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微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究 总被引:11,自引:1,他引:10
目的:应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法:按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总DNA并纯化mRNA;将4096种人类基因PCR产物用CartesianPixsys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片;将等量的对照组织和喉鳞癌组织mRNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cNDA-链做探针,混合后杂交上述基因芯片,经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片 相似文献
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基因芯片对PMA激活的血管内皮细胞早期反应基因的研究 总被引:4,自引:1,他引:3
目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,并从中筛查出 ERG。结果 :血管内皮细胞受 PMA作用 6 h后 ,17条基因上调 ,11条下调。数据处理聚类分析表明 17条上调基因中多数 (13/ 17)属蛋白质磷酸酶和转录调控因子基因 ,而下调基因中多数 (9/ 11)为细胞分裂相关基因。结论 :证明PMA激活的人血管内皮细胞早期反应基因主要是转录调控因子和蛋白质磷酸酶基因。 相似文献
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大黄对糖尿病肾病大鼠肾皮质基因表达谱的影响 总被引:13,自引:0,他引:13
目的:研究大黄对糖尿病肾病大鼠肾皮质基因表达谱的影响及分析大黄对糖尿病肾病在基因水平上的作用机制。方法:20只雄性SD大鼠随机分为4组:正常对照组、用STZ诱导的糖尿病肾病组、糖尿病肾病大鼠给予大黄提取物治疗的大黄治疗组和糖尿病肾病大鼠给予安慰剂的阴性对照组。从4组SD大鼠的肾皮质中抽提mRNA,分别用Cy3、Cy5荧光标记,经反转录分别合成正常对照组与糖尿病组、大黄治疗组和对照组动物来源的cDNA探针;同时将Cy2,Cy5荧光标记的cDNA探针等量地与BioDoor基因表达谱芯片杂交,结果与扫描仪扫描并用软件进行分析统计。结果:正常对照组与糖尿病肾病组之间差异表达的基因有335条,占芯片基因总数的8.4%,其中12条基因在糖尿病肾病时表达量明显下降,而323条基因在糖尿病肾病时表达量明显上升。大黄治疗组和阴性对照组之间差异表达的基因有128条,占芯片基因总数的3.3%,其中有8条基因在大黄治疗以后明显上升,而120条基因在大黄治疗以后明显下降。并且,在糖尿病肾病中部分基因的表达变化在大黄治疗后可被逆转。结论:大黄能上调或下调部分差异表达的基因,并在一定程度上能逆转STZ诱导的基因表达谱。 相似文献
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目的探讨肾移植受者的某些细胞因子及其受体基因多态性与术后感染的相关性。方法采用自行研制的细胞因子及其受体单核苷酸多态性检测芯片,分析129例肾移植受者的肿瘤坏死因子(TNF-α)、白细胞介素10(IL-10)、转化生长因子(TGF-β1)、IL-4、IL-6及其受体的21个位点的基因多态性分布情况,并按照患者术后是否发生感染进行分组比较。结果5种细胞因子及其受体单核苷酸多态性在感染组和非感染组中分布明显不同,分别是基因型IL-6R(-183GG、G/A)、IL-10(-824C/T,-597C/A)及TNF-α(-308GG、G/A);等位基因为IL-10R1(1112G/A)、IL-6R(-183G/A)、IL-4R(1902A/G)、TNF-α(-308G/A)及TGF-β1( 869T/C)。结论基因型IL-6R(-183GG)、IL-10(-824C/T,-597C/A)及TNF-α(-308GG),等位基因IL-4R(1902A)、IL-6R(-183G)、IL-10R1(1112G)、TNF-α(-308G)及TGF-β1( 869C)是肾移植后感染的易患因素;而基因型IL-6R(-183G/A)和TNF-α(-308G/A)可能为移植后感染的非易患因素。 相似文献
