从广州市白云山褐家鼠肺组织中分离出肾综合征出血热病毒

对肾综合征出血热（ＨＦＲＳ）抗原检测为强阳性（＋＋＋＋）的广州市白云山褐家鼠肺进行ＨＦＲＳ病毒分离,结果获得２株ＨＦＲＳ病毒。现将具体结果报告如下：材料与方法１　标本来源１９９８年从广州市白云山捕获的褐家鼠,无菌剖取肺组织切片,经直接免疫荧光方法检测抗原为强阳性（＋＋＋＋）的鼠肺作为病毒分离标本。２　ＨＦＲＳ参考毒株和抗原片７６－１１８、Ｒ２２毒株均来自中国预防医学科学院病毒所。抗原片一部分购自浙江省卫生防疫站（此抗原片是ＨＦＲＳ病毒浙１０株感染Ｅ６细胞后制成）。一部分为本室按常规法制备。３　受…     

2011年广州地区手足口病病原体特征分析

目的了解广州地区手足口病病原体特征。方法采用Real-time PCR对2011年采集的临床诊断手足口病患者的粪便标本,同时检测肠道病毒、CoxA 16和EV71。结果共检测手足口病病例标本1 837份,肠道病毒阳性1 172份,阳性率63.80%。其中,男性阳性率为66.70%(715/1 072),女性为58.74%(457/765);CoxA 16型阳性412份,占35.67%,EV71型357份,占30.46%,CoxA 16和EV71混合感染11份,占0.94%,其他未分型肠道病毒386份,占32.94%。全年有两个发病高峰,分别为5—7月及9—11月。肠道病毒感染主要集中于0～5岁儿童,占阳性标本的96.84%(1 135/1 172)。结论 CoxA 16型和EV71型为2011年广州地区手足口病的主要病原,其他未分型肠道病毒感染亦常见,0～5岁儿童是感染的主要人群。     

2008年广州手足口病分子流行病学分析

目的了解引起2008年广州地区手足口病流行的毒株的分子生物流行病学情况。方法首先采用Real-time PCR筛选出总肠道病毒阳性的标本,再分别使用CoxA16和EV71的特异引物进行RT-PCR检测,并对EV71毒株测序,比较序列。结果总肠道病毒阳性率为9．63％,CoxA16阳性率为3．03％,EV71阳性率为2．77％,并归纳出EV71的4个代表性序列。结论广州地区今年流行的EV71毒株并未见大的变异以及毒力加强等情况。     

广州市人感染H7N9禽流感疫情早期禽类从业人员知识、态度、行为分析

目的 通过在人感染H7N9禽流感疫情早期对禽类从业人员H7N9禽流感知识、态度和风险认知进行调查,探索其影响因素,为后续开展的健康教育及措施实施提供依据.方法 采用多阶段抽样方法,抽取广州市12个区共409名市场禽类从业人员,使用自行设计的问卷进行调查.结果 受访者中回答H7N9禽流感相关知识全部正确的占2.93％,认为自己可能因在市场工作而感染H7N9禽流感的占48.17％,接触活禽时戴手套和洗手的占69.68％和78.73％,支持永久实施中央集中屠宰活禽的占31.78％.从业人员的知识(G=22.052,P=0.002)和态度及风险认知(G =26.205,P＜0.001)与采取防护行为有显著性关系,态度及风险认知(G=27.385,P＜0.001)与防控政策接受意愿有显著性的关系.结论 提高从业人员H7N9相关知识及风险认知水平,将对其采取有效地防护措施和接受严格的防控措施起到促进的作用.     

广州市2019年H3N2流感病毒分子流行特征分析

目的 对广州市2019年不同来源的H3N2流感病毒进行基因测序,分析H3N2流感病毒的进化变异特点。方法 对广州市2019年门诊监测、暴发疫情、住院重症病例等不同标本来源的H3N2流感病毒进行分离并对其血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因进行测序,运用DNA Star 7.1、Mega 6.0软件分析病毒的变异和进化特点。结果 2019年广州市H3N2流感表现为流行期Ⅰ（2019年1-8月）和流行期Ⅱ（2019年11-12月）2个流行高峰。男性和女性的H3N2流感病毒阳性率分别为13.46%（703/5 221）和11.50%（510/4 435）,差异有统计学意义（χ²=8.43,P=0.00）。10~20岁年龄组H3N2流感病毒阳性率最高（25.18%,665/2 641）,各年龄组阳性率差异有统计学意义。测序发现,不同标本来源的毒株高度同源,亲缘关系相近,属于3C.2a.1分支。根据流行时间和进化特点,进一步划分为Group 1~3共3个小进化分支,Group 1分支流行于流行期Ⅰ、Group 3分支流行于流行期Ⅱ,Group 2分支为2个流行期过度的进化分支,流行期Ⅱ的病毒由流行期Ⅰ的病毒进化而来,且不同分支存在基因重组的现象。在疫苗选择压力下,Group 1~3分支逐渐出现HA抗原位点突变,导致新的抗原漂移。HA抗原位点变异主要发生A和B区,Group 1分支和Group 3分支受体结合位点变异发生在前壁和后壁,Group 2~3分支在HA抗原位点A区缺失2个糖基化位点。结论 2019年广州市H3N2流感病毒的遗传变异包括位点突变和基因重组。在疫苗免疫压力下H3N2流感病毒发生快速的进化变异,抗原位点变异逐渐累积,进而出现新的抗原漂移。应对H3N2流感病毒分子流行特点进行持续监测。     

