广东省五例人感染猪链球菌病例流行特征分析

猪链球菌病是由猪链球菌引起的人畜共患传染病，有6种血清型的致病菌能感染人，其中血清2型是从病猪或病例中分离最多的一种致病菌。2005年广东省首次经实验室确诊了5例人猪链球菌感染病例。病例诊断标准参照文献[1]的方法。调查采用面访的方式，内容为：有无接触病死畜、接触方式等流行病学史、临床表现、临床实验室常规检查、治疗与转归等。病原学检测参照文献[2]的方法。     

2019年广东省部分地区感染性腹泻病原学及人轮状病毒分子流行病学特征

目的 对感染性腹泻样本进行检测鉴定,并对轮状病毒A组进行病毒分离,研究2019年广东省部分地区感染性腹泻病原学及轮状病毒分子流行病学特征。方法 2019年1月1日至2020年1月12日,采集广东省广州市、东莞市和江门市临床感染性腹泻患者粪便样本,进行多重RT-PCR扩增和微球杂交技术检测鉴定,并对轮状病毒A组阳性样本进行分离后,采用半巢式PCR试验对阳性细胞培养物进行G/P基因分型。结果 共纳入706例合格病例,病原体总检出率43.06%,病毒检出率18.13%高于细菌检出率8.36%高于寄生虫检出率1.27%。病毒病原谱以轮状病毒A组G9P[8]和诺如病毒GII型感染为主,细菌病原谱以沙门菌和艰难梭菌为主,寄生虫以蓝氏贾第鞭毛虫为首。不同季度、不同年龄组病原谱构成各不相同。轮状病毒A组主要受累群体为≤5岁儿童,主要时间分布于1—4月,基因型呈现多样性,包括G2P[4]、G3P[8]和G9P[8]。结论 2019年广东省部分地区感染性腹泻病毒类病原体高于细菌类高于寄生虫类,轮状病毒A组G9P[8]、诺如GII型、沙门菌和蓝氏贾第鞭毛虫是最主要的病原体,且G9P[8]型A组轮状病毒毒株在轮状病毒感染中占主导趋势。在防控病毒性和细菌性腹泻的同时,应警惕寄生虫所致腹泻并重视混合感染的病原学监测。     

广东省耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌耐药性及分子流行特征分析

目的 了解广东省耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌（CRAB）的耐药性及相关耐药基因和分子流行病学特征,为指导临床合理用药、有效控制耐药传播提供依据。方法 以广东省2019年收集的58株CRAB为研究对象,采用Vitek MS全自动微生物质谱仪和微量肉汤稀释法进行菌种鉴定及药物敏感性试验,利用全基因组测序技术对菌株进行耐药相关分子特征、菌株同源性及遗传进化关系分析。结果 58株CRAB对大多数抗菌药物耐药率均为100%,仅对替加环素和多粘菌素B表现敏感。共检测到26种耐药基因,所有菌株均同时携带bla_OXA-23和bla_OXA-66两种碳青霉烯酶基因。27.5%菌株检测到耐药基因元件ISAba1-OXA-23,由Tn2006携带并整合在AbaR4型耐药岛上;其中11株同时检测到由Tn2008VAR携带的耐药基因元件OXA-23-ISAba33。所有菌株均为ST2型。同源性分析显示58株CRAB菌群具有2个聚类（C1、C2群）和4个亚组（g1、2、3、4）,与全球CRAB流行株具有密切的亲缘关系。结论 广东地区CRAB均为泛耐药菌。OXA-23型碳青霉烯酶是CRAB的主要耐药机制,且存在ISAba1插入情况。ST2为本地区主要流行克隆,与全球流行的CRAB多重耐药克隆遗传关系密切,应加强CRAB耐药监测,防止多重耐药广泛流行与传播。     

广东省多重耐药沙门菌1,4,[5],12 ∶ i∶-的耐药性及分子流行特征分析

目的 多重耐药沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的耐药形势日趋严峻,耐药克隆株的广泛传播已成为全球重点关注的公共卫生问题.了解广东省多重耐药沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的耐药特征及遗传背景,为该血清型的耐药监测及食源性疾病暴发与防控预警提供证据支持.方法 以广东省腹泻病原体监测哨点医院收集的92株沙门菌1,4,[...     

