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胃癌和癌旁黏膜与距癌远端切缘胃黏膜基因表达谱差异的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的用基因芯片技术研究胃癌 (T)和癌旁黏膜 (P)与距癌远端切缘胃黏膜 (C)基因表达谱差异,筛选与早期癌变相关的基因.方法利用国际学术界公认的标准化 Affymetrix公司生产的 U133A基因芯片分别检测 T和 P及 C基因表达谱,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析.结果 (1)T与 C比较差异 4倍以上共有 766个基因,其中表达上调 [信号比的对数值 (SLR)〉2]有 530个,表达下调 (SLR〈- 2)有 236个;(2)P与 C比较差异 4倍以上共有 64个基因,其中表达上调 (SLR 〉2)有 50个,表达下调 (SLR〈- 2)有 14 个;(3)T和 P同时与 C比较 (T、 P两者之一差异 4倍以上 )共有 143个相同的基因,其中表达上调 (SLR 〉2)有 108个,表达下调 (SLR〈- 2)有 35个.结论癌旁黏膜在基因表达水平上显示 143个基因与胃癌表达的基因相同,提示这些基因可能与早期胃癌癌变的启动和演化有关. 相似文献
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用基因芯片筛选胃黏膜癌变相关基因 总被引:2,自引:1,他引:2
目的 用基因芯片技术筛选与胃黏膜癌变相关的基因。方法 利用Affymetrix公司生产的U133A基因芯片,对癌旁黏膜和切缘正常胃黏膜基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果 (1)癌旁黏膜与正常胃黏膜比较差异3倍以上共有150个基因,其中表达上调[SLR(信号比的对数值)〉1.5]有130个,表达下调(SLR〈-1.5)有20个。从表达差异的基因功能分类看,以酶和酶调控子活性改变最多(28,占18.7%);其次是与核酸结合活性相关基因(17,占11.3%);第三是与信号传导活性相关基因(15,占10%);第四是与蛋白结合活性相关基因(13,占8.7%)。除了40个功能未知的基因占总数26.7%外,以上4大类共占基因总数的48.7%。(2)癌旁黏膜(P)和胃癌(T)同时与正常胃黏膜比较,有71个相同的基因表达差异。其中表达上调(癌旁上皮SLR〉1.5)有61个,表达下调(癌旁上皮SLR〈-1.5)有10个。71个同时出现癌旁黏膜和胃癌的基因在染色体定位,发现19号染色体异常基因最多有11个;其次是1、2、16、17号染色体,分别是6个;5、14、22号和Y染色体未发现异常的基因。结论 71个癌旁黏膜与胃癌同时出现、表达相同的基因可能与早期胃癌的演化有关。酶和酶调控子活性、核酸结合活性、信号传导活性和蛋白结合活性4大类相关基因是研究胃癌发生的重要基因。19号染色体及1、2、16、17号染色体是研究胃癌发生的重要基因位点。 相似文献
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目的 了解胃癌细胞增殖和P-糖蛋白(P-gp)表达水平的临床意义。方法 采用流式细胞术(FCM)检测95例胃癌手术标本P-gp、DNA指数(DI)、S期细胞百分率(SPF)和细胞增殖指数(PI),结合临床病理资料进行相关性分析。结果 胃癌P-gp表达阴性39例(41.1%);P-gp表达阳性有56例(58.9%),其中轻、中度表达有29例(30.5%),重度表达有27例(28.4%)。95例胃癌中非整倍体肿瘤48例(50.5%),非整倍体肿瘤SPF和PI显著高于二倍体肿瘤(P〈0.01),非整倍体肿瘤P-gp表达低于二倍体肿瘤,但差异无统计学意义。胃癌低分化组与中分化组的肿瘤倍体例数比较有非常显著性差异(P〈0.01);胃癌中-低分化组与中分化组的肿瘤倍体例数比较有非常显著性差异(P〈0.01)。以胃癌发生部位、肿瘤大小、临床分期和有无淋巴结转移进行分组比较SPF、PI、P-gp和倍体关系,均无显著性差异。结论 用FCM检测胃癌P-gp表达水平和DNA倍体可为临床选择适当的化疗方案提供参考依据。 相似文献
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人卵巢癌细胞系HO-8910的建立及其生物学特性 总被引:11,自引:0,他引:11
以分化差的卵巢乳头状浆液性囊腺癌患者腹水为材料,建立了体外培养的人卵巢癌细胞系HO-8910。细胞已传代130次,生长良好;组织学和超微结构均显示该细胞具有恶性上皮细胞特征;染色体数目分布在45~300之间,众数为54(42%),流式细胞仪检测DNA指数为1.45,均呈超二倍体;该细胞能分泌性激素,并有激素受体存在;裸鼠移植瘤与患者原始肿瘤病理形态基本一致;细胞经液氮冻存后复苏良好。该细胞系的建立为卵巢癌防治研究提供了体外实验材料。 相似文献
