表达谱基因芯片筛选体外循环前后心肌细胞因子的变化

Objestive Systemic inflarmmation may be triggered by injury, hypothermia, ischemia-reperfusion and the contact of the blood with foreign body during cardiopulmonary bypass (CPB). To determine the application values of gene chip technique in the clinical practice and the study of cardiovascular stagery, as well as to provide clues to the study of inflammatory responess during CPB, microarry for gene expression profiles was used to identify the differences in the gene expression of myocardium between pre-and post- CPB. Methods Six adult patients who underwent CPB from March to May in 2003 were involved. Samples of right atrium were col- lected before and at immediate end of CPB. BD AtlasTM cDNA Expression Arrays was used to identify the differences in the gene ex- pression of cytokines. The results were compared with that of semi-quantative RT-PCR. Resellts The mean age of 6 patients (5 males and 1 female) was (32.67± 11.72) years. The baseline heart function was gradeⅡin 3 cases and grade Ⅲ in 3 other cases. The baseline left ventricular ejection fraction(LVEF)was (58.17±7.91)%. The mere duration was (91.67±43.88) minutes for CPB and was (58.67±43.46) minutes for aorta blocking. The minimum nasopharynx/rectal temperture was (29.37±1.90)℃/ (32.15±1.52)℃. Gene expression profiles of cytokines in the myocardium pre- and post-CPB were analysed successfully. The ex- pression of IL-6, IFN-γ,Wnt5a, TNFRSF1B, a member of tumor necrosis factor receptor superfamily, PIGF and MFNG in the myo- cardium were unpregulated after CPB. Conclusion Microarray technique is applicable in the study of cytokines changes dying CPB. cDNA microarray identified pleliminarily the differences in the gene expression between pre- and post-CPB. These genes may be in- valved in inflammation and other psthophysiological responses incuced by CPB. The myocardiym is probably one of the major sources of cytokines during CPB. Further study may be helpful in understanding the llngthe development of inflammation during CPB, and eventually, reducing the post-operative complications.     

脂质体阿霉素为主方案治疗高龄非霍奇金淋巴瘤的临床研究

目的 观察脂质体阿霉素联合治疗高龄非霍奇金淋巴瘤患者的有效性和安全性.方法 应用脂质体阿霉素联合COP为主的方案化疗或联合利妥昔单抗等其他治疗方案治疗34例患者,观察患者应用脂质体阿霉素过程中及其后的毒副反应及疗效.结果 全组34例患者共接受176个疗程化疗,平均每个患者累计应用脂质体阿霉素127.0 mg治疗,总有效率(CR+PR)为88.2%(30/34),其中CR 24例(70.6%),PR 6例(17.7%),SD 1例(2.9%),PD 3例(8.8%).毒副反应主要为骨髓抑制,未出现严重感染.心脏毒性发生率14.7%(5/34),无化疗相关死亡.结论 脂质体阿霉素联合治疗高龄非霍奇金淋巴瘤具有较高的安全性和有效性.     

ABO血型不合异基因造血干细胞移植后并发纯红系再生障碍

为了研究ABO血型不合异基因造血干细胞移植（allo—HSCT）后并发纯红细胞再生障碍（pure red cell aplasia，PRCA）的发病情况及危险因素，对本医院以往血型不合异基因造血干细胞移植进行回顾性分析。探讨移植后患者PRCA的发病危险因素。研究结果表明，72例ABO血型不合allo—HSCT患者中，4例发生PRCA，其中A供O3例，A供B1例。PRCA的发生不影响急性移植物抗宿主病（GVHD）或巨细胞病毒（CMV）感染的发生。PRCA患者红系恢复的时间显著长于未PRCA发生患者。结论：PRCA是ABO血型不合移植的主要并发症。A供O可能是ABO血型不合allo—HSCT后并发PRCA的危险因素。     

