甲状腺癌铁死亡预后风险模型的构建及其潜在机制的生物信息学分析

目的：筛选甲状腺癌（TC）差异预后铁死亡基因（PFRGs）,构建TC铁死亡相关基因（FRGs）预后风险模型,并阐述其潜在作用机制。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）数据库获取基因表达及临床数据,从铁死亡疾病数据库（FerrDb）和人类基因数据库（GeneCards）中获取FRGs,采用R软件筛选TCPFRGs;从TCGA和GTEx数据库获取TC组织和甲状腺组织中PFRGs mRNA表达数据,从人类蛋白图谱（HPA）数据库获取免疫组织化学结果,验证PFRGs mRNA和蛋白表达的差异;采用时间依赖性受试者工作特征（time-ROC）曲线和Kaplan-Meier曲线评估PFRGs与TC患者生存和预后的关系;采用单因素和多因素Cox回归分析计算PFRGs表达的风险评分,纳入TC患者临床数据,进行独立预后分析,并构建Nomogram图;TCGA数据库中PFRGs与各基因表达的相关性采用Spearman相关分析,计算相关系数并筛选共表达基因;采用生物信息学方法对PFRGs共表达基因进行蛋白-蛋白互作（PPI）网络图、基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：在TC...     

细胞焦亡在重症COVID-19中的作用

新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)是一种由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的危及呼吸道以及全身多脏器的传染性疾病,全球现已有超过2亿人感染此病,是一场空前的全球性瘟疫。大部分COVID-19患者仅表现出轻度症状且预后良好,但有大约20%的病例会发展成重症并引起严重的并发症,包括急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)、全身炎症反应综合征(systemic inflammatory response syndrome, SIRS)、细胞因子释放综合征(cytokine release syndrome, CRS)等。细胞焦亡是一种以显著炎性反应为特征的细胞程序性死亡方式,常常以炎症caspase介导,以膜打孔蛋白Gasdermin家族为最终效应分子,致使细胞因膜膨胀破裂而死亡,并伴随着大量促炎细胞因子(如IL-1β、IL-18等)的释放。细胞焦亡因其炎...