基于生物信息学筛选早发性乳腺癌差异表达基因

目的筛选并分析与早发性乳腺癌发生、发展相关的靶基因。 方法(1)在美国国立生物技术信息中心的公共基因芯片数据库(GEO)中检索早发性乳腺癌样本及非早发性乳腺癌样本相关基因芯片数据。对上述数据使用GEO2R、R4.1.2及Venn软件筛选出相关差异表达基因(DEGs)，并运用在线分析工具(Web Gestalt)对DEGs，进行相关功能和信号通路富集分析。(2)同时，通过String在线数据库构建DEGs编码的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，并利用Cytohubba插件对该网络中的基因进行评分，筛选出枢纽基因。将枢纽基因导入Kaplan-Meier生存分析工具(Kaplan-Meier Plotter)，评估枢纽基因在早发性乳腺癌的预后价值。(3)将肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中的肿瘤组织以年龄为标准进行分组，分析枢纽基因在各年龄组中的表达，并与正常组织中的表达进行比较，对得到的枢纽基因进行验证。DEGs表达量的多组间比较使用Kruskal-Wallis H检验，使用Bonferroni法进行两两比较。 结果(1)筛选出编号为GSE89116、GSE109169、GSE36295的基因芯片数据集，共得到80个差异表达基因，其中上调差异表达基因17个，下调差异表达基因63个。富集分析显示：DEGs主要富集在脂质代谢和氧化还原过程以及PPAR信号通路、AMPK信号通路上。(2)在PPI中发现主要的关键基因为PPARG、ADIPOQ、LIPE、PCK1、PDK4、ACACB、PLIN1、CAV1、CD36、ANGPTL4。ACACB、ADIPOQ、CAV1、LIPE、PLIN1、PPARG基因的低表达与乳腺癌患者的不良OS相关(HR＝0.69、0.84、0.76、0.88、0.78、0.82；95%CI：0.59~0.80、0.76~0.93、0.67~0.83、0.79~0.97、0.70~0.86、0.73~0.90；P均<0.050)。(3)ACACB、ADIPOQ、LIPE、PLIN1、CAV1及PPARG这6个与预后相关的基因在正常组织中的表达量均远高于各年龄组肿瘤组织中的表达量(χ²＝104.03、179.57、161.85、189.87、118.56、103.62，P均<0.001)，早发性乳腺癌组(21~40岁)的LIPE、PLIN1表达量低于41~60岁、61~80岁年龄组，差异具有统计学意义(LIPE: Z＝21.07、23.12, P均<0.050; PLIN1：Z＝16.89、18.76, P均<0.050)。 结论早发性乳腺癌与非早发性乳腺癌存在差异基因表达谱，LIPE、PLIN1可能是早发性乳腺癌发生、发展的关键基因。     

女性善养生,过好4关口

正女性一生要经历月经、孕产、更年期等不同生理时期,有些人还要面临各种妇科炎症困扰,这些对机体都是极大的消耗和考验。在不同关口,有针对性地调理才能让身心有的放矢、安然度过。月经期:重在养心女性在月经前和月经期间,情绪较为低落、抑郁或暴躁等,多与气血不足、肝气郁     

中西医结合治疗使缺血型心肌病大心脏回缩1例

患者赵某，男性，45岁。主因间断胸闷、心前区不适4年，加重伴夜间憋醒20天。于2002年9月17日入我院。入院前4年出现胸闷、胸痛、恶心、呕吐于当地医院经心电图心肌酶检查，诊断为“急性心梗”，给予常规治疗后效果欠佳，一个月后行“支架植入术”，症状缓解后间断口服“卡托普利”等药物，症状时轻时重，入院查体：T36．1℃，P72次／分，R18次／分BP 100／70mmHg，双肺底可闻及湿哆音，心界向左下扩大，二尖瓣听诊区可闻及Ⅲ级收缩期吹风样杂音，柔和无传导。     

ALLHAT带来了什么

曾被寄予厚望的“抗高血压和降脂治疗预防心肌梗死试验”(ALLHAT)多年之后终于完成,结果也于日前揭晓。然而正是这一由美国国立卫生研究院(NIH)出面主办的研究,结论有些难以理解,招来多方议论,因为它与目前公认的大量以循证医学为原则的临床研究结果不相符合,况且这些临床研究的结论已列入全球范围治疗指南中。因此有必要对ALLHAT试验的来龙去脉作一剖析。 ALLHAT试验始于1994年,正是Furberg、Pahor和Psaty等人在进行了荟萃分析之后,提     

逆境中的凯歌

得了癌症是不幸的，但我却有幸通过修炼气功战胜了癌症，使生命在逆境中奋起，走上了一个新的人生旅程。一、绝望的宣判使我走上了气功抗癌的成功之路在1995年6月，一次偶然的体检证实我得了肺癌。六天后做切除手术，不料又发现已经在整个胸腔呈散在型扩散，左肺上下叶、胸膜、心包、隔肌都有CT检查不出来的细小病灶。主持手术的胸外科主任认为已到晚期，手术已经没有意义，但胸腔已经打开，于是只把原发病灶楔状切除，然后就缝合了。术后肿瘤科主任认为只有化疗是唯一可行的措施。他表示已决定采用国际上最先进的方案和药物，并且针对我一…     

中药姜辛味对小鼠镇咳与血液流变学的观察

对中药干姜、细辛、五味子、三药配伍后的镇咳及其血液流变学影响进行了观察探讨,结果表明:①三药配伍后具有明显的镇咳作用,而单味干姜、五味子组的止咳作用均不明显;③复方姜辛味组对全血粘度、红细胞电     

脑外伤后脑梗死临床分析

脑部外伤后脑梗死临床较为少见，系指脑外伤患者复查CT时，出现脑梗死灶。它一旦发生将加重原发颅脑损伤，致使病情迁延或恶化，影响病人的康复及预后，应引起临床重视。我科收治有34例脑外伤后脑梗死患者，报道如下。     

立体疗法救治溶血胎儿

本报讯日前，中南大学湘雅医院成功将一患罕见的母儿Rh血型不合溶血病的胎儿进行了妊娠期血浆置换和子宫内输血治疗。