低深度全基因组测序拷贝数变异分析技术在性发育异常患儿诊断中的应用价值

目的探讨低深度全基因组测序拷贝数变异分析(CNV-seq)技术在性发育异常(DSD)患儿诊断中的应用价值。方法纳入2019年10月至2020年10月至郑州大学第一附属医院就诊的5例身材矮小或外阴发育异常的DSD患儿。在外周血染色体核型分析、全外显子组测序(WES)、SRY基因检测的基础上, 进行CNV-seq检测以明确病因。结果患儿1和2的社会性别为女性, 染色体核型均为46, XY, WES结果为阴性, CNV-seq结果分别为46, XY, +Y(1.4)和46, XY, -Y(0.75)。其余3例患儿均携带可疑的Y染色体, 综合分析发现其核型分别为45, X[60]/46, X, del(Y)(q11.221)[40]、45, X, 16qh+[76]/46, X, del(Y)(q11.222), 16qh+[24]和45, X[75]/46, XY[25]。结论联合运用CNV-seq等分子遗传学技术明确了46, XY DSD患儿的Y染色体拷贝数变异及45, X/46, XY DSD患儿可疑Y染色体的性质, 为其临床诊疗提供了重要的依据。     

罕见特纳综合征的细胞遗传学和分子遗传学检测一例

特纳综合征是较常见的性染色体异常疾病。本文报道了1例罕见性染色体数目和结构异常的特纳综合征,并利用荧光原位杂交(FISH)、全基因组低深度测序(CNV-seq)等遗传学技术明确了结构异常染色体的性质,为临床医生和遗传分析人员提供诊断思路。     

基于游离DNA单分子标签检测技术的苯丙酮尿症无创产前检测：4例分析

目的:研究游离DNA单分子标签检测（cell-free DNA barcode-enabled single-molecule test, cfBEST）技术用于苯丙酮尿症（phenylketonuria, PKU）无创产前诊断的适用性和可行性。方法:研究对象为2019年7月至9月郑州大学第一附属医院进行产前诊断的4例...     

CNV-seq意外发现DMD基因部分重复的不致病胎儿家系分析及遗传咨询

目的明确低深度高通量全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)发现的胎儿携带的DMD基因部分重复变异的致病性,为其遗传咨询及产前诊断提供依据。方法对2例染色体异常高风险的孕妇分别抽取羊水,提取羊水和外周血基因组DNA,应用CNV-seq技术检测胎儿DNA,并应用多重连接探针扩增(MLPA)技术验证DMD基因的重复情况。通过数据库及家系验证分析DMD基因重复片段的致病性。结果2例胎儿通过CNV-seq分别检出Xp21.1存在大小为1.38 Mb和0.36 Mb的重复,经MLPA验证分别覆盖DMD基因5′端非编码区的第1~11外显子和3′端非编码区的第64~79外显子。经家系验证,两家系中均有临床表现正常的男性携带相同的DMD基因部分重复变异,结合数据库和家系分析,此2例DMD基因重复变异为多态性变异的可能性大,2例男性胎儿均继续妊娠并足月分娩,随访无DMD基因变异的临床表现。结论CNV-seq技术可以检测出大片段缺失或重复的DMD基因变异,但需结合家系及常规基因检测进一步分析并验证其致病性,特别是包含DMD基因第1或第79外显子的重复变异,以免误诊。     

SRD5A2基因变异致5α-还原酶2型缺乏症的临床和遗传学研究

目的探讨5α-还原酶2型缺乏症(5α-RD2)的临床表型和遗传学特点。方法回顾性分析3例5α-RD2患者, 总结临床资料。应用染色体核型分析、全外显子测序(WES)、Sanger测序、生物信息学分析对患者进行遗传学检测, 采用SWISS-MODEL和PyMoL软件对新变异体进行蛋白质同源建模和结构分析。结果 3例患者社会性别均为女。例1, 6岁因外生殖器发育异常就诊。例2和3, 15岁因原发闭经就诊, 青春期第二性征男性化。3例患者外生殖器不同程度男性化, 阴蒂肥大似小阴茎伴隐睾。例2行hCG激发试验, 睾酮/双氢睾酮比值为17.4。3例患者均为46, XY核型, WES均检测到SRD5A2基因变异, 基因型分别为p.Gln6Ter/p.Arg227Gln、p.Gln6Ter/p.Pro250Ala和p.Arg227Ter/p.His89Tyr, 经父母验证, 均为复合杂合变异。Pro250Ala为新发现的变异, 根据ACMG指南评为疑似致病变异, 蛋白质建模分析表明变异体可能影响5α-还原酶2型与NADPH的结合。例1选择男性性别, 行腹腔镜下双侧睾丸下降固定术。例2选择女性性别, ...     

Y染色体拷贝数变异致性发育异常的临床和遗传学特点

目的探讨Y染色体拷贝数变异致性发育异常(DSD)患儿的临床表型和遗传学特点。方法回顾性分析郑州大学第一附属医院2018年1月至2022年9月收治的3例Y染色体拷贝数变异致DSD患儿的临床资料, 应用染色体核型分析、全外显子测序(WES)、低深度全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq), 荧光原位杂交(FISH)和性腺组织病理活检技术对患儿进行临床分析和遗传学检测。结果 3例患儿就诊年龄分别为12、9、9岁, 均表现为身材矮小和性腺发育不良, 社会性别均为女。均为正常女童外阴, 例1伴脊柱侧弯, 余未见明显异常。3例患儿均报告为46, XY核型, WES未发现相关基因变异。CNV-seq确定例1为47, XYY, +Y(2.12), 例2为46, XY, +Y(1.6), 即Y染色体拷贝数增加。FISH最终确定2例患儿Yq11.2附近断裂后发生重组, 为携带拟双着丝粒Y染色体idic(Y)的嵌合体DSD。例1核型重新诠释为mos 47, X, idic(Y)(q11.23)×2[10]/46, X, idic(Y)(q11.23)[50], 例2为45, XO[6]/46, X, idi...