基氏蠊螨的 18S rDNA 分子鉴定

目的 基于核糖体 18S rDNA 基因对基氏蠊螨进行分子鉴定。 方法 采集和分离储藏物样本,进行螨类的形态学鉴定。 提取单个螨的基因组 DNA,经 PCR 扩增、克隆和测序获得 COⅠ基因和 18S rDNA 基因,将所获序列进行 Blast 对比。 检索 GenBank 数据库中蠊螨属 18S rDNA 基因序列,利用 Clustal X 1. 83 软件进行多序列比对,基于MEGA X 软件进行序列分析并以邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统发育树。 结果 采集的样本经形态和 COⅠ基因双重鉴定为基氏蠊螨。 同时,所选取的 10 个基氏蠊螨的 18S rDNA 基因序列完全一致,均表现出 A / T 碱基偏向性,与同属的 Blattisocius tarsalis 和 Blattisocius everti 分别有 98. 73%和 98. 94%的同源性。 基于 18S rDNA 基因序列的系统进化树显示,基氏蠊螨与 Blattisocius tarsalis 和 Blattisocius everti 聚为一支。 结论 本研究建立了基氏蠊螨基于 18S rDNA 基因序列的分子鉴定方法,为基氏蠊螨的准确鉴定奠定基础。     

基于COI与18S rRNA基因序列的4种肉食螨DNA条形码研究

目的　基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I（COI）与核糖体18S小亚基（18S rRNA）基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库。方法　2018年5月—2019年7月于安徽省阜阳、芜湖、铜陵等3市小型面粉作坊采集分离肉食螨样本,经形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA,经PCR扩增、克隆和测序获得COI与18S rRNA基因序列,所获序列进行BLAST比对。结合已报道肉食螨序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,采用最大似然法构建系统发育树。结果　马六甲肉食螨、转开肉食螨、鳞翅触足螨分子鉴定结果与形态学一致,而GenBank中缺少网真扇毛螨相关序列。4种肉食螨COI与18S rRNA 基因序列（A + T）分别为69.6%和55.1%,碱基替换数分别为137对和46对。基于COI与18S rRNA基因序列变异位点分析,发现4种肉食螨种间变异位点分别为154 ~ 321个和58 ~ 99个。4种肉食螨COI与18S rRNA基因序列种内遗传距离均≤ 0.020,种间遗传距离分别为0.235 ~ 0.583和0.078 ~ 0.114。基于COI与18S rRNA基因序列的系统发育树显示,4种肉食螨均能各自聚为一支,支持率均达100%,与形态学鉴定结果一致。结论　线粒体COI基因序列作为4种肉食螨DNA条形码优于18S rRNA基因序列,更适用于探索肉食螨的属、种低阶元亲缘关系。     

基于COⅠ与18S rRNA基因序列的4种肉食螨DNA条形码研究

目的 基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)与核糖体18S小亚基(18S rRNA)基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库.方法 2018年5月-2019年7月于安徽省阜阳、芜湖、铜陵等3市小型面粉作坊采集分离肉食螨样本,经形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA,经PC...