多发性骨髓瘤铁死亡相关组学分析及预后模型的建立

目的:通过TCGA及FerrDb数据库探讨铁死亡相关基因在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,并构建MM相关铁死亡基因预后模型。方法:利用包含764例MM患者临床信息及基因表达谱数据的TCGA数据库与包括铁死亡相关基因的Ferr Db数据库,通过wilcox. test函数筛选其中的差异表达铁死亡相关基因。应用Lasso回归建立铁死亡相关基因预后模型,并绘制Kaplan-Meier生存曲线。使用COX回归分析筛选独立预后因素。筛选不同风险患者组间的差异基因,并通过富集分析探究MM铁死亡与预后相关的组学机制。结果:通过对764例MM患者骨髓样本及4例正常人骨髓样本进行差异分析,共筛选出铁死亡相关差异基因36个,其中上调基因12个,下调基因24个。使用Lasso回归筛选出6个预后相关基因(GCLM、GLS2、SLC7A11、AIFM2、ACO1、G6PD)并建立了MM铁死亡相关基因预后模型; Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,不同风险患者组间生存率具有显著统计学差异(P <0.01)。单因素COX回归分析结果显示,年龄、性别、ISS分期和风险评分与MM患者总生存期(OS)显著相...     

阿托伐他汀钙对EA.hy926细胞全基因表达谱的影响及生物信息学分析

目的探讨阿托伐他汀钙对体外培养人脐静脉内皮细胞EA.hy926细胞基因表达谱的影响及作用的分子机制。方法取EA.hy926细胞分实验组和对照组,实验组采用10μmol/L阿托伐他汀钙体外干预人脐静脉内皮细胞EA.hy926 24h,用Affymetrix HG-U133plus 2.0全基因组表达芯片检测阿托伐他汀钙对EA.hy926细胞基因表达谱的影响。并运用基因富集分析(GSEA)软件、DAVID基因功能聚类分析软件及Cmap数据库对芯片数据进行分析,对相关靶基因进行实时定量PCR验证。结果与对照组比较,实验组基因芯片分析筛选出差异表达倍数>2倍的基因649个,其中上调基因295个,下调基因354个。经DAVID及GSEA基因富集分析显示,阿托伐他汀钙广泛下调了细胞周期调控相关基因,上调了Kruppel样转录因子等血管保护基因,Cmap数据库分析显示,阿托伐他汀钙与组蛋白去乙酰化酶抑制剂及白藜芦醇呈正相关的联强度高。结论阿托伐他汀钙从多角度发挥抗动脉粥样硬化作用,作用机制可能与组蛋白去乙酰化酶抑制剂及白藜芦醇相似。     

急性白血病细胞中ID4基因甲基化的PCR定量检测系统的建立及其特异性和敏感性

ID4基因启动子区甲基化发生率在急性白血病中极高,甲基化程度与急性白血病关系密切。因缺少合适的研究方法,其具体的甲基化量化水平与疾病的关系,人们一直缺乏认识。本研究旨在建立ID4甲基化定量PCR体系,同时验证该方法的特异性及敏感性,并初步尝试在初治急性白血病骨髓样本中评估ID4的甲基化水平。首先构建质粒并建立体系标准曲线,分别使用MSP和定量MSP对细胞系样本进行检测,以传统MSP的结果为对照,验证新方法的特异性;按不同比例将甲基化阴性和阳性细胞混合,用甲基化定量PCR扩增验证新方法敏感性。结果表明,本研究成功建立了符合绝对定量要求的标准曲线;通过细胞系验证,MSP结果与定量MSP结果完全一致;同时在甲基化阴性细胞背景下,定量MSP可以稳定的检测到1：10-5水平的ID4甲基化阳性细胞。在急性白血病骨髓样本检测中,定量MSP甲基化阳性检出率高于MSP。结论：本研究成功建立了完整的ID4基因甲基化定量PCR体系,该方法特异性好、敏感性高。     

