下一代测序技术的临床应用规范化问题——参考美国医学遗传学与基因组学会行业标准

下一代测序(next generation sequencing,NGS)技术已经在临床实验室中得到应用.该技术的发展以及检测规模和应用范围的扩大,使基因检测成本大大降低.NGS技术在临床上的应用在不断地扩大,如疾病靶向基因组套检测、个体外显子组或全基因组分析等.同时,NGS技术也进一步改善了治疗决策和对某疾病高危人群的预测.然而,NGS技术的发展也充满了挑战性,包括测序平台和技术更新带来的选择困惑、测序结果的临床验证的不一致性问题等.为了帮助临床实验室更好地了解NGS技术、解决临床验证和正确选择NGS测序平台和方法,以及持续监控NGS并保证高质量的测序结果及其临床解释,本文结合美国医学遗传学和基因组学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)关于NGS技术在临床上的应用的专业标准和指南进行归纳和讨论,供我国分子诊断工作者制定国内行业标准时参考.     

不明原因发热患者骨髓查找寄生虫与病原菌的意义

目的探讨骨髓查找寄生虫与病原菌在不明原因发热(FUO)患者诊断中的意义。方法对160例FUO患者骨髓片与临床资料进行回顾性分析。结果 160例FUO患者骨髓片中找到寄生虫或病原菌13例(8.1%),其中马尔尼菲青霉菌感染7例(4.4%),黑热病原虫感染2例(1.3%),疟原虫感染4例(2.5%)。结论仔细查找骨髓片中寄生虫及病原菌对FUO患者疾病的诊断起重要作用。     

细胞色素P4501A1、谷胱甘肽转硫酶基因多态性和慢性粒细胞白血病的相关性研究

目的：探讨生物代谢酶细胞色素P4501A1、谷胱甘肽转硫酶M1、T1基因多态性和慢性粒细胞白血病（CML）的相关性。方法：采用病例对照研究方法,应用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术对89例CML患者以及120名健康对照者的CYP1A1MspI多态（T264C）、GSTMI和GSTT1等基因的多态分布进行分析。结果：CML组的CYP1A1基因MspI多态纯合子突变型（C型）的频率与对照组差异有统计学意义（P〈0.05）,携带纯合子突变型的个体患CML的危险度比杂合子突变型（B型）与野生型（A型）个体的高（OR=1.932,95%CI：1.044～3.576）。单一的GSTM1或GSTT1缺失型分布频率与对照组相比差异无统计学意义（P〉0.05）。同时携带CYPlAlC型、GSTM1、T1缺失型的联合基因型个体患CML的风险增加（OR=2.279,95%CI：1.193～4.350）。结论：CYP1A1基因MspI多态纯合子突变型（C型）与CML的易感性可能相关;单一的GSTM1或GSTT1缺失型与CML易感性可能不相关。同时携带CYP1A1C型与GSTM1、T1缺失基因型可能是CML发病的易感因素之一。     

间接免疫荧光法和免疫印迹法检测113例系统性红斑狼疮患者抗核抗体谱结果分析

目的分析系统性红斑狼疮（SLE）患者抗核抗体谱（ANAs）的检测结果。方法分别采用间接免疫荧光法（IIF）和免疫印迹法（IB）对113例SLE患者和57例其他结缔组织病（CTD）患者及45例健康体检人员的12种抗核抗体进行测定。结果IIF检测ANA结果显示，SLE患者ANA的阳性率为76．1％（86／113），其荧光染色模型主要为核颗粒型、核均质型和浆颗粒型。IB检测12种ANA结果显示，SLE患者的抗dsDNA、抗Sm、抗SS—A、抗nRNP／Sm、抗核小体抗体、抗组蛋白抗体及抗核糖体P蛋白抗体与其他CTD组对比差异有统计学意义。结论厢IIF和IB法进行ANAs体谱检测对SLE检测有一定的敏感性。     

