基于数据挖掘探讨GLYATL1因子对前列腺癌的影响

目的探讨Glycine-N-Acyltransferase Like 1(GLYATL1)因子对前列腺癌(prostate cancer,PCa)的影响。方法从The Human Protein Atlas中获取GLYATL1的PCa免疫组化结果。TCGA、GEPIA分析GLYATL1与PCa临床参数的意义以及预后关系。利用STRING绘制GLYATL1相关蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),进一步与关联基因进行相关性分析。应用SPSS 25.0进行数据统计分析,Graphpad prism 5.0进行绘图。结果免疫组化显示GLYATL1高表达于癌组织且定位于细胞质。TCGA数据表明GLYATL1的表达在PCa组织、病理T分期和格林森评分有显著差异(P0.001)。GEPIA显示低表达的GLYATL1无瘤生存率显著高于高表达的GLYATL1PCa患者(Logrank p=0.016)。关联基因相关分析GLYATL1与PAOX呈正相关(r=0.2746,P 0.0001),同样的正相关性在pT分期(P0.0005)和格林森评分参数(P0.005)中也被观察到。结论 GLYATL1在PCa中高表达,可能与PAOX通过互相调控基因mRNA或蛋白表达参与PCa的发展。GLYATL1具有潜在疾病预测和生存预后判断作用。     

基于ChinaPca全基因组数据和基因表达量探讨LRP1对前列腺癌发病的影响

目的 探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白-1（low density lipoprotein receptor-related protein-1,LRP1）基因对前列腺癌（prostate cancer,Pca）发病的影响。方法 在ChinaPca GWAS数据中对9个LRP1的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）进行前列腺癌易感性验证;取前列腺癌组织标本12例、癌旁正常组织18例和前列腺炎组织4例进行免疫组化检测;对TCGA和GTEx数据库的LRP1基因表达数据进行分析;在String网站构建LRP1基因的交互作用网络。结果 ChinaPca GWAS数据分析显示,LRP1基因的rs11172113位点可能是前列腺癌遗传易感位点（P=0.083）,TC基因型与Pca发病风险有关（OR=1.267,95%CI：1.066~1.505,P=0.007）。免疫组化检测和TCGA数据库分析结果显示,LRP1在前列腺癌组织和癌旁正常组织中的表达量差异无统计学意义（P>0.05）,整合TCGA和GTEx数据库数据后LRP1在前列腺癌组织中的表达降低（P＜0.05）。交互作用网络显示,LRP1与前列腺癌通路相关基因PLAT、PDGFB、PDGFRB有关联。结论 LRP1基因rs11172113位点可能是前列腺癌的遗传易感位点。LRP1基因在前列腺癌组织中呈低表达,可能通过调节PLAT、PDGFB和PDGFRB基因表达调控前列腺癌相关通路而导致前列腺癌发病。