广州市大学城诺如病毒GⅡ.4 Sydney 2012变异株感染疫情再次暴发的调查

2013 年1 月广州市大学城ZD 大学暴发国内首起诺如病毒GⅡ.4 Sydney 2012 变异株感染引起的急性胃肠炎疫情。2 个月后该地区其他4 所高校（HS、HG、GD、GG）和1所中学（GDFZ）相继又出现暴发。     

广州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析

目的 了解广州市手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）病例中柯萨奇病毒A10型（coxsackievirus A10,CV-A10）VP1区基因特征。方法 采用荧光RT-PCR法对2017—2020年广州市HFMD病例标本进行检测确定病毒型别。对CV-A10阳性病例流行病学特点进行分析。挑选CV-A10阳性代表样本进行病毒培养和VP1区基因扩增测序,采用DNAstar7.1及Mega 6.0对测序序列进行分析。结果 2017—2020年共检测肠道病毒阳性样本8 430份,其中CV-A10阳性样本564份（6.69%）。CV-A10阳性病例主要集中在5-7月,以5岁以下儿童为主,男女性别比为1.42∶1。本研究共获得68株CV-A10毒株VP1区全长序列,对其进行序列分析表明,CV-A10毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8%～100%和96.9%～100%,与原型株Kowalik(AF081300)核苷酸和氨基酸同源性为69.8%～71.8%和91.4%～93.8%。分子进化树分析显示,广州市CV-A10毒株均位于C2亚型中的Cluster1...     

一起工厂发生的群体性诺瓦克样病毒性胃肠炎的调查分析

目的　探讨2 0 0 4年增城市一起由诺瓦克样病毒引起的工厂胃肠炎疫情暴发特征。方法采用现场流行病学调查方法,对标本进行ELISA和RT -PCR检测。结果　该起疫情共报告病例194例,13例患者的6份粪便和7份肛拭标本中有7例检出诺瓦克病毒核酸或抗原阳性。结论　本次胃肠炎暴发疫情由诺瓦克样病毒引起,传染来源尚不明确。     

一起诺瓦克样病毒性胃肠炎的流行病学调查

目的探讨2004年广州市番禺区一起由诺瓦克样病毒引起的学校胃肠炎疫情暴发特征. 方法采用现场流行病学调查方法,对该起疫情进行调查分析. 结果该起疫情共报告病例30例 ,其中3例患者的粪便或肛拭标本检出诺瓦克病毒抗原. 结论本次胃肠炎暴发疫情由诺瓦克样病毒引起,传染来源尚未查明.     

2014－2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒监测与遗传进化分析

目的 对广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒流行情况和基因进化特点进行监测分析,为人感染H7N9禽流感防控提供研究数据。 方法 采集2014 — 2017年广州市禽类市场外环境标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法检测H7N9禽流感病毒并绘制血凝素（HA）基因遗传进化树,分析H7N9禽流感病毒流行特点和基因进化特点。 结果 2014 — 2017年累计检测外环境标本28 252份,检出H7N9阳性标本888份,阳性率为3.14%。 检出率2015年最低,2014年最高,分别为1.60%和3.89%。2 — 5月出现H7N9禽流感病毒流行高峰,4月检出率最高为13.00%。 测序分析结果显示,HA基因核苷酸同源性为88.6% ~ 100%,氨基酸同源性为92.0% ~ 100%。 裂解位点分析发现,2017年外环境开始出现高致病性H7N9病毒。 进化分析发现,HA基因呈现多进化分支特点。 结论 2014 — 2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒持续存在且病毒变异较快,呈现基因多样性。 2017年外环境已发现高致病性H7N9病毒,近年病毒HA基因归属于华南分支,呈现本土化,同时监测到来源于野鸟的另一独立分支的病毒存在,提示加强本地区野鸟H7N9禽流感病毒监测的必要性。