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目的本研究通过生物信息学方法确定通过上皮-间充质转化(EMT)调控影响结直肠癌远处转移的关键基因, 并探究分子机制和预后。方法通过分析Enrichr数据库中的基因组, 获得EMT和转移性结直肠癌之间共同表达的枢纽基因。基因表达谱数据动态分析(GEPIA)被用来分析识别关键基因。利用多个生物信息数据库公布的数据, 分析关键基因在结直肠癌中的表达和功能富集。利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达谱数据库(GEO)探讨关键基因与结直肠癌病理特征和预后之间的关系, 并利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)探究可能存在的通路及分子机制。结果两个关键基因P21活化激酶1(PAK1)和转化生长因β3(TGFB3), 分析与预后及病理特征关系。结果显示, PAK1低表达组的总体生存率低于高表达组[风险比(HR)=0.641, P<0.05], TGFB3高表达组的总体生存率低于低表达组(HR=1.561P<0.05)。TGFB3的表达水平与结直肠癌的M分期(t=6.314, P<0.05)、病理分期(t=4.368, P<0.05)和N分期(t=5.843, P<0.... 相似文献
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目的 研究RAS癌基因家族成员RAB10在胰腺癌中的表达情况及其对人胰腺癌细胞系SW1990细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。方法 利用癌症基因数据库GEPIA和TCGA中胰腺癌的数据分析RAB10 mRNA在胰腺癌组织中的表达;Cox回归分析RAB10 mRNA表达水平与胰腺癌患者预后关系;靶向RAB10的小干扰RNA(RAB10-siRNA)作为沉默组、构建过表达RAB10质粒(RAB10-OE)作为过表达组;使用Q-PCR检测沉默及过表达效果;Western blot实验检测蛋白表达水平;EdU细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验、流式细胞实验分别分析RAB10对SW1990增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。结果 胰腺癌组织中RAB10 mRNA的表达量明显高于正常胰腺组织(P<0.05);EdU细胞增殖实验结果显示,RAB10-OE组的SW1990细胞的增殖率明显高于对照组,RAB10-siRNA组SW1990细胞的增殖率低于对照组(P<0.05);Transwell实验和划痕实验结果显示,RAB10-OE组细胞侵袭率及迁移率均高于对照组,RAB10-siR... 相似文献
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