HER-2阳性和阴性乳腺癌中差异表达蛋白的定量蛋白质组学初步研究

目的：通过建立人表皮生长因子受体-2（HER-2）阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱寻找二者间的差异表达蛋白,为乳腺癌患者提供新的预后指标和治疗靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量（iTRAQ）技术建立 HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱,分离并鉴定两组乳腺癌的差异表达蛋白,对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释和分类 GO 分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果应用 iTRAQ 对乳腺癌组织进行蛋白组学分析,鉴定出 HER-2阳性和阴性组有差异表达的蛋白4999种,以 HER-2（＋）／HER-2（－）≥3为上调标准,确定 HER-2阳性组上调蛋白119种。以 HER-2（＋）／HER-2（－）≤0．5为下调标准,HER-2阳性组下调蛋白47种。GO 分析结果显示 HER-2阴性和阳性乳腺癌的差异表达蛋白的分子功能、生物过程、细胞组成较为复杂,并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG 通路分析发现部分差异表达蛋白涉及168条信号通路。结论 HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路。     

三阴性与三阳性乳腺癌定量蛋白质组学和生物信息学比较研究

目的：雌／孕激素受体（estrogen receptor／progesterone receptor,ER／PR）和癌基因人表皮生长因子受体2（hu-man epidermal growth factorreceptor2,HER2）与乳腺癌的发生和发展密切相关,其表达状态是乳腺癌分子分型、治疗方案选择和预后预测的重要依据。为了深入探讨 ER／PR／HER2在乳腺癌发生和恶性演进中的意义及相关机制,拟建立ER／PR／HER-2阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱,寻找 ER／PR／HER-2阴性和阳性乳腺癌中差异表达蛋白,为乳腺癌患者提供新的预后预测指标和治疗新靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量（isobaric tags for rela-tive and absolute quantitation,iTRAQ）技术建立 ER／PR／HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱,鉴定2组乳腺癌的差异表达蛋白,对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、基因本体论分类分析（gene ontology classification analysis,GO 分析）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of gene and genome,KEGG）通路分析。结果应用 iTRAQ 蛋白质组学技术对乳腺癌组织进行了蛋白组学分析,鉴定出 ER／PR／HER-2阳性和阴性组间有差异表达的蛋白4999种,以 ER／PR／HER-2阳性∶ER／PR／HER-2阴性≥3为上调标准,确定 ER／PR 阳性组上调蛋白73种。以 ER／PR／HER-2阳性∶ER／PR／HER-2阴性≤0．5为下调标准,ER／PR／HER-2阳性组下调蛋白58种。GO 分析结果显示,ER／PR／HER-2阴性和阳性乳腺癌差异表达蛋白的分子功能、生物过程和细胞定位较为复杂,并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG 通路分析发现,部分差异表达蛋白涉及200条信号通路。结论 ER／PR／HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路,可能与 ER／PR／HER-2的表达状态有关。     

上皮细胞黏附分子表达与乳腺癌淋巴结转移的相关性

目的 探讨上皮细胞黏附分子(Ep-CAM)在乳腺癌中的表达及意义.方法 收集经病理学确诊的乳腺癌新鲜组织标本23例及配对的淋巴结转移灶.应用同位素标记的相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质组学技术筛选及鉴定乳腺癌原发灶和淋巴结转移灶的差异表达蛋白,在4例新鲜乳腺癌原发灶组织和配对淋巴结转移灶中进行Western blotting检测Ep-CAM的表达.采用免疫组织化学法检测252例乳腺病变标本中Ep-CAM的表达.结果 定量蛋白质组学检测结果显示乳腺癌原发灶和淋巴结转移灶存在差异表达蛋白,其中Ep-CAM在转移灶的表达高于原发灶,Western blotting显示Ep-CAM在转移灶的表达(1.46±0.22)高于原发灶(1.16±0.09),变化趋势与蛋白质组学结果一致.免疫组织化学检测结果显示,Ep-CAM在淋巴结转移灶中的阳性表达率(93.16％,109/117)显著高于无淋巴结转移的乳腺癌原发灶(72.73％,64/88),差异有统计学意义(x2=15.921,P=0.000);有淋巴结转移的乳腺癌原发灶Ep-CAM阳性表达率为72.65％(85/117),较配对淋巴结转移灶阳性表达率低,差异有统计学意义(P=0.001).结论 Ep-CAM在乳腺癌原发灶和淋巴结转移灶呈差异表达,该蛋白可能与乳腺癌淋巴结转移有关.     

微管相关蛋白在乳腺癌中的表达及作用

近年来许多与乳腺癌相关的微管相关蛋白（MAP）被发现或在乳腺癌治疗中有了更深入的研究。末端结合蛋白1（EB1）蛋白能促进乳腺癌细胞的增殖,对乳腺癌具有致癌作用并影响乳腺癌治疗的化疗敏感性。含有 MAP7功能域的蛋白3（Mdp3）表达在乳腺癌上皮细胞中,对其生长和转移具有重要作用。核仁纺锤体相关蛋白（NuSAP）基因在乳腺癌组织中的表达上调,可作为乳腺癌生物标志物。Tau 蛋白表达水平与雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）及人类表皮生长因子受体-2（HER-2）表达水平相关,其对紫杉醇化疗和内分泌治疗患者疗效的影响仍具有较大争议性。