基于网络药理学和分子对接技术探讨“半枝莲-山慈菇”抗乳腺癌的作用机制

目的通过网络药理学和分子对接方法探讨"半枝莲–山慈菇"抗乳腺癌的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选半枝莲、山慈菇的有效化学成分及相应靶蛋白。通过DrugBank、Uniprot数据库筛选乳腺癌潜在靶点,运用Cytoscape 3.8.0软件构建"化合物–靶点–疾病"网络图。使用STRING数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,利用DAVID数据库对有效作用靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果共筛选出半枝莲中有效化学成分29个,山慈菇中有效化学成分3个;对应潜在作用靶点517个,乳腺癌靶点118个;将"半枝莲–山慈菇"与乳腺癌的靶点对比,获得8个药物–疾病共同靶点,包括雄激素受体(AR)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-9(CASP9)、雌激素受体α(ESR1)、雌激素受体β(ESR2)、钾电压门控通道亚家族H成员2(KCNH2)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)和钠依赖性血清素转运体(SLC6A4)。GO功能分析得到197个条目,涉及药物代谢等方面。KEGG通路分析得到116个条目,涉及膀胱癌、非小细胞肺癌、胰腺癌、非洲锥虫病、前列腺癌、结直肠癌、子宫内膜癌等通路。结论研究揭示了"半枝莲–山慈菇"抗乳腺癌的关键靶点和涉及的生物学过程及信号通路,并结合分子对接技术,发现其作用是多靶点、多通路的,为今后的分子生物学实验奠定了基础。     

“乳病消片”抗乳腺癌作用机制研究：基于网络药理学和分子对接技术

目的：通过网络药理学和分子对接方法探讨“乳病消片”治疗乳腺癌的作用机制。方法：通过中药系统药理数据库（TCMSP）筛选乳病消片成分及其靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选乳腺癌潜在靶点。通过Cyktoscape 3.8.0软件构建“化合物-疾病靶点”网络图。通过STRING数据库获取蛋白相互作用数据,再将数据导入Cytoscape 3.8.0软件构建PPI网络,并用得分高的基因建立关键子网络。使用R软件对交集靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。借助Chem3D、Pymol、AutoDock等软件进行分子对接。结果：共筛选出485个药物活性成分,相关靶点2 288个,乳腺癌潜在靶点共1 967个,交集靶点143个。通过PPI分析,发现MDM2、TP53、CDKN1A、RB1、ESR、JUN、FOS和CCND1为核心靶点。GO富集分析与氧化应激相关,核心靶点主要富集在内分泌抵抗通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路。分子对接结果表明药物有效成分与核心靶点MAPK3有较强结合力。结论：研究发现,“乳病消片”可通过调控基因表达、细胞凋亡、...