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藏茵陈川西獐牙菜转录组SSR信息分析 总被引:3,自引:1,他引:2
利用MISA(MicroSAtelite)软件对藏茵陈川西獐牙菜转录组序列68 787条跨叠群(contigs)进行简单重复序列(SSR)位点的挖掘,发现5 099条序列中含有5 610个SSR位点,发生频率为7.41%,共有220种重复基元,平均每12.60 kb出现1个SSR位点。三核苷酸重复基元SSR出现频率最高(45.99%),其次是二核苷酸(41.62%)。AT/TA和AAT/TTA是二、三核苷酸中的优势重复基元。藏茵陈川西獐牙菜转录组SSR以5~10次重复为主,基序长度主要集中于12~30 bp。在藏茵陈川西獐牙菜转录组中注释的30 651个contigs中,有1 447个SSRs位于编码区,主要以三核苷酸重复为主(928,64.13%)。藏茵陈川西獐牙菜转录组SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论表明这些转录组SSR具有较高的可用性。该文通过对藏茵陈川西獐牙菜转录组资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发藏茵陈川西獐牙菜的SSR功能性标记提供了丰富的候选序列。 相似文献
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目的:分析贵州省疾病预防控制中心2003~2016年申报国家自然科学基金项目申请及立项情况,探讨如何在组织科研课题申报过程中提高项目标书的数量和质量来提高项目命中率。方法:对2003~2016年国家自然科学基金项目申请、立项情况进行回顾与统计分析。结果:2003~2016年申报国家自然科学基金项目数共9项,立项4项,资助率44.4%;立项中博士研究生学历2人,硕士研究生学历1人;10个业务部门中2个部门获资助。结论:应进一步加强科研管理工作,充分发挥科研管理职能,提高国家自然科学基金项目标书数量和质量,最终提高项目命中率。 相似文献
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