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目的研究饮食诱发的高脂血症长爪沙鼠模型的关键基因及代谢性炎症通路调控网络。方法利用RNA-Seq测序技术及生物信息学技术对正常组与模型组两个RNA池进行测序和分析。结果 De novo拼接后获得有效长爪沙鼠基因47 522个(即≥100 bp的unigene),大小26.9 Mb,与GenBank中现有的基因比对结果表明,约82.53%的序列与基因组上的外显子序列同源;诱发高脂血症动物与正常动物之间共获得21 125个差异基因,其中16 087个下调,5 038个上调,模型组相对于正常组存在显著的下调关系(P0.01)。其中与长爪沙鼠高脂血症代谢性炎症密切相关的通路有8个(P0.01),这8个通路所表达的基因中有15个与免疫和炎症相关的基因显著下调(P0.01)。结论 RNA-Seq测序和生物信息技术可作为研究高脂血症动物模型的整体基因转录的工具,筛选出的关键基因和通路可作为研究的候选基因或操作靶点。 相似文献
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目的 为了弄清饮食诱发的高脂血症长爪沙鼠模型的关键基因及代谢性炎症通路调控网络。方法 利用RNA-Seq测序技术及生物信息学技术对正常组与模型组两个RNA池进行测序和分析。结果 De novo拼接后获得有效长爪沙鼠基因47522个(即>=100bp的unigene),大小26.9Mb,与GenBank上现在的基因比对结果表明,约82.53%的序列与基因组上的外显子序列同源;诱发高脂血症与正常动物之间共获得21,125 差异基因,其中16087个下调 ,5038个上调,总体上模型组相对于正常组存在较显著的趋势性下调关系(p<0.01)。其中与长爪沙鼠高脂血症代谢性炎症密切相关的通路有8个(p<0.01),这8个通路所表达的基因中有15个与免疫和炎症相关的基因均显著下调(p<0.01)。结论 RNA-Seq测序和生物信息技术可以作为研究高脂血症动物模型的整体基因转录情况的有力工具,本实验筛选出的关键基因和通路可作为下一步研究的候选基因或操作靶点。 相似文献
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骨桥蛋白(OPN)是一种分泌性磷酸化糖蛋白,广泛分布于骨、肾、膀胱、内耳、胆囊、胰腺、蜕膜、胎盘等组织,在骨细胞、上皮细胞、巨噬细胞、活化T细胞、平滑肌细胞、内皮细胞均有表达,也存在于血液、尿液、乳汁、胆汁等体液中。研究表明OPN可促进细胞黏附、浸润和迁移,参与骨组织矿化与重建、心血管疾病、肿瘤的发生与发展、炎症及损伤修复等病理生理过程。目前OPN在结石形成过程中的作用逐渐受到重视,现就OPN的功能、表达、调控及其与草酸钙结石关系作一简述。 相似文献
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HPLC法测定扶桑花中槲皮素的含量 总被引:1,自引:0,他引:1
目的建立扶桑花中槲皮素的含量测定方法。方法采用HPLC法,色谱柱为Dikma platisil ODS柱(250 mm×4.6 mm,5μm),流动相为甲醇-0.5%磷酸水溶液(体积比30∶70),流速1.0 mL·min^-1,柱温30℃,检测波长360 nm。结果槲皮素进样量在0.041 6-0.416μg范围内与峰面积呈良好的线性关系,平均回收率为98.95%,RSD为1.09%(n=6)。结论该方法操作简便、快速、准确,可用于扶桑花药材的质量控制。 相似文献
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目的:确定HPD300大孔吸附树脂吸附纯化石香薷总黄酮的工艺条件。方法:采用静态吸附和动态吸附分离法,确定石香薷总黄酮的纯化工艺条件。结果:HPD300大孔树脂对石香薷总黄酮有良好的吸附分离性能,其动态吸附分离工艺条件为:石香薷总黄酮上样液(pH=3.0)浓度为5.5 mg/mL,最大吸附量为41.58 mg/g,吸附流速为2.0 mL/min,以8倍柱体积60%乙醇(pH=8.0)洗脱,树脂可重复使用4次。此工艺下石香薷总黄酮的回收率达89.12%,纯度为90.77%。结论:采用HPD300大孔树脂吸附分离石香薷总黄酮简便有效,回收率高。 相似文献
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