2005年广东省临床分离猪链球菌的MLST分子分型研究

在2005年四川发生猪链球菌人间感染疫情期间.广东省也加强了监测,并发现了5个散发感染病例.从这5个住院临床病例中,分别分离了5个致病性SS2.通过测定猪链球菌基因组上的7个看家基因dpr、thrA、cpn60、recA、gki、aroA和mutS的部分片段.对这5个猪链球菌进行了多佗点测序分型.通过对上述测序片段进行比对分析发现,5个菌株的dpr、cpn60、recA、gki、aroA和mutS等6个基因片段完全相同;而thrA基凶片段存在两个等位基因型即thrA-c和thrA-h,在该等位基因片段的360位的亮氨酸码子第三位发生了一个中性突变(TTA→TTG).MLST分析结果显示,广东省的临床猪链球菌分离株L-SS002、L-SS003和L-SS005菌株.与四川疫情株相同,属于ST7型;而L-SS004和L-SS006,与香港地区发现的猪链球菌相同,属于ST1克隆;但这5个菌株亲缘关系极近,都属于ST1克隆复合物;这一点与四川省暴发的人间猪链疫情明显不同,后者仅由单一的ST7猪链球菌克隆引起.属于ST7的克隆菌株很可能来源于四川;而其余两个ST1克隆系菌株的来源尚待鉴定.     

广东省2009－2013 年霍乱弧菌病原学特征分析

目的 分析广东省2009－2013 年霍乱病例及环境来源O1/O139 群霍乱弧菌病原学特征。方法 选取2009－2013 年广东省霍乱病例来源、环境（水体和海水产品）来源的O1/O139群霍乱弧菌。采用血清分型、抗菌药物敏感性试验、毒力基因PCR 检测和脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型方法 , 研究不同来源的霍乱弧菌血清型、抗菌药物敏感性、毒力基因携带以及分子分型方面的异同。结果 2009－2013 年广东省共分离得到各类来源O1/O139 群霍乱弧菌190株（病例16 株, 外环境174 株）。病例来源菌株分为O1 群稻叶型（3 株）、小川型（7 株）和O139 群（6株）3 种菌型;其中10 株ctxA 基因阳性, 2 株小川型菌株携带不完整CTXΦ噬菌体;5 株菌对11 种抗菌药物完全敏感, 3 株对4 种抗菌药物表现出耐受。外环境来源菌株中53 株稻叶型, 22 株小川型和2 株O139 群菌株携带不完整CTXΦ噬菌体;2 株O139 菌株检出ctxA 基因阳性;25 株对≥4 种抗菌药物耐受, 其中有2 株同时对11 种抗菌药物中的7 种耐受, 以水产品中的稻叶型菌株为主（13株）。PFGE分子分型结果显示, 菌株经NotⅠ酶切后的PFGE型别表现出明显的多样性。稻叶型和O139 群病例菌株的带型聚集在同一个聚类中, 小川型病例菌株带型分散在不同的聚类中, 病例来源菌株与环境来源菌株的带型差别较大。结论 广东省O1/O139 群霍乱弧菌毒力基因和遗传特征复杂多样, 菌株多重耐药形势严峻, 需要加强菌株型别变异及耐药监测。     