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【摘要】 目的 进一步探索影响胃癌患者生存因素的有用指标。方法 采用流式细胞仪(FCM)和免疫组织化学(IHC)技术分别检测98例胃腺癌P- 糖蛋白(P-gp)、CD44、CD25和C-erbB-2、p16、p53抗体表达水平,并结合临床病理和随访资料进行相关性分析。结果 以随访3年内死亡60例(其中失访11例按死亡计)为死亡组,生存3年以上38例(38.3 %)为生存组。死亡组临床Ⅰ~Ⅱ期5例,Ⅲ~Ⅳ期55例;淋巴结无转移3例,转移57例;无瘤栓或累及神经21例,有瘤栓或累及神经39例;无浆膜浸润6例,有浆膜浸润54例。与相应生存组比较分别为21、17例;17、21例;26、12例;12、26例。均显示差异有统计学意义(P<0.01);死亡组肿瘤组织学分级中分化9例,低分化51例;瘤体≤5 cm 18例,>5 cm 42例;肿瘤1个部位累及16例,2~3个部位累及44例;血型A 10例,O 31例与相应生存组比较分别为14、24例;21、17例;18、20例;14、13例,均显示差异有统计学意义(P<0.05)。而胃癌相关基因C-erbB-2、p16、p53、P-gp、CD44、CD25的表达在两组间比较均显示差异无统计学意义。结论 胃癌患者临床分期、淋巴结转移、瘤体及神经受侵、浆膜浸润、瘤细胞分化程度、瘤体大小和累及范围是影响患者生存的重要因素。胃癌相关基因表达的确切意义和作用尚有待更多资料的研究。 相似文献
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In this paper, gene chip technique was used to analyze the difference of gene expression patterns in highly metastatic human ovarian tumor cell line HO-8910PM and in normal ovarian epithelial cells to explore the tumor-associated gene-cluster and its function in the process of occurrence an development of ovarian carcinoma. It will be helpful to comprehensively understand the molecular mechanism of cell transformation, to provide the molecular markers and target genes for clinical diagnosis a… 相似文献
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高低转移人卵巢癌细胞系基因表达谱差异 总被引:8,自引:2,他引:6
目的 用基因芯片技术研究高低转移人卵巢癌细胞系(HO-8910PM和HO-8910)基因表达谱差异,筛选与转移相关的基因。方法 分别抽提高低转移人卵巢癌细胞和对照正常卵巢上皮的总RNA并纯化mRNA;分别将等量的mRNA逆转录合成以图像,用软件对扫描图像进行数字化处理和分析。结果 HO-8910细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有355个基因;HO-8910PM细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有323个基因。HO-8910PM与母系HO-8910比较差异2倍以上共有163个基因,差异3倍以上共有21个基因。结论 两株人卵巢癌细胞与正常卵巢上皮细胞基因表达谱存在差异,提示这些基因与卵巢癌的发生和发展有关;HO-8910PM与HO-8910比较存在差异的基因可能与高转移特性相关。 相似文献
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食管癌和癌旁上皮基因表达谱差异 总被引:1,自引:1,他引:0
目的:用基因芯片技术研究食管癌和癌旁组织基因表达谱差异,筛选与早期癌变相关的基因,方法:分别抽提食管癌组织,癌旁组织和正常食管上皮的总RNA并纯化mRNA,将各mRNA逆转录合成以Cy5和Cy3标记的cDNA-一链做探针,分别混合后在2张含有4096条双点人类全长基因的芯片上进行杂交,用扫描仪扫描芯片荧光信号图像,用软件对扫描图像进行数字上处理和分析,结果:食管癌与正常食管上皮比较差异2倍以上共有135个基因,癌旁上皮与正常食管上皮比较差异2倍以上共有31个基因,其中13个基因与食管癌中出现相同,结论:通过三者的基因谱平行比较提示食管癌与正常食管上此比较差异2倍以上的135个基因可能与食管癌的发生和发展有关,癌旁上皮与正常食管上皮比较差异2倍以上的31个基因可能与早期食管癌变的启动和演化有关。 相似文献