ITS2二级结构系统发育信息在茄属药用植物DNA条形码鉴定中的应用价值

ITS2是中药鉴定的核心DNA条形码之一,基于ITS2的中药鉴定方法已被纳入《中国药典》,但分辨力不足仍是制约其推广应用的主要因素,因此需要进一步挖掘其有助于中药鉴定的遗传信息。在细胞内,ITS2以二级结构形式发挥功能,这种结构所蕴含的丰富遗传信息是核酸序列所无法体现的。该研究以茄属Solanum 26个物种的40个样本为研究对象来探究ITS2二级结构在茄属药用植物鉴定中的价值。作者利用Pic XAA-R,MASTR和Loc ARNA软件来比对二级结构,利用RNAstat软件将二级结构信息转为系统发育信息,最后利用最大简约法进行建树分析。研究结果表明将ITS2二级结构转化为系统发育信息后信息位点增加了88.57%,物种关系树上50%,75%,90%以上支持率的支系分别增加了19.05%,66.67%,66.67%,从而很好地解决了茄属几种药用植物的鉴定问题。鉴于以上结果,作者建议将ITS2二级结构信息作为系统发育信息的有益补充加入到目前DNA条形码分析中。