基于BDNF/TrkB/p-CREB信号通路探讨血府逐瘀胶囊促进神经再生防治卒中后抑郁的作用及机制

目的 探讨血府逐瘀胶囊对卒中后抑郁（post-stroke depression,PSD）大鼠抑郁症状的改善作用,并基于神经再生关键通路脑源性神经营养因子（brain derived neurotrophic factor,BDNF）/酪氨酸激酶受体B(tyrosine kinase receptor,TrkB)/磷酸化环腺苷酸应答元件结合蛋白（phosphorylated cAMP response element-binding protein,p-CREB）探讨其机制。方法 采用短暂大脑中动脉梗塞（transient middle cerebral artery occlusion,tMCAO）复合慢性不可预知应激（chronic unpredictable mild stimulation,CUMS）方法复制PSD大鼠模型。大鼠随机分为假手术组、模型组及血府逐瘀低、高剂量（0.43、0.86 g/kg）组和氟西汀（1.8 mg/kg）组,每组18只。连续给予药物干预28 d,利用神经功能评分、糖水偏好实验、旷场实验、强迫游泳实验考察血府逐瘀胶囊对PSD大鼠神经功能损伤以及抑郁症...     

柔肝通络汤上调血管内皮生长因子及其受体表达对缺血性脑卒中大鼠脑皮质血管再生、神经元损伤的影响

【目的】探讨柔肝通络汤对缺血性脑卒中大鼠的治疗机制。【方法】选取健康SD大鼠60只,分为正常组,模型组,柔肝通络汤低、中、高剂量组,阿司匹林组,每组10只。除正常组外,其余组别大鼠均建立缺血性脑卒中模型。造模成功后,柔肝通络汤低、中、高剂量组分别给予5.0、10.0、20.0 g/kg柔肝通络汤灌胃,阿司匹林组给予20.0 mg/kg阿司匹林灌胃,正常组与模型组给予生理盐水15.0 mL/kg灌胃,每日1次,连续14 d。采用Bederson法评定大鼠神经功能缺损情况,苏木素-伊红（HE）染色法观察脑组织病理形态,末端脱氧核苷酸转移酶（Td T）介导的核苷酸（dUTP）缺口末端标记法（TUNEL）法检测大鼠脑组织神经元凋亡,免疫组织化学法检测脑皮质血小板内皮细胞黏附分子1(CD31)阳性表达,Western Blot法检测脑皮质血管内皮生长因子（VEGF）、血管内皮生长因子受体1(VEGFR1)、血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)蛋白表达。【结果】与正常组比较,模型组大鼠神经功能损伤评分、神经元凋亡指数升高（P<0.05）,脑皮质中CD31阳性表达水平升高（P<0.05...     

铜死亡相关基因PDHA1与乳腺癌的预后关系及列线图的构建

背景与目的 丙酮酸脱氢酶E1组分α亚基（PDHA1）是丙酮酸脱氢酶复合物的关键调控位点,发挥着连接糖酵解和三羧酸循环的重要作用,对癌症代谢转变具有重要意义。最新研究发现了一种新的细胞死亡方式,即铜死亡。PDHA1是铜死亡的相关基因,参与铜死亡过程的调控。本研究旨在利用生物信息学方法探讨PDHA1与乳腺癌预后的关系并建立预后相关的列线图模型。方法 运用TCGA、TIMER、UALCAN、HPA、STRING、Gene MANIA、Kaplan-Meier、GEPIA、GeneCards等多个数据库对PDHA1在乳腺癌中的临床病理特征关系、表达情况、蛋白互相作用网络、基因-基因互作网络、预后价值、基因集富集分析等进行分析,并使用R语言构建列线图模型。结果 PDHA1表达水平与乳腺癌T分期（P<0.001）、病理分期（P=0.031）、人种（P<0.001）、组织学类型（P<0.001）、PR状态（P<0.001）、ER状态（P<0.001）、PAM50亚型（P<0.001）有关。TCGA数据库结果显示,乳腺癌组织PDHA1 mRNA的表达水平明显低于正常乳腺组织（P<0.001）,UALCAN数据库结果显示,PDHA1蛋白在乳腺癌中低表达（P<0.001）,HPA数据库进一步验证了该结果。PPI蛋白互作网络显示有15个与PDHA1相关的互作蛋白。基因-基因互作关系网络图得到20个PDHA1相关的互作基因。PDHA1高表达组患者的总生存期（HR=1.26,95% CI=1.02~1.54,P=0.029）、无复发生存期（HR=1.18,95% CI=1.05~1.32,P=0.005 1）、进展后生存期（HR=1.41,95% CI=1.07~1.86,P=0.015）、无转移生存期（HR=1.29,95% CI=1.1~1.52,P=0.002 3）均低于PDHA1低表达组。GSEA结果表明PDHA1共表达基因在乳腺癌中主要参与S期、三羧酸循环等通路。从GeneCards中找到10种与PDHA1表达相关的化合物。将PDHA1表达、年龄、放疗、N分期和M分期纳入构建列线图,校准图显示列线图预测和实际观察之间有极好的一致性。结论 PDHA1高表达乳腺癌患者预后较PDHA1低表达患者差。PDHA1表达水平是影响乳腺癌患者预后的相关因素。基于PDHA1表达的列线图模型对于乳腺癌患者预后的评估有一定的价值。     

