不同生态类型菘蓝SLAF-seq分子标记

目的 探究不同生态类型菘蓝Isatis tinctoria表型差异和特异位点扩增片段测序（specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq）分子标记。方法 以25个不同生态类型菘蓝为研究对象,利用SLAF-seq技术开发SLAF标签,再结合菘蓝叶片叶表观特征的田间观测,分析不同生态类型菘蓝植株表观差异。结果 测序后各样品所获得的读长总量各不相同,测序质量值Q30为95.66%～96.60%,GC比例为38.13%～41.37%。共开发535 105个菘蓝SLAF标签,多态性SLAF标签有34 412个,共得到63 002个群体单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）标记。测序分析结果与叶表观特征调查结果相结合,可以将25个不同生态类型菘蓝分为5类,分别为倒卵圆形无缺刻皱缩叶、倒卵圆形缺刻皱缩叶、倒卵圆形无缺刻平坦叶、倒卵圆形缺刻平坦叶、披针形无缺刻平坦叶。结论 为后期进一步研究不同类型菘蓝的基因来源和遗传进化提供参考,为菘蓝种质分类、品种鉴定和分子辅助育种提供借鉴。