细胞色素P450酶和谷胱甘肽硫转移酶基因多态性与白血病的关系

白血病是严重危害人类健康的恶性肿瘤之一，其发病率呈现出增长的趋势，且与遗传因素和环境因素有关。以细胞色素P450酶系（CYP450）与谷胱甘肽硫转移酶（GSTs）为代表的Ⅰ相、Ⅱ相生物转化代谢酶是化学致癌物激活、解毒代谢通路中的重要的酶类。许多研究表明代谢酶基因的等位变异或缺失可以增加患肺癌、肠癌、头颈部肿瘤等的风险。本文就CYP450和GSTs基因多态性与白血病发生关系作一综述。     

尿11项中ASC对尿红细胞测定的影响分析

尿11项比尿10项多了一项指标,即抗坏血酸(ASC),它反映最近的维生素C的饮食摄入量和体内维生素C的营养状态,维生素C降低见于维生素C摄入不足或坏血酸病,维生素C长期增高,可能与肾结石形成有关.更重要的意义是维生素C浓度偏高,对尿化学分析的测定结果可产生干扰,本文探讨ASC对尿红细胞检查的影响,现报告如下.     

尿11项中ASC对尿红细胞测定的影响分析

尿 1 1项比尿 1 0项多了一项指标 ,即抗坏血酸 (ASC) ,它反映最近的维生素C的饮食摄入量和体内维生素C的营养状态 ,维生素C降低见于维生素C摄入不足或坏血酸病 ,维生素C长期增高 ,可能与肾结石形成有关。更重要的意义是维生素C浓度偏高 ,对尿化学分析的测定结果可产生干扰 ,本文探讨ASC对尿红细胞检查的影响 ,现报告如下。1　材料与方法1 1　材料　匈牙利Labuleader尿液分析仪及其 1 1项配套试纸条。1 2　方法　首先收集我院非肾科住院病人晨尿 ,对每份标本按仪器说明进行 1 1项分析 ,取尿 1 1项全阴标本 2 32份及ASC阳性其余 1 0…     

广西细胞色素P4501A1、谷胱甘肽转硫酶基因多态性和急性髓系白血病的相关性研究

目的探讨广西地区生物代谢酶细胞色素P4501A1、谷胱甘肽转硫酶M1、T1基因多态性和急性髓系白血病的相关性。方法采用病例对照研究方法,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对98例急性髓系白血病(AML)患者以及120例健康对照者的CYPlAl Msp1多态(T264C)、GSTMI和GSTT1等基因的多态分布进行分析。结果AML组的CYP1A1基因(T264C)位点等位变异的频率及GSTTI缺失基因型的频率与对照组差异无统计学意义(P>0.05),而GSTMI缺失基因型频率与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05)。携带CYP1A1(T264C)位点突变基因型与GSTMI、Tl缺失基因型的个体患AML的风险增加(OR=1.981,95%CI:1.045~3.758)。结论单一的CYPIAl Msp1多态等位变异基因型或GSTT1缺失基因型与AML易感性可能不相关;GSTMI缺失基因型与AML易感性可能相关;携带CYP1A1突变基因型与GSTMI、Tl缺失基因型可能是ANLL发病的易感因素之一。     

一种新型尿液采样器的使用体会

我院采用新型的尿液采样器进行尿液采样和送检 ,为了探讨新型方法对尿液常规检验结果有否影响 ,本文就这一问题进行了对照实验 ,报告如下。1　材料与方法1.1　仪器　优利特 2 0 0型尿液自动分析仪及显微镜。1.2　采样器　一次性塑料尿杯及湖北永昌实验技术有限公司提供新型尿液采样器。其构造是一个椎型小管 ,打开上盖 ,内连一根带有海棉体的小棒 ,留取尿液时把尿液淋洒在海棉体上 ,充分湿透后拧紧上盖送检即可。1.3　标本来源　我院门诊病人 6 5份尿液标本。1.4　方法　每份标本取样后分成两份 ,一份用新型采样器的海棉体吸取后按产品推荐…     

一种新型尿液采样器的使用体会

我院采用新型的尿液采样器进行尿液采样和送检,为了探讨新型方法对尿液常规检验结果有否影响,本文就这一问题进行了对照实验,报告如下. 1 材料与方法 1.1 仪器 优利特200型尿液自动分析仪及显微镜.