基于铁死亡基因的乳腺癌预后模型构建

目的 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库挖掘与乳腺癌预后相关的铁死亡基因,构建乳腺癌预后模型.方法 下载TCGA数据库中转录组与临床数据,获取与预后相关的在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法构建风险评分模型.将TCGA数据库中获取的患者信息作为模型测试集...     

基于网络药理学的青风藤治疗类风湿关节炎的作用机制研究

目的 应用网络药理学研究方法,探讨青风藤治疗类风湿关节炎(RA)的可能作用机制.方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选青风藤的化学成分,并依据TCMSP数据库的口服生物利用度(OB)和类药性指数(DL)筛选出主要有效活性成分.借助DRAR-CPI分子对接服务器得到有效活性成分的潜在作用靶点.通过Ge...     

热毒宁与血必净“同病异治”新型冠状病毒肺炎的网络药理学作用机制研究

目的:采用网络药理学的方法,研究热毒宁与血必净的活性成分、作用靶点及生物学意义,探讨其“同病异治”新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取热毒宁与血必净的成分和靶点。采用GeneCards筛选COVID-19相关的蛋白,利用Cytoscape软件和STRING分别构建活性成分靶点网络和蛋白相互作用网络。借助Cytoscape的ClueGo工具和分子对接先后进行通路富集分析和验证。结果:网络分析结果表明,两方共有成分包括木犀草素、槲皮素、山奈酚、异鼠李素和植物甾醇等,其中槲皮素、木犀草素和山奈酚对新型冠状病毒产生的主要蛋白酶(3CLpro)有一定的结合能力;血必净中含有65个特有成分,热毒宁中含有24个特有成分。这些成分可能通过血管内皮生长因子A(VEGF-A)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白介素6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、MAPK8等关键蛋白,以及Jak-STAT信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、TGF-β信号通路发挥抗COVID-19的作用。结论:热毒宁与血必净由于组方差异,在抗COVID-19靶点方面既有相同也有不同。本研究通过对其靶点和通路的分析,初步阐明了两方对COVID-19“同病异治”的科学内涵。     

不同产地南五味子和北五味子中2种三萜酸的含量测定

目的 建立HPLC法同时测定五味子中2种三萜酸类成分甘五酸和黑老虎酸的含量,并考察不同产地五味子中甘五酸、黑老虎酸的含量差异,为提高药材质量研究提供依据.方法 色谱柱为Waters Symmetry C18柱(4.6 mm×250 mm,5μm),流动相为甲醇-1％甲酸水(86:14),检测波长220 nm,流速1.0...     

基于数据挖掘的中医药治疗盆腔静脉淤血综合征用药规律研究

[目的]分析中医药治疗盆腔静脉淤血综合征(pelvic congestion syndrome,PCS)的用药规律,为中医药临床诊治PCS提供依据.[方法]检索1994年1月至2019年6月Sinomed、Pubmed、中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)...     

基于网络药理学对降脂护肝胶囊干预脂肪肝的机制研究

目的 应用网络药理学方法,探讨降脂护肝胶囊（JZHG）治疗脂肪肝（FL）的可能机制,为其临床用药提供理论指导。方法 利用TCMSP与TCMID检索JZHG的活性成分和靶点,通过GeneCard与OMIM数据库检索FL的相关靶点,并采用交集法筛选出二者的共同靶点,运用Cytoscape构建“活性成分-靶点”网络,利用STRING软件构建PPI网络。通过 Bioconductor 数据库以及R软件进行GO和KEGG富集分析。结果 根据口服生物利用度和类药性筛选出46种活性成分,从GeneCard与OMIM数据库中筛选靶点7406个。成分靶点与疾病靶点取交集,获得118个共同靶点。这些靶点主要参与氧化应激、细胞凋亡、炎症反应、激素抵抗等生物学过程。其作用机制与PI3K-Akt信号通路,人巨细胞病毒感染和癌症中的微小RNA等信号通路有关。结论 JZHG中的活性化合物干预脂肪肝的机制可能是通过抗氧化应激和抗炎等作用改善脂代谢,降低肝脏脂肪堆积实现的。     

二陈汤对肥胖型多囊卵巢综合征和肥胖型不孕的“异病同治”研究

目的探究二陈汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征和肥胖型不孕的潜在机制,为“异病同治”提供理论依据。方法利用TCMSP数据库获取二陈汤的活性成分与靶点,利用Genecard数据库获取肥胖型多囊卵巢综合征和肥胖型不孕的靶点。利用Cytoscape 3.7.1构建活性成分靶点网络,利用STRING获取蛋白互作网络与核心靶点。利用Cytoscape 3.7.1与线上软件进行GO与KEGG富集分析。结果获得二陈汤成分125个,靶基因218个;肥胖型不孕靶基因2783个,肥胖型多囊卵巢综合征靶基因2962个。二陈汤治疗肥胖型不孕和肥胖型多囊卵巢综合征的共有靶基因117个,体现了“异病同治”的原则;潜在的活性成分包括槲皮素、山奈酚、柚皮素、黄芩苷和刺芒柄花素。蛋白互作网络示STAT3、JUN、AKT1、MAPK3、MAPK1、MAPK14、IL-6和FOS为“异病同治”的核心靶点。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚等成分与JUN具有较好的结合能力。GO与KEGG富集分析显示,AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、内分泌抵抗可能是二陈汤“异病同治”的关键通路。结论二陈汤“异病同治”肥胖型多囊卵巢综合征和肥胖型不孕涉及相同靶点以及通路,可为以后的实验研究提供参考。