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裸鼠高致瘤性K562-n细胞系代谢相关基因表达变化的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 探索K5 6 2和K5 6 2 n细胞在裸鼠体内致瘤性不同的分子生物学机制。方法 应用基因芯片技术 ,检测K5 6 2细胞和K5 6 2 n细胞的差异表达基因。结果 在被检测的 12 80 0个基因中 ,一些与细胞物质代谢和物质转运有关基因的表达在高致瘤性K5 6 2 n细胞与K5 6 2细胞之间有显著的变化。K5 6 2 n细胞表达上调的基因包括Dihydrodiol脱氢酶基因、肝Dihy drodiol脱氢酶基因、NAD依赖的亚甲基四氢叶酸脱氢酶 /环化脱水酶基因、人胎盘特异性ATP结合盒转运蛋白基因 ,表达下调的基因包括溶血磷脂酸酰基转移酶基因、线粒体异柠檬酸脱氢酶基因、精氨琥珀酸裂解酶基因、核糖核苷酸还原酶M1亚基基因、焦磷酸法尼酯合成酶基因、二甲基精氨酸二甲基氨基水解酶基因、细胞粘附蛋白SQM1基因等。结论 K5 6 2 n细胞的裸鼠高致瘤性等生物学特性与一系列细胞物质代谢酶和物质转运蛋白基因的表达变化有关。 相似文献
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基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究 总被引:24,自引:0,他引:24
目的:探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理变化中的应用价值。方法:应用含有4096条人类全长基因的cNDA表达谱芯片,对3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果:在3例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因398条,其中新基因289条,老基因109条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因37条,其中在胰腺癌组织中上调基因20条,下调基因17条。结 相似文献
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裸鼠高致瘤性人白血病细胞系肿瘤相关基因的表达 总被引:1,自引:1,他引:0
目的:探索K562和K562-n细胞在裸鼠体内致瘤性不同的分子生物学机制。方法:应用基因芯片技术,检测K562细胞和K562-n细胞的差异表达基因。结果:K562-n细胞中表达上调的与白血病及其他肿瘤发生、发展相关的基因包括加dek基因和DP1基因(结肠直肠多发性息肉病位点基因)。许多肿瘤抑制基因或包含潜在的肿瘤抑制基因的序列在K562-n细胞中表达下降,如染色体12p13序列(U47924).锌指蛋白127-Xp基因和锌指蛋白198基因,prohibitin基因、DNF15s2基因、hMSH2基因(遗传性非息肉性结肠癌基因,为碱基错配修复基因)、环孢素受体基因。结论:K562-n细胞的裸鼠高致瘤特性与一系列癌基因的表达上调和抑癌基因的表达下调有关。 相似文献
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基因芯片技术分析斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制 总被引:12,自引:0,他引:12
目的:研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法:应用基因芯片技术检测12.5μmol/L斑蝥素作用于肝癌QGY7703细胞24h后基因表达谱的变化。结果:斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因(如p27、ref—1、DNA、polymerase delta、XRCC9等)、能量代谢基因(如malate dehydrogenase,ADP/ATP translocase等)、致瘤活性基因(如c-myc,tre等)以及肿瘤特异表达基因(如bladder cancer related protein等)。相反,斑蝥素促进了多种细胞生长抑制基因(如BCRA2,BTG2,dual-specificity protein phosphatase等)以及凋亡相关基因(如ATL-derived PMA-responsive peptide等)的表达。结论:斑蝥素改变调控细胞周期进程、细胞增殖、能量代谢以及凋亡级联反应的基因表达可能是其细胞毒作用的机制。 相似文献
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基因芯片技术及其应用 总被引:11,自引:0,他引:11
基因芯片的产生仅10年左右的时间,但在制备方法及应用方面都得到了极快的发展。本对基因芯片的产生及发展、主要制备原理以及应用作了概括的介绍。目前,基因芯片最常用的介质是表面修饰了特殊基团的玻片,使DNA分子通过共价键同玻片相连。通常被固定的元素是DNA片段或寡核苷酸。最常用的制备技术是直接点样法,即以针点或喷点的方式制备微矩阵基因芯片;此外,还有原位合成法及电定位法等制备芯片。基因芯片的应用概括起来有两大用处;检测基因的量及检测基因的结构(质),前主要用于大规模检测基因表达的改变情况;后主要指DNA的序列分析,包括测序及再测序、SNP分析、突变检测等,因此在后基因组研究、分子诊断及分子检测方面具有广阔的应用前景。 相似文献