热带医学专业信息资源库几个重要问题的思考及其改进

基于校园网和广东省专业信息资源库平台，构建“热带医学专业信息资源库”。对试题库、动画库、专家库、powerpoint教学资源库等几个重要问题进行思考，提出改进的建议。     

植物偏爱密码子优化HPV18L1全长基因的重叠PCR合成

目的 以重叠PCR方法 合成植物偏爱密码子优化后的人乳头瘤病毒18L1全长基因.方法 自GenBank获取国内外所发布的HPV18L1全长基因序列,经生物信息学分析后选定目标序列,经Synthetic Gene Designer及JCat(Java Codon Adaptation Tool)分析软件将此序列原始密码子改造为植物偏爱密码子,在C端加入蛋白纯化标签His-tag,获得改造后的HPV18L1全长序列(mHPV18L1).结合酶切位点分析将mHPV18L1设计为204~477 bp的五个大片段LS1-LS5,再将每个大片段分割成57~59 bp的 5~11个寡聚核苷酸短链,设计合成5对内引物和1对外引物,经重叠PCR扩增获得mHPV18L1全长基因,纯化后将其克隆入pMD18T载体,酶切、测序鉴定插入子.结果 以重叠PCR成功扩增获得mHPV18L1全长,pMD18T-mHPV18L1重组质粒经酶切、PCR鉴定均得到预期1749 bp大小的片段,并经测序验证.结论 获得以植物偏爱密码子进行序列优化的mHPV18L1全长基因及其重组质粒pMD18T-mHPV18L1,为后续mHPV18L1的植物转化研究奠定了一定的工作基础.     

恙虫病东方体Ot56蛋白序列生物信息学分析

目的分析恙虫病东方体Ot56蛋白序列中的变异区和保守区,为恙虫病的蛋白与核酸诊断提供参考。方法从Gen Bank获取目标序列,用Lasergene、MEGA、Vector NTI suite、Athe Port和NCBI Blast等工具进行分析。结果120条Ot56氨基酸序列的相似性为61.4％-100.0％,变异度为0.0～57．1;氨基酸的105-171、179～215、248～285、375～428和447～503区域为高变异区：膜外区200～400具有变异度高、抗原性强的特性。113条Ot56cDNA序列的相似性为41.8％～100.0％,变异度为0.0～116．1;其中303～481、562～667、756～842、1136～1243和1386～1568等5个区域属高变异区,而0～54、97～171、265～303、439～482、1015～1047和1477～1542为6个保守片段。结论恙虫病东方体Ot56蛋白具有5个高变异区,第200～400位氨基酸附近可能是株（型）特异性表位所在区域,其重组蛋白具有潜在的株（型）鉴定价值。根据cDNA6个保守片段设计引物,进行Ot56核酸检测可能在不同株（型）恙虫病东方体检测中具有较高的敏感性。     

恙虫病东方体0t56蛋白序列生物信息学分析

目的分析恙虫病东方体Ot56蛋白序列中的变异区和保守区,为恙虫病的蛋白与核酸诊断提供参考。方法从GenBank获取目标序列,用Lasergene、MEGA、Vector NTI suite、AthePort和NCBI Blast等工具进行分析。结果120条Ot56氨基酸序列的相似性为61.4%～100.0%,变异度为0.0～57.1;氨基酸的105～171、179～215、248～285、375～428和447～503区域为高变异区;膜外区200～400具有变异度高、抗原性强的特性。113条Ot56cDNA序列的相似性为41.8%～100.0%,变异度为0.0～116.1;其中303～481、562～667、756～842、1136～1243和1386～1568等5个区域属高变异区,而0～54、97～171、265～303、439～482、1015～1047和1477～1542为6个保守片段。结论恙虫病东方体Ot56蛋白具有5个高变异区,第200～400位氨基酸附近可能是株(型)特异性表位所在区域,其重组蛋白具有潜在的株(型)鉴定价值。根据cDNA6个保守片段设计引物,进行Ot56核酸检测可能在不同株(型)恙虫病东方体检测中具有较高的敏感性。     

热带医学专业信息资源库几个重要问题的思考及其改进

基于校园网和广东省专业信息资源库平台,构建“热带医学专业信息资源库”。对试题库、动画库、专家库、powerpoint教学资源库等几个重要问题进行思考,提出改进的建议。     

利用反向遗传学原理构建B、E型肉毒神经毒素基因型特异性靶片段

目的 利用反向遗传学原理构建B、E型肉毒神经毒素(BoNT)基因型特异性靶片段质粒、菌株.方法 自GenBank获取BoNT基因序列,利用DNAMAN、Lasergene、VectorNTI等多种生物信息学分析软件和BLAST等网上数据分析平台进行综合分析,以锚定BoNT/B与BoNT/E基因中的型特异性靶片段,分别设计合成5条和10条DNA短链,经重叠PCR扩增获得完整的靶片段,纯化后连接到pMD 18-T载体上,转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,质粒提取后进行酶切和测序鉴定.结果 分析了全球已报道的60条BoNT基因序列(A、B、E、F型),于BoNT/B与BoNT/E基因中,分别锚定了215 bp和360bp的靶片段,并设计合成其特异的检测引物对,经酶切、测序确证,成功合成具有型特异性的BoNT/B与BoNT/E靶片段.结论 获得含有型特异性BoNT/B与BoNT/E靶片段的重组质粒pMD18-T-BoNT/B,pMD18-T-BoNT/E及其菌株.     

医学寄生虫学教学网络资源搜索与应用

多媒体在医学寄生虫学教学中起着重要作用,因特网为多媒体教学提供了丰富的资源.笔者结合教学多媒体课件制作经验,就医学寄生虫学网络教学资源的来源、搜索及应用等方面进行阐述,供教师备课参考.     

恙虫病东方体Ot56蛋白序列生物信息学分析

目的分析恙虫病东方体Ot56蛋白序列中的变异区和保守区，为恙虫病的蛋白与核酸诊断提供参考。方法从Gen Bank获取目标序列，用Lasergene、MEGA、Vector NTI suite、Athe Port和NCBI Blast等工具进行分析。结果120条Ot56氨基酸序列的相似性为61.4％-100.0％，变异度为0.0～57．1；氨基酸的105-171、179～215、248～285、375～428和447～503区域为高变异区：膜外区200～400具有变异度高、抗原性强的特性。113条Ot56cDNA序列的相似性为41.8％～100.0％，变异度为0.0～116．1；其中303～481、562～667、756～842、1136～1243和1386～1568等5个区域属高变异区，而0～54、97～171、265～303、439～482、1015～1047和1477～1542为6个保守片段。结论恙虫病东方体Ot56蛋白具有5个高变异区，第200～400位氨基酸附近可能是株（型）特异性表位所在区域，其重组蛋白具有潜在的株（型）鉴定价值。根据cDNA6个保守片段设计引物，进行Ot56核酸检测可能在不同株（型）恙虫病东方体检测中具有较高的敏感性。     

易更改型《医学寄生虫学》教学课件的制作

介绍了如何在教学用PowerPoint基础上,利用FrontPage等工具制作具有系统性、易更改性、实用性和操作简便等特点的易更改型《医学寄生虫学》教学课件。该课件不仅适合不同教学风格的教师授课,便于随时将学科的新进展纳入教学中,同时适合学生的自学及其交互性学习。     

医学寄生虫学教学网络资源的搜索与应用

多媒体在医学寄生虫学教学中起着重要作用,因特网为多媒体教学提供了丰富的资源。笔者结合教学多媒体课件制作经验,就医学寄生虫学网络教学资源的来源、搜索及应用等方面进行阐述,供教师备课参考。