广东省2013-2014年食源性疾病主动监测的病原学特征分析

目的 了解广东省腹泻病例中沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌和4种致泻性大肠埃希菌［肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）、产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）、肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）］的感染情况及其血清型别、耐药变化和分子特征。方法 对2013-2014年广东省食源性疾病主动监测检出的沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌和4种致泻性大肠埃希菌菌株进行血清分型、药物敏感试验和PFGE分型。结果 2013-2014年检测粪便标本57 834份,分离到3 372株致病菌,检出率为5.83%;沙门菌的检出阳性率最高,其次是副溶血弧菌、致泻性大肠埃希菌、志贺菌。3 213株沙门菌分为143种血清型,最常见的血清型为鼠伤寒、4,5,12：i：-、肠炎、斯坦利和德尔卑沙门菌。沙门菌对头孢类和氟喹诺酮类药物均较敏感;不同血清型沙门菌对抗生素的耐药率有明显差异,10种最常见血清型中,肠炎沙门菌对头孢类药物的耐药率最高,德尔卑沙门菌对环丙沙星的耐药率最高。2 289株各血清型沙门菌的PFGE型别分布多样,表现出较大的指纹图谱多态性。85株副溶血弧菌分为10种血清型,最主要的血清型为O3：K6（61.18%）,其次是O4：K8（10.59%）;tdh携带率高（81.18%）,trh携带率较低（7.06%）,有10株菌（11.76%）不携带该两种毒力基因;副溶血弧菌对亚胺培南、萘啶酸、复方新诺明、氯霉素、四环素的敏感率均>95%。13株志贺菌分别为宋内志贺菌9株、福氏志贺菌3株、鲍氏志贺菌1株;对头孢他啶、环丙沙星、氯霉素较敏感（76.92%）。检出的86株致泻性大肠埃希菌中ETEC 29株（33.72%）,EPEC 27株（31.39%）,STEC 27株（31.39%）,EIEC 3株（3.48%）。结论 2013-2014年广东省食源性疾病主动监测中沙门菌检出率最高（5.57%）,其次是副溶血弧菌、致泻性大肠埃希菌、志贺菌;沙门菌、副溶血弧菌和志贺菌对头孢类和氟喹诺酮类药物敏感;沙门菌感染中仅发现聚集性病例,但未监测到暴发。     

广东省羊种布鲁杆菌菌株分子分型研究

布鲁杆菌（Brucella）是一种胞内寄生兼性厌氧的革兰阴性微小球杆菌,可以经消化道、皮肤粘膜、呼吸道等途径侵入机体而引起感染,布鲁杆菌侵入机体可引起传染-变态反应性的人畜共患传染性布鲁杆菌病（Brucellosis,布病）。20世纪90年代中期以后,由于我国疫区畜间疫情出现回升,导致人间布病疫情呈逐年上升趋势,     

广东省2006-2021年流行性脑脊髓膜炎流行病学和病原学监测

目的 分析广东省流行性脑脊髓膜炎(流脑)流行病学和脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis, Nm)血清群谱。方法 收集广东省2006-2021年流脑报告病例、2006-2012年健康人群Nm带菌率调查、2016-2017年脑膜炎和脑炎监测(Acute meningitis and encephalitis surveillance, AMES)、2007-2019年Nm耐药性试验等数据,分析流脑流行特征、Nm血清群分布和耐药率。结果 广东省2006-2021年报告流脑118例,年均报告发病率为0.007/10万;0-4、5-9、10-14、15-19、≥20岁分别占总病例数的37.29%、4.24%、5.93%、18.64%、33.90%。流脑病例Nm检出率为71.19%(84/118),其中A、B、C、W、Y、不可分群分别占4.76%、52.38%、26.19%、8.33%、7.14%、1.19%;健康人群Nm带菌率为0.56%(32/5 743),各血清群分别占0.00%、65.63%、9.38%、3.13%、0.00%、21.88%;AMES病例Nm检出率为1...     

广东省伤寒沙门菌株的脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 运用脉冲场凝肢（PFGE）电泳研究广东省伤寒沙门菌的分子流行病学。方法用PFGE对菌株进行分子分型，所得结果用BionumefiscV4．0软件进行聚类分析。结果 来自广东省6个地区的51株伤寒沙门菌，根据电泳图谱分析，可分为45个PFGE型别，菌株间的相似值在38．27％-100．00％，6个地区间没有同源的菌株，同一个地区不同年份也没有同源的菌株，而同一地区同一年份可出现同源的菌株。结论 PFGE是一种敏感的研究伤寒沙门菌分子流行病学的基因分型方法。