高表达UBE2B在食管癌中的临床意义及其与免疫浸润相关性

目的：研究泛素结合酶E2B(UBE2B)在食管癌中的临床意义及其与免疫浸润相关性。方法：通过UALCAN在线工具分析UBE2B在食管癌中的表达;PrognoScan、GEPIA、Kaplan-Meier Plotter三种工具进行UBE2B表达量与食管癌患者生存率相关性分析;TCGA数据库、GEO数据库、CCLE数据库分析UBE2B对食管癌放化疗的影响;TIMER结合GEPIA进行UBE2B与食管癌肿瘤免疫细胞浸润相关性分析。结果：UBE2B在食管癌中高表达,而且与食管癌患者的病理参数、生存率显著相关;高表达UBE2B与食管癌铂类放化疗反应显著相关;高表达UBE2B与食管癌中性粒细胞及淋巴细胞浸润正相关。结论：高表达UBE2B影响食管癌患者的预后、放化疗反应及肿瘤免疫浸润。     

高表达TK1与卵巢癌耐药性有关

目的:研究胸苷激酶1(thymidine kinase 1,TK1)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法:运用GEPIA在线工具分析TK1在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异,运用kaplan-meier plotter分析卵巢癌患者关于TK1的总生存曲线;基于GEO数据库分析TK1在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异。综合运用基因互作分析、基因通路富集和文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明TK1调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果:卵巢癌组织中的TK1表达明显高于正常卵巢组织,高表达TK1与卵巢癌患者低生存率有关,顺铂耐药的卵巢癌细胞株TK1表达明显高于顺铂敏感的卵巢癌细胞株,与TK1具有高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;利用基因通路富集对与TK1相关联的基因分析发现,代谢相关通路程度最高;文本挖掘显示,细胞周期、细胞增殖、S期、入胞、磷酸化等生物过程与TK1蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有明显的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于TK1的11个miRNA皆与卵巢癌耐药性或其他肿瘤耐药性相关。结论:高表达TK1与卵巢癌的耐药...     

基于生物信息学分析MYBL2在卵巢癌耐药性中的作用及其机制

目的 研究分析MYBL2与卵巢癌耐药性之间的关系。方法 运用GEPIA在线工具分析MYBL2在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异,运用km-plot分析卵巢癌患者关于MYBL2的总生存曲线;基于GEO Profiles数据库分析MYBL2在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异。综合运用基因互作分析、基因通路富集和文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明MYBL2调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果 卵巢癌组织中MYBL2的表达显著高于正常卵巢组织,高表达MYBL2与卵巢癌患者低生存率有关,顺铂耐药的卵巢癌细胞株MYBL2表达显著高于顺铂敏感的卵巢癌细胞株,与MYBL2具有高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;基因通路富集对与MYBL2相关联的基因分析发现,细胞周期富集程度最高;文本挖掘显示,除了细胞周期外,基因表达、细胞增殖、凋亡过程等生物过程与MYBL2蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有显著的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于MYBL2的12个miRNA皆与卵巢癌耐药性或肿瘤发生发展有关。结论 MYBL2与卵巢癌的耐药性有关,而且有可能是通过调节细胞周期而参与到卵巢癌耐药性中。     

低表达SLC1A4在卵巢癌顺铂耐药中的作用研究

目的 探讨溶质载体家族1成员4(solute carrier family 1 member 4,SLC1A4)在卵巢癌铂类化疗耐药性中的作用。方法 通过GEO、TCGA数据库分析工具分析SLC1A4在卵巢癌或铂类耐药性卵巢癌中的表达;通过GEO数据库分析SLC1A4在铂类药物处理的卵巢癌细胞系中的表达;通过Kaplan Meier-plotter分析SLC1A4表达量与卵巢癌患者总生存期(overall survival,OS)、无疾病进展生存率(progression free survival,PFS)的相关性;通过DepMap平台分析SLC1A4基因效应与卵巢癌化疗药物敏感相关性;通过流式细胞试验和肿瘤细胞克隆集落形成试验验证低表达SLC1A4介导卵巢癌细胞顺铂耐药;通过TargetScan预测靶向于SLC1A4的微小RNA(miRNA),并在TCGA数据库卵巢癌样本中验证其相关性;运用COREMINE工具进行文本挖掘分析SLC1A4介导卵巢癌化疗耐药性的生物过程。结果 SLC1A4在卵巢癌患者及铂类耐药性的卵巢癌中的显著降低(P<0.05),而且与患者的OS、PFS显著相关(P<0.05);铂类药物处理卵巢癌细胞增加SLC1A4的表达;SLC1A4对卵巢癌的基因效应与铂类药物敏感性正相关;过表达SLC1A4增加顺铂引起的卵巢癌细胞凋亡和减少肿瘤细胞克隆集落形成;hsa-let-7c-5p靶向于SLC1A4并在耐药性卵巢癌患者样本中呈显著负相关。结论 低表达SLC1A4介导卵巢癌铂类耐药性,并且有可能与hsa-let-7c-5p调控有关。