法与ECSA亚型ROSS株、IOL分支LR2006株,亚洲型181/25株以及2010东莞流行株均可获得阳性结果,而与所试其他18种黄病毒、甲病毒、布尼安属相近虫媒病毒无交叉反应,检测下限为580拷贝/mL。定量分析表明,在5.80×102~5.80×1010<... 相似文献
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微孔杂交快速检测主要黄病毒方法的建立 总被引:1,自引:0,他引:1
目的建立特异、敏感、实用的登革病毒Ⅰ-Ⅳ型、流行性乙型脑炎病毒及黄热病毒检测及分型方法。方法在系统分析上述病毒基因组序列基础上,分别设计针对6种病毒的特异性包被探针,扩增、克隆、测序后包被聚乙烯微孔板。随后设计检测用PCR引物,并于引物5′端标记生物素,对待检样品进行扩增后用检测探针进行微孔杂交(PCR-ELISA)反应,并对包被DNA浓度、包被时间、杂交温度、杂交时间等反应条件进行优化。结果初步建立了微孔杂交快速检测上述病毒的方法,试验结果直观,阳性标本吸光度(A)值在0.5以上,阴性结果A值在0.1以下,S/N值在10.0以上。结论PCR-ELISA方法敏感、特异,为上述病毒的快速诊断提供了新的方法。 相似文献
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本文通过对RAPD技术反应中模板抽提,模板浓度,Mg^2 和dNTP浓度,样本选择取大小的分析,探讨了RAPD的反应条件,高纯度的模板DNA是反应进行的基础,模板的用量一般在25-100ng为佳;对每一引物,模板都应反复摸索,以获得最佳Mg^2 与dNTP浓度;群体扩增产物出现的多样性比个体的更为丰富明显;取样大小对结果的统计分析影响不大。只有在充分优化RAPD反应条件的基础上,才能够得到准确的结果。 相似文献
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登革病毒1~4型(dengue virus type 1-4,DV1-4)、流行性乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)及黄热病病毒(yellow fever virus,YFV)均为黄病毒属的重要传染病病原,其流行季节及临床症状都极为相似,且暴发日益频繁,发展特异、敏感的快速诊断及鉴别诊断方法,对这类疾病的预防及控制具有重要意义。本研究在对其基因组序列系统分析的基础上,建立了快速检测及鉴别诊断上述病毒的微孔杂交(PCR-ELISA)方法。 相似文献
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我国旋毛虫病患者数及死亡率居三大食源性人兽共患寄生虫病之首[1 ] 。旋毛虫新生幼虫肠型期 (NBL )为非细胞内寄生并在血液中移行 ,对宿主的免疫作用较敏感。利用基因工程技术制备 NBL抗原用于旋毛虫病的诊断和预防具有重要意义。本文对旋毛虫新生幼虫 c DNA文库进行筛选 ,获得其特异性全长基因 ,采用生物信息学原理对其进行分析 ,结果报告如下。1 材料与方法1.1 材料 NBL特异性全长 c DNA (编号 :SSC2 ) :由 NBL特异性探针从其 c DNA文库调取。克隆入 λZAP载体 ,由解放军军需大学动科系刘明远博士提供 [2 ]。1.2 基因片… 相似文献
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登革病毒E蛋白是病毒主要毒力蛋白,带有型特异及属特异抗原决定簇,既能诱导宿主产生保护性的中和抗体,又能诱导产生血凝抑制抗体,与登革出血热(DHF)和登革休克综合征(DSS)的致病机制有关[1].有学者已经利用包括大肠埃希菌、毕赤酵母、昆虫细胞等多种表达系统对其表达条件进行了探讨,由于受未知因素的影响,登革病毒E蛋白的原核重组表达一直不理想[2~4].本研究对登革病毒E蛋白不同区域的原核表达进行了较为系统的分析,探讨疏水性区域及稀有密码子登革病毒E蛋白表达的影响,并对部分区域进行了高效原核表达.广东省科技计划项目(20006836008005);全军医药卫生科研基金资助课题(06MA129) 相似文献
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微孔杂交检测登革病毒及其分型方法的建立 总被引:1,自引:0,他引:1
目的建立特异、敏感、实用的登革病毒检测及分型方法:方法分析登革1~4型病毒基因组序列,分别设计针对登革病毒1~4型的特异性包被探针,扩增、克隆测序后包被聚乙烯微孔板。PCR上游引物5’端标记生物素,对待检样品进行扩增后用作检测探针进行微孔杂交(PC艮ELISA)反应,并通过设定不同的包被DNA浓度、包被时间、杂交温度、杂交时间.对PCR—ELISA反应进行优化:结果建立了快速,特异、敏感的登革病毒快速检测及分型方法.试验结果直观,阳性标本吸光度值存0.5以上,阴性结果吸光度值在0.1以下,S/N值在10以上。结论所建立的方法可用作登革病毒感染的早期诊断及分型。 相似文献