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α粒子诱发 BEP2D细胞转化过程中肺癌相关基因表达的 cDNA Microarray研究 总被引:4,自引:1,他引:3
目的:探讨辐射诱发人支气管上皮细胞(BEP2D)转化过程中肺癌相关基因的表达。方法:用Cartesian PixSys5500cDNA Microarray点样仪将60个肺癌相关基因以微阵列形式点布于醛基化的玻璃片上。提取α离子辐射前BEP2D细胞(原代)和α粒子辐射后20代、35代细胞总RNA,经长片段反转录和线性扩增标记成荧光探针后与微阵列中cDNA进行杂交。结果:原代细胞中检测到40个基因表达;20代检测到47个基因表达;35代检测到20个基因表达。所检测的基因中,抑癌基因的mRNA丰度的原代和20代后细胞中急剧下降;大多数癌基因的表达丰度在20代以后细胞中仅轻微下降;生长因子类基因大都在20代细胞表达。结论:在辐射诱发的人支气管上皮转化细胞中,抑癌基因的失活可能与细胞恶化有关,癌基因及生长因子类基因可能促进了细胞的转化。 相似文献
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α粒子诱发人支气管上皮细胞恶性转化不同时期差异表达基因cDNA文库的构建 总被引:7,自引:0,他引:7
目的: 建立α粒子诱发人支气管上皮细胞恶性转化不同时期差异表达基因的文库.方法:抑制消减杂交法(SSH).结果:建立了3个人支气管上皮细胞恶性转化不同时期差异表达基因的cDNA文库.其中,A差减文库(永生化人支气管上皮细胞BEP2D的cDNA为tester,α粒子照射BEP2D细胞后35代恶性转化细胞R15Hp35的cDNA为driver)有416个克隆,B差减文库(α粒子照射BEP2D细胞后20代转化细胞R15Hp20的cDNA为tester,BEP2D和R15Hp35细胞的cDNA混合后为driver) 有301个克隆,C差减文库(R15Hp35细胞的cDNA为tester,BEP2D细胞的cDNA为driver)有586个克隆.,对文库中70个cDNA克隆单向测序后发现:61个cDNA为己知基因,9个cDNA在GenBank中无法查到对应的同源序列,可能代表了新基因.结论:3个差减文库的cDNA可能代表了α粒子诱发人支气管上皮细胞恶性转化不同时期差异表达的基因,此为进一步研究α粒子诱导肺癌发生的分子机制奠定了基础. 相似文献
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目的 筛选肺癌细胞恶性转化不同时期差异表达的基因,以期用于肺癌的诊断。方法 应用抑制消减杂交技术(SSH)、测序、cDNA芯片(cDNA Miemarray)、northern blot。结果 利用SSH建立了永生化人支气管上皮细胞(BEP2D)恶性转化不同时期差异表达基因的cDNA文库,其中,A消减文库(BEP2D细胞的cDNA为tester,α粒子照射BEP2D细胞后35代恶性转化细胞R15Hp35的cDNA为driver)有416个克隆,B消减文库(α粒子照射BEP2D细胞后20代转化细胞R15Hp20的cDNA为tester,BEP2D和R15Hp35细胞的cDNA混合后为driver)有301个克隆,C消减文库(R15Hp35细胞的cDNA为tester,BEP2D细胞的eDNA为driver)有586个克隆。对文库中107个克隆单向测序发现:19个克隆在GenBank中没有查到对应的同源序列,其它88个克隆共代表了76个不同的已知基因。然后,将3个文库中全部克隆的cDNA制作成cDNA芯片,用该芯片筛选了15例肺癌组织、5例肺癌旁组织和其他8种癌组织(肝癌、胃癌、食管癌、乳腺癌、白血病、子宫内膜癌、脑神经角质瘤和结肠癌)中mRNA的表达差异。结果,获得肺癌组织高于肺癌旁组织表达的eDNA26个,肺癌旁组织高于肺癌组织表达的31个,2者高于其他8种癌组织的分别为:肺癌旁组织中63个,肺癌组织中87个。将这208个具较大差异表达的基因重新制作成cDNA芯片,再选用临床上同一鳞癌病人鳞癌和鳞癌癌旁组织各1例与该芯片杂交,发现这些筛选出的基因的确在癌组织和癌旁组织中存在较大差异。结论 这些初步筛选出的差异表达基因有望成为肺癌诊断的侯选基因。 相似文献
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Transforming growth factor-b (TGF-b) is a potent natural antiproliferative agent that plays an important role in suppressing tumorigenicity. Disruption of TGF-b signaling is implicated in numerous cancers, such as colon-rectal cancer, pancreatic cancer, lung cancer, skin cancer, et al. TGF-b signaling occurs via ligand-initiated complex formation of a heteromeric serine-threonine kinase receptor complex, following which the TGF-b type I receptor is phosphorylated by the constitutively act… 相似文献
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Expression changes of certain critical genes play an important role in the development of tumorigenesis, for example, if the gene encoding a tumor suppressor is depressed. Identification of the expression changed genes in the malignant transformed cells can provide some useful information to elucidate the mechanism of tumorigenesis. BEP2D is a HPV18 immortalized human bronchial epithelial cell line. The transformation cell model was generated from BEP2D by 1.5 Gy of alpha-particles exposu… 相似文献
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目的 筛选并鉴定α粒子辐射诱发永生化人支气管上皮细胞(BEP2D)恶性转化不同时期差异表达的基因。方法 抑制消减杂交(SSH),cDNA芯片。结果 利用SSH构建了BEP2D细胞3个恶性转化不同时期差异表达基因的文库。BEP2D细胞的文库有416个克隆,R15H20细胞的文库有301个克隆,R15H35细胞的文库有586个克隆,经cDNA Microarray验证发现:BEP2D细胞文库来源的芯片与3代细胞探针杂交后的阳性信号率为90.4%、21.6%和19.7%;R15H20细胞文库来源的芯片的阳性信号率为8.6%、93.8%和31.6%:R15H35细胞文库来源的芯片的阳性信号率为23.5%、18.2%和90.7%。结论 联合应用SSH和cDNA Microarray是筛选和鉴定不同样本中差异表达基因的快速和有效方法;经cDNA Microarray鉴定出的3个文库中差异表达的cDNA可能代表了α粒子诱发人支气管上皮细胞恶性转化相关的基因。 相似文献
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