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基于网络药理学和分子对接技术探讨生脉注射液抗新型冠状病毒肺炎的作用机制 总被引:1,自引:0,他引:1
目的采用网络药理学与分子对接技术探讨生脉注射液的活性成分和治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制。方法利用TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选生脉注射液的活性化合物,通过TCMSP及Targetnet在线数据库预测作用靶点,通过Cytoscape3.7.1构建活性成分-作用靶点网络图;在GeneCards及OMIM数据库中以"coronavirus pneumonia"为关键词搜索冠状病毒肺炎相关疾病靶点,与生脉注射液化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为研究靶点,将共同靶点导入STRING数据库获取数据后在Cytoscape 3.7.1软件中构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用R语言进行GO(gene ontology)功能、KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,预测其作用机制,并构建"成分-靶点-通路"网络图;通过DiscoveryStudio 2.5软件对关键靶点进行分子对接分析。结果生脉注射液筛选得到22个活性化合物,分别为邻苯二甲酸二辛酯、β-谷甾醇、当归酰基戈米辛O、戈米辛A、戈米辛R、五味子丙素、内南五味子酯乙、长南酸、南五味子内酯、香蒲木脂素B、新杜松烷酸A、新杜松烷酸B、新杜松烷酸C、新南五味子木脂宁、五味子内酯A、五味子内酯E、五味子酸、尿苷、薯蓣皂苷元、鸟嘌呤核苷、N-反式阿魏酰酪胺、豆甾醇。相应作用靶点224个,与COVID-19的共同靶点16个,分别为CASP3、CASP8、PTGS2、BCL2、BAX、PRKCA、PTGS1、PIK3CG、F10、NOS3、DPP4、NOS2、TLR9、ACE、ICAM1、PRKCE,关键靶点涉及CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3、ICAM1。GO功能富集分析得到生物过程(BP)条目771个,细胞组成(CC)条目11个,分子功能(MF)条目79个。KEGG通路富集分析筛选得到67条(P0.05)信号通路,主要涉及糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、凋亡通路、P53信号通路、小细胞肺癌通路等。分子对接结果显示与关键靶点对接较好的成分有五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺。结论生脉注射液中的活性化合物五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺等能作用于CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3等靶点调节多条信号通路发挥抗炎、免疫调节、抗休克、增加血氧饱和度等作用,从而可能发挥对COVID-19的治疗作用。 相似文献
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結核病的治疗自抗結核药物問世以来向前跨进了一大步。早期发現的肺結核,包括比較严重的患者,經过合理的抗結核药物治疗,一般多能痊癒。由于抗結核药物的使用,許多結核病患者避免了外科手术,对于确需手术治疗的病人也給以了极大的保障,并提高了外科的疗效。但抗結核药物也具有一定的缺点,主要的是:①結核菌对它仍会产生耐药 相似文献
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从3-硝基-6-甲基-苯胺为原料经过六步反应合成了N-乙酰基-N-{3-[双-(β-氯乙基)-氨基]-6-甲基-苯基}-甘氨酸(Ⅲ_2),并从硝基苯胺以制备Ⅲ_a相似的步骤合成N-乙酰基-N-{3-[双-(β-氯乙基)-氨基]-苯基}-甘氨酸(Ⅲ_b)和N-乙酰基-N-{4-[双-(β-氯乙基)-氨基]-苯基}-甘氨酸(Ⅲ_c).药理试验表明:化合物Ⅲ_a对小白鼠肉瘤-180有显著的抑制作用,但化合物Ⅲ_b和Ⅲ_c无明显作用.Ⅲ_(a-c)对体外组织培养的Hela瘤细胞都无抑制作用. 相似文献
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我国古代医学称扁桃腺周围脓肿为喉瘫,记载治疗这个病的方法,是十分丰富多彩的。远在唐宋时代,我们的祖先就创用了一种科学的方法,使毛笔头中埋藏一把小柳叶