基于公共数据库的甲状腺癌预后风险基因筛选

背景与目的 甲状腺癌的发病率呈逐年增长趋势,尽管其总体预后较好,但仍有部分患者因复发或转移而死亡。本研究旨在基于公共数据库应用生物信息学方法筛选甲状腺癌的预后风险基因。方法 从癌症RNA测序关系（CRN）数据库下载甲状腺癌的蛋白编码基因RNA-seq数据,筛选甲状腺癌中差异表达的蛋白编码基因。通过DAVID数据库对差异表达的蛋白编码基因进行功能富集分析。用STRING数据库和Cytoscape软件构建差异表达蛋白编码基因之间的相互作用网络,分别用Cytoscape软件中的cytoHubba插件与ClueGO插件筛选核心基因,并对核心基因进行功能预测。用UALCAN数据库验证核心基因在甲状腺癌中的表达水平,通过GEPIA数据库对核心基因进行生存分析,分析核心基因的表达水平对甲状腺癌的生存时间有无影响。结果 筛选共得到913个差异表达的蛋白编码基因。这些基因主要富集于调控小分子GTP酶介导的信号转导、Z膜、结合肌动蛋白和细胞色素P450介导的药物代谢。构建互作网络后,筛选出10个核心基因,分别为TP53、ESR1、FOS、SYP、PPARG、ACTB、GRIA1、NRXN1、HDAC3和KIT,其中TP53得分最高,为62,它们均在甲状腺癌组织中表达下调;预测显示核心基因TP53、ESR1、PPARG可能参与了基因沉默的负性调控,TP53、FOS可能参与了RNA聚合酶II对pri-miRNA的转录调控过程。UALCAN数据库验证结果显示,除TP53外,其余核心基因均在甲状腺癌组织中表达下调（均P<0.05）,与CRN数据库中的表达结果一致。生存分析结果显示,KIT的高表达与甲状腺癌患者的无病生存期明显相关（P=0.012）,而对其总体生存期无明显影响（P=0.85）。结论 本研究筛选的蛋白编码基因KIT在甲状腺癌组织中呈低表达,其高表达与甲状腺癌的无病生存期密切相关,推测其可能成为甲状腺癌的预后风险标志物或治疗靶点。     

miR-204-5p/TNFRSF12A轴对甲状腺乳头状癌细胞侵袭能力的影响及机制

背景与目的 前期，笔者通过生物信息学分析和验证发现miR-204-5p在甲状腺乳头状癌（PTC）中呈低表达，并可能是PTC发生发展中的关键分子。因此，本研究进一步探讨miR-204-5p对PTC细胞侵袭能力的影响及机制。方法 采用Transwell实验检测miR-204-5p过表达和敲低对PTC细胞系TPC-1细胞的侵袭能力影响；通过miRDB网站预测miR-204-5p下游靶基因，并采用Western blot实验、Transwell实验、GEPIA数据库分析及双荧光素酶报告基因实验验证。结果 Transwell实验结果显示，过表达miR-204-5p的TPC-1细胞侵袭能力明显降低，而miR-204-5p抑制的TPC-1细胞侵袭能力明显增强（均P<0.05）。miRDB网站预测显示，TNFRSF12A可能为miR-204-5p下游靶基因；Western blot结果显示，过表达miR-204-5p的TPC-1细胞TNFRSF12A表达下调，而miR-204-5p抑制的TPC-1细胞TNFRSF12A表达上调；过表达TNFRSF12A的TPC-1细胞侵袭能力明显增强，TNFRSF12A抑制的TPC-1细胞的侵袭能力明显降低；TNFRSF12A可逆转miR-204-5p对TPC-1细胞侵袭能力的影响（均P<0.05）。GEPIA数据库分析显示，TNFRSF12A在PTC组织中高表达。双荧光素酶报告基因实验结果显示，TNFRSF12A是miR-204-5p的靶基因。结论 miR-204-5p可靶向结合TNFRSF12A mRNA的3''UTR抑制TNFRSF12A的表达，而PTC细胞中miR-204-5p表达下调，削弱了其对TNFRSF12A表达的抑制，从而导致PTC细胞侵袭能力增强。