两株PRRSV分离株ORF5与Nsp2基因部分序列分析

目的分析沈阳和甘肃发病猪场的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的ORF5基因和Nsp2基因变异情况。方法采用RT-PCR方法,对ORF5基因序列和Nsp2基因部分序列进行扩增、克隆并测序。并用DNAStar软件将测序结果与国内外发表的10株参考毒株进行比对分析。结果 2株分离株ORF5基因与国内外其它美洲型分离株核苷酸的同源性为88.6%～98.7%,推导的氨基酸的同源性为86.6%～98.0%;Nsp2基因的核苷酸同源性为73.4%～99.8%,推导的氨基酸的同源性为68.6%～99.5%,且该基因与国内其他变异株有完全一致的缺失特征。结论这两株分离株均属于PRRSV美洲型变异株,为该病的防治及疫苗的设计奠定理论基础。