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目的 对薄型子宫内膜大鼠模型差异microRNAs(miRNAs)进行筛选和靶基因预测,并对其进行生物信息学分析。方法 采用95%乙醇宫腔灌注制备大鼠薄型子宫内膜模型,取模型组及正常对照组的大鼠子宫内膜组织进行总RNA提取、RNA质检、文库构建后,使用测序平台为illumina HiSeqTM2500进行高通量测序,以P<0.05的标准筛选差异miRNA,利用miRanda和RNAhybrid得出差异表达miRNA候选靶基因,进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果 共有52个差异miRNA,符合预测要求的有48个差异miRNA,共预测出1530个靶基因。其中表达上调的miRNA为rno-miR-375-3p、rno-miR-292-3p、rno-miR-129-1-3p、rnomiR-129-2-3p、rno-miR-291a-3p等,表达下调的miRNA为rno-miR-144-3p、rno-miR-542-3p、rno-miR-144-5p等,涉及的生物过程主要有肽基-苏氨酸磷酸化修饰、细胞代谢过程调控、树突状细胞凋亡过程的调控;细胞成分主要... 相似文献
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目的 运用高通量测序技术筛选补肾调冲汤干预薄型子宫内膜大鼠模型中差异表达的miRNA,并对其进行生物信息学分析,揭示补肾调冲汤对薄型子宫内膜大鼠的作用机制。方法 制备薄型子宫内膜大鼠模型,使用补肾调冲汤干预,以生理盐水做阴性对照,取两组大鼠子宫内膜组织进行总RNA提取、RNA质检、文库构建后,使用测序平台为Illumina HiSeqTM2500进行高通量测序,以P<0.05的标准筛选差异miRNA,利用miRanda和RNAhybrid得出差异表达miRNA候选靶基因,进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果共有48个差异miRNA,其中包括19个上调,29个下调,共得出2124个靶基因,其中涉及889个生物过程、146个细胞成分、163个分子功能,KEGG信号通路有AMPK信号通路、Ras信号通路、mTOR信号通路、NF-κB信号通路等。结论 补肾调冲汤可能通过调节rno-miR-292-3p、rno-miR-292-5p、rno-miR-291a-3p、rno-miR-291b、rno-let-7c-1-3p、rno-... 相似文献
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