钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌细胞系表达谱及免疫微环境的影响

目的 研究钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌细胞系表达谱的影响,筛选出差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）并对功能基因进行分析和挖掘,以期为钩枝藤抗肺癌的分子机制提供理论依据。方法 将非小细胞肺癌NCI-H1975细胞分为对照组和钩枝藤总生物碱处理组,使用RNA-Seq技术开展全转录组测序,获取DEGs;对DEGs进行基因本体（gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析;筛选差异基因核心模块并分析其影响功能,进一步分析关键基因对非小细胞肺癌生存期的影响;通过分析钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌免疫细胞肿瘤浸润的情况,确定关键基因表达与免疫浸润水平的相关性。结果 对照组和药物组共检测到2976个DEGs,其中药物组664个DEGs上调,2312个DEGs下调。钩枝藤总生物碱对铁死亡、氧化磷酸化、线粒体、溶酶体、细胞间隙连接、核苷酸结合寡聚化结构域（nucleotide binding oligomerization domain,NOD）样受体等介导的信号通路产生重要影响。在DEGs核心模块中,白细胞介素11（interleukin 11,IL11）的高表达可显著影响非小细胞肺癌患者的生存期,是非小细胞肺癌患者不良预后的关键因素之一;角形四肽重复干扰素诱导蛋白3（interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3,IFIT3）、白细胞介素7受体（interleukin 7 receptor,IL7R）、2'',5''-寡腺苷酸合成酶2（2'',5''-oligoadenylate synthetase 2,OAS2）、S-腺苷甲硫氨酸基结构域蛋白2（radicalS-adenosyl methionine domain containing 2,RSAD2）、受体转运蛋白4（receptor transporter protein 4,RTP4）、不育α基序结构域9样（sterile alpha motif domain containing 9-like gene,SAMD9L）、X染色体连锁凋亡抑制蛋白相关因子1（X-linked inhibitor of apoptosis associated factor 1,XAF1）的表达水平影响了非小细胞肺癌组织的纯度和免疫细胞浸润的类型,可能改变非小细胞肺癌的免疫微环境。结论 钩枝藤总生物碱能够影响非小细胞肺癌细胞的转录谱,具有潜在的抗非小细胞肺癌活性作用。