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目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)–LINC02474在结直肠癌组织中的表达及其临床意义。方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT–qPCR)检测2018年10月至2018年12月在广东省第二人民医院确诊的10例结直肠癌组织与对应癌旁组织中LINC02474的表达水平,结合肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库,分析LINC02474的表达情况与患者临床病理分期和预后的关系。结果:lncRNA–LINC02474在癌组织中的相对表达量为3.94±1.26,明显高于对应癌旁组织中的相对表达量1.09±0.16。TCGA数据库中LINC02474的分析结果显示LINC02474在结直肠癌组织中的表达显著高于其在癌旁正常黏膜组织中的表达,且LINC02474在Ⅲ/Ⅳ期中的表达显著高于Ⅰ/Ⅱ期;在T3/T4期中的表达量明显高于T1/T2期;在N1/N2期中的表达明显高于N0期;在M1期中LINC02474的表达显著高于M0期,差异具有统计学意义(P 0.05)。生存分析结果表明,LINC02474表达量的高低与结直肠癌患者生存率相关。结论:lncRNA–LINC02474在结直肠癌组织中呈高表达,LINC02474与结直肠癌发生、发展和预后密切相关。 相似文献
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目的 利用生物信息学分析方法,挖掘结直肠癌(CRC)的关键基因并探索其发病机制.方法 在公共基因芯片数据库(GEO)中下载结直肠癌表达谱芯片数据,在GCBI实验室中筛选出结直肠癌显著差异的基因,分别对显著差异基因作GO富集分析、KEGG通路分析、蛋白质相互作用(PPI)网络分析.进一步利用cytoscape将PPI结果建立互作模块.结果 通过差异分析得出在正常结直肠组织、结直肠腺瘤、结直肠癌中表达量逐步明显下调的基因有492个,逐步明显上调的有248个,共有740个显著差异基因.GO富集分析主要体现在各种代谢过程、细胞增殖、信号调节、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性等.KEGG信号通路主要富集在癌症转录失调、细胞周期及p53信号通路等.并利用互作模型筛选出CDK1、MCM2、CDC6、CCNA1、CCNB2、CDKN1B、ORC1、E2F1、CHEK1、PCNA等45个与结直肠癌发生发展关系密切的关键基因.关键基因主要富集在细胞周期、病毒致癌机理、癌症相关、p53及PI3K-Akt等信号通路.结论 通过生物信息学对基因芯片数据的分析,能获取结直肠癌的关键基因及其相关通路,为后续研究提供依据. 相似文献
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