全反式维甲酸联合猪胆酸钠对K562和Kasumi-1细胞系生物活性抑制作用

本研究旨在探索全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA)联合猪胆酸钠(SBA-Na)对人白血病K562细胞系及Kasumi-1细胞系生物学活性的影响及其作用机制。分别配制浓度为10-6mol/L(W1)、10-4mol/L(W2)的ATRA溶液及浓度为100μg/ml(Z1)、200μg/ml(Z2)的SBA-Na溶液,分别使用W1、W2、Z1、Z2、W1+Z1、W2+Z2处理上述2种细胞系,并设立不加药的空白对照组。镜下观察不同处理组细胞形态及生长情况;应用CCK-8法检测细胞增殖能力,绘制细胞生长抑制曲线;分别采用PI单染和PI/Annexin V双染流式细胞术检测各加药组K562细胞和Kasumi-1细胞的细胞周期及凋亡的变化;采用实时荧光定量PCR(RQ-PCR)法检测K562细胞系各组CyclinA基因表达量的变化。结果表明,ATRA及SBA-Na对2种细胞均有抑制增殖作用,两者联合用药的作用更明显;各给药组与对照组相比,细胞周期分布发生明显变化,处理组细胞凋亡明显增加,尤以ATRA联合SBA-Na给药组凋亡最为明显。低浓度SBA-Na处理组Cyclin A表达上调,其他处理组Cyclin A表达均下调,且存在量效关系。结论:ATRA及SBA-Na均可抑制K562细胞及Kasumi-1胞系增殖,促进其凋亡,且二者联合效果更明显,对于K562细胞系,两者可能是通过下调Cyclin A基因表达而发挥作用。     

α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎潜在药物研究的意义

目的通过分析α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱,探索其对新型冠状病毒肺炎的潜在治疗意义。方法应用R语言对来自基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的α干扰素相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作分析,再应用自主研发的表观精准治疗预测平台（epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed）,寻找与α干扰素调控基因表达谱呈负相关的疾病类型,以及呈正相关的药物。结果α干扰素对基因组表达谱影响复杂,其调控的核心基因有OAS1、MX1、OASL、ISG15、IST1、IRF7等,参与病毒生命周期的负调控、B细胞受体信号通路、肝炎、双链RNA绑定、人类免疫缺陷病毒感染,以及JAK-STAT信号通路等。进一步分析,α干扰素调控的基因组表达谱与社区获得性肺炎和脓毒症等感染性疾病呈高度负相关,而与利托那韦、利巴韦林、奈韦拉平、氟伐他汀呈高度正相关。结论基于α干扰素抗病毒相关基因组表达谱的分析对于探索新型冠状病毒肺炎潜在治疗药物具有一定的借鉴意义。     

老年弥漫大B细胞淋巴瘤的临床病理学特征及疗效分析-附15例报告

目的：探讨老年弥漫大B细胞淋巴瘤（diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL）的临床病理学特征和疗效。方法对2003年1月-2012年12月我院收治的15例老年DLBCL患者的临床资料进行回顾性分析,包括患者的一般临床特征、病理特点、化疗方案选择及疗效,并结合电话随访收集患者生存资料。结果15例患者中位年龄84岁;所有患者合并至少2种其他疾病,其中以高血压病和冠状动脉粥样硬化性心脏病最常见,有4例合并第二肿瘤;出现B组症状（发热、盗汗及体重下降）的占13例;病理亚型中以非生发中心细胞型（non-GCB）居多（10/15）;Ann-Arbor分期Ⅱ期1例,Ⅲ/Ⅳ期14例;国际预后指数（international prognostic index,IPI）评分3~5分14例;初诊时有10例血清乳酸脱氢酶（LDH）高于正常。全组病例均采用R-CHOP（利妥昔单抗联合CHOP）为基础的个体化方案化疗,4个疗程后完全缓解（CR）4例,部分缓解（PR）8例,疾病稳定（SD）1例,疾病进展（PD）2例,治疗总反应12例;全组病例半年总生存10例,1年总生存8例;半年、1年无进展生存分别为7例、6例。结论老年DLBCL初诊时合并基础疾病多、分期较晚、病理分型以non-GCB亚型为主,预后很差;应在强化支持治疗的基础上,根据不同预后,采用个体化R-CHOP方案化疗。     

LRP16基因启动子的亚克隆及表达调控载体的构建

目的：为深入研究LRP16基因的表达调控机制，克隆及亚克隆了LRP16基因的启动子序列，构建LRP16基因启动子表达调控载体。方法：在NCBI的人类基因组数据库中截取并下载LRPl6基因转录起始位点5′侧翼区约3kb的基因组序列设计PCR扩增引物，从健康外周血中扩增获得该片段，以此序列为基础进行亚克隆，分别获得6条5’端不等、3’端平齐的片段，最后插入用于表达调控研究的pGL3—Basic载体。结果：获得了7条长度依次差别约为400bp的LRP16启动子克隆，分别构建了调控荧光素两报告基因的真核表达载体。结论：上述载体的成功构建为信息资源与实验手段的有效结合克隆启动子序列提出了一种模式，并为LRPl6表达克隆及启动子的活性分析奠定了基础。