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穿心莲转录组SSR位点信息分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了探讨穿心莲转录组中SSR位点信息及其所在基因的生物学功能,并为开发穿心莲分子标记奠定基础,该研究以穿心莲转录组测序获得的43 683条Unigene为对象,采用Micro SAtellite(MISA)软件分析其中的SSR位点信息,并利用Primer3.0软件对符合鉴定要求的SSR基元设计引物和进行初步验证,同时用Blast软件对含SSR的Unigene进行功能分析。结果显示,在穿心莲转录组中共搜索到14 135个SSR位点,分布于9 973条Unigene中,SSR位点出现频率为32.36%。二核苷酸和三核苷酸是SSR序列中最主要的重复类型,共占SSR总数的75.54%。SSR所包含的重复基元中,AT/AT和CCG/CGG分别是二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元类型。通过设计、筛选,共获得4 740对具有潜在多态性的SSR引物组合,随机挑选的20对引物中有10对可以扩增出与预期大小吻合的条带。通过基因功能注释发现,含SSR的Unigene主要与穿心莲的基础代谢功能相关。以上结果表明,穿心莲转录组中SSR位点出现频率高、类型丰富、多态性潜能较高,同时SSR序列的功能分析也为穿心莲功能基因的定位研究和分子标记辅助育种提供了有利参考。  相似文献   
2.
目的探讨连作对穿心莲植株生长及药材质量的影响。方法以盆栽穿心莲为对象进行连作试验,在栽培周期内测定不同连作年限(连作0~2年)穿心莲植株的生长指标、生理指标、产量及活性成分含量。结果穿心莲植株的株高、叶总面积、叶绿素含量及产量均随着连作年限的增加而增加,连作1,2年与连作0年比较,差异有统计学意义(P0.05);连作后穿心莲花期和果期提前了5~7 d;连作1,2年的穿心莲内酯和脱水穿心莲内酯含量均比连作0年的降低;穿心莲叶片膜脂过氧化程度及抗氧化酶活性测定发现丙二醛(MDA)含量、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)及过氧化氢酶(CAT)的活性均随连作年限的增加而升高。结论连作后的穿心莲长势良好、产量提高,连作胁迫产生的活性氧可及时被酶系统清除,连作对穿心莲的主要障碍效应表现为活性成分含量的降低。  相似文献   
3.
目的研究低电压激发的空气等离子体处理对穿心莲种子萌发、幼苗和植株生长及其抗逆性的影响。方法考察激发电压、处理时间和处理后放置天数等3个因素,以发芽势、发芽率、发芽指数为评价指标,筛选等离子体处理穿心莲种子促进种子萌发的适宜条件;采用优选的条件处理种子后进行发芽和育苗试验,测定出苗率;发芽试验7 d和育苗1个月测定植物的抗氧化酶活性及丙二醛(MDA)含量;在种植2个月时测量株高、叶面积和叶绿素含量。结果 30 V电压处理3 s后放置4~6 d对种子萌发的促进作用明显;该条件处理穿心莲种子发芽势和出苗率分别提高40.2%~54.9%、80%,促进植株后期生长,处理组株高、叶面积和叶绿素含量分别高于对照组101.02%、127.85%、14.04%;提高了幼苗期及植株生长期抗氧化酶活性,其中幼苗期过氧化氢酶(CAT)活性提高12.70%、MDA含量降低10.41%,生长期CAT和过氧化物酶(POD)分别提高33.93%、33.47%。结论等离子体处理提高了穿心莲种子活力,促进幼苗和植株生长,增强植株抗逆性。  相似文献   
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