基于基因组突变数据分析肝癌预后分子标志物

目的  探讨肿瘤突变负荷（tumor mutational burden，TMB）及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）患者预后的相关性。 方法 从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子测序数据，从ICGC数据库获取JP队列 394例及FR 队列250例HCC患者全基因组测序数据。采用生存分析研究TMB、关键信号通路的基因变异与HCC患者预后的关系。结果 TCGA队列、JP队列、schulze2015队列和FR队列中，对数转换后的TMB与年龄均呈正相关（P<0.001）；在schulze2015队列中，对数转换后的TMB与肿瘤大小呈正相关（r=0.204，P=0.002）。在TCGA队列中，与低TMB组比较，高TMB 组HCC患者的OS（P<0.001）及DFS（P=0.088）均明显降低，高TMB组HCC患者的死亡风险是低TMB组的2.156倍（P<0.001）。JP队列和FR队列均未发现TMB与OS及DFS有统计学意义。TCGA队列、JP队列和FR队列中，细胞周期调控通路基因变异的HCC患者中位DFS和中位OS均低于无变异的患者（P<0.05），而复发风险和死亡风险均高于无变异患者（P<0.05）。结论 肿瘤突变负荷高和细胞周期调控通路的基因变异的HCC患者预后较差。