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钩体LPS生物合成与装配途径及相关基因分析 总被引:2,自引:1,他引:1
目的 预测问号钩体黄疸出血型赖株脂多糖(LPS)合成、装配途径,并对其中几个关键基因的特征进行深入分析。方法 使用NCBI/BlastX,PtoDom/Blast,Jpred^2,TMHMM对问号钩体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因所编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit,Pep Tool软件进行蛋白质一、二级结构分析。结果 确定了脂质A和核心多糖生物合成基因lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsM、kdsB、kdtA、Int、htrB和O—抗原生物合成基因簇rfb locus等以及装配、跨膜转运中的基因rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe绘制了LPS合成及装配途径示意图。并对合成和装配途径中几个关键的基因编码蛋白(LpxA、Rfc、RfbX、RfaL)的二级结构、跨膜区域、结构域等进行了分析。结论 问号钩体黄疸出血型赖株LPS合成、装配途径与典型的革兰阴性菌,如大肠埃希菌K—12相似,主要差异在于钩体特殊的脂肪酸代谢途径和O—抗原多糖结构。该研究为进一步探讨钩体LPS基因功能及其与致病性关系奠定基础。 相似文献
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钩端螺旋体血小板激活因子乙酰水解酶基因特征分析 总被引:3,自引:2,他引:1
目的 由于钩端螺旋体病的主要特征之一是组织器官广泛性出血 ,出血部位发生在黏膜、脏器、浆膜和皮肤等处 ,严重者出现大面积肺弥散性出血、咳血 ,是危重钩端螺旋体病早期最常见的死因 ,其致病机理仍不清楚。本文使用生物信息学软件分析钩端螺旋体基因LA2 14 4 (血小板激活因子乙酰化酶 ,PafAH)所编码蛋白的结构和功能 ,并探讨其在致病过程中的作用。方法 使用NCBI ,Swissprot/TrEMBL ,ProDom ,Pfam ,Jpred2 ,SWISS -MODEL ,TMpred ,SignalP ,ClustW对问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因诠释 ,编码蛋白进行在线分析 ,并使用Bioedit软件进行氨基酸同源性比较分析。结果 确定了问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株血小板激活因子乙酰化酶基因 ,该基因编码蛋白质与哺乳动物 pafAH在一级结构上相似性达 4 2 % ,以牛脑 pafAH(Ib)γ亚基 (1WAB/PDB)为模件模拟该蛋白三级结构 ,发现两者立体结构与非常相似 ,催化位点完全相同 ,均由Ser-His-Asp组成催化三合体。结论 该基因可能与钩体染色体所编码的胶原酶基因 ,溶菌酶基因 ,YopM基因 ,VwA基因协同在钩端螺旋体病出血过程中起作用 ,最终导致弥散性出血和咳血 相似文献
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2019年12月发生于中国武汉的不明原因肺炎最终被确定是一种新型冠状病毒感染所致,后者暂被命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。冠状病毒是一个大型病毒家族,可诱发禽类、哺乳动物和人类的诸多疾病,包括2003年严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)、2012年中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS)等。近20年来,全球科学家已开展了一系列冠状病毒相关的传播机制及致病机制等各方面研究。本文基于文献计量学、引文分析和知识图谱等方法,分析了全球冠状病毒研究的现状和趋势,梳理了冠状病毒相关研究的知识脉络,为当下及今后冠状病毒所致疾病的防控提供参考。 相似文献
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