医护人员接种新冠疫苗后相关抗体情况的观察

2、目的 观察医护人员接种新冠疫苗后产生针对S蛋白的中和抗体,及针对核酸阴性的疑似病例的补充检测的IgM、IgG抗体的情况,评价SARS-CoV-2病毒疫苗免疫效果及相关抗体的临床应用。方法 选取2020年12月至2021年2月我院接种新冠疫苗的医护人员62名作为接种疫苗组,同期未接种疫苗的健康体检医护人员27名作为未接种疫苗组,2020年2月至6月来我院复诊的新冠肺炎康复患者为疾病对照组。采用两种酶联免疫法试剂检测3组血清中新冠病毒中和抗体滴度水平,两种化学发光试剂检测3组血清中新冠病毒抗体IgM和IgG水平,并分析4种方法的抗体结果。结果 (1)接种疫苗组a～d4种方法的阳性率分别是91.94%、88.71%、22.58%、93.55%;未接种疫苗组4种方法阳性率均为0;疾病对照组用a和b方法阳性率均为100%。(2)疫苗接种组根据接种第二剂后的抽血时间分为0～30d和31～60d两组。疫苗接种0～30d组a方法检测的滴度水平与接种后有无症状差异具有统计学意义,与年龄、性别差异无统计学意义;b和c的滴度水平与性别、年龄、接种后有无症状差异均无统计学意义;d方法的滴度水平和年龄、接种...     

依据CNAS-GL039在Bio-rad CFX96荧光定量PCR仪进行SARS-CoV-2核酸检测的性能验证

目的 对本实验室实时荧光聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测SARS-CoV-2进行方法学评价,建立本实验室分子诊断定性检验程序性能验证的标准化方法,为日后性能验证工作提供参考.方法 依据CNAS-GL039和厂家说明对SARS-CoV-2核酸检测进行符合率、精密度、检测限、交叉反应和抗干扰能力的验证,实验结果在厂家声称的范围内或是满足本实验室的执行标准为性能验证通过.结果 国家临检中心室间质评10个质控样本的定性检测结果均符合,符合率验证通过;批内精密度变异系数(CV)为ORF1ab基因:1.11％、N基因:0.95％;批间精密度变异系数(CV)为ORF1ab基因:0.89％、N基因:1.99％、阴性内参:0.54％;变异系数满足厂家声明的≤5％;精密度验证通过;定值质控品S1(2.01×103 copies/mL)稀释至厂家声明的检测限500 copies/mL;靶基因检出率100％,检测限符合要求;病原体交叉反应检测结果均为阴性,干扰物质检测结果均为弱阳性,分析特异性符合要求.结论 SARS-CoV-2核酸检测的符合率、精密度、检测限、交叉反应和抗干扰能力的验证,结果均符合检测要求.     

基于GEO数据库筛选胃肠道急性移植物抗宿主病相关基因及其致病机制分析

目的 筛选胃肠道急性移植物抗宿主病发生发展过程中的关键基因,探索其潜在致病及调控机制并初步评估其临床应用价值。方法 基于基因表达综合（gene expression omnibus,GEO）数据库下载异基因造血干细胞移植后患者直肠乙状结肠黏膜组织RNA-Seq数据集GSE168116,通过R软件limma包筛选胃肠道急性移植物抗宿主病患者黏膜组织表达水平上调基因;利用clusterProfiler包进行功能富集分析;基于String数据库和Cytoscape软件进行蛋白质互作网络构建及其关键子网络定位挖掘关键基因;通过Wikipathway插件进行代谢通路分析以探索其生物学功能。结果 在胃肠道急性移植物抗宿主病患者黏膜组织筛选表达水平上调基因132个;上述基因主要富集于机体防御反应、机体免疫系统相关进程以及细胞因子、干扰素及趋化因子相关免疫信号通路;在蛋白质互作网络中定位以STAT1,CXCL10,IFIT3,CXCL8,ISG15,OAS2,OASL,MX2,IFI44L及IFI6为核心基因的关键子网络;CXCL9,CXCL10和CXCL11等趋化因子配体编码基因广泛参与炎症发展进程...