基于数据库的未分化甲状腺癌基因组变异分析及靶向药物筛选

目的： 对未分化甲状腺癌的基因组变异情况进行分析并以此为基础筛选候选靶向药物。方法： 通过cBioPortal数据库获得患者样本数据,筛选同时发生突变与拷贝数变异的基因,计算其遗传变异频率。绘制生存曲线以筛选与患者生存率关系密切的基因变异。利用STRING数据库分析蛋白质相互作用并进行GO功能富集分析,利用CARE软件筛选潜在的靶向药物。结果： TP53、PI3KCA、ARID2是未分化甲状腺癌遗传变异频率最高的基因。TP53基因的错义突变与患者生存率下降有关。GO功能富集分析发现P53通过调控DNA损伤修复、细胞周期阻滞等生物学过程参与未分化甲状腺癌的发生。对于携带TP53错义突变的患者,索拉非尼、鲁索替尼等药物具有高反应性,而普纳替尼等药物具有耐药性。结论： TP53基因错义突变是影响未分化甲状腺癌患者预后的关键基因变异,而索拉非尼、鲁索替尼等药物是携带TP53基因错义突变患者的候选靶向药物。     

缺血性脑损伤对SD大鼠肠道菌群的影响

目的：探讨正常大鼠与缺血型脑损伤大鼠之间粪便菌群的差异性及规律，为临床缺血性脑损伤患者的治疗提供理论和实验依据。方法：将采购于佳木斯大学动物实验中心的成年雄性SD大鼠随机选取90只，分为模型组与标准组，每组45只。标准组随机分配，每组15只，编号为1～3组；模型组进行术后脑损伤病理的评估与分级，根据不同脑损伤程度分为3组，编号为4～6组。模型组采用双侧颈动脉结扎法构建脑缺血大鼠模型，将SD大鼠左右两侧颈总动脉永久结扎，术后并对大鼠进行病理评估。一段时间后，分别采取标准组和模型组大鼠粪便，对样本粪便中细菌的16s核糖体DNA进行基因测序，并对结果进行统计学分析。结果：实验组大鼠粪便标本中厚壁菌门数量明显低于标准大鼠；而拟杆菌门、变形菌门、放线菌门数量明显增加，差异有统计学意义(P<0.05)。结论：脑损伤大鼠紊乱的肠道菌群加重脑缺血倾向和脑损伤程度。在脑缺血损伤状态下，实验大鼠粪便标本中有益菌数量减少，机会致病菌增加。且伴随着损伤程度的增加，有益菌数量的减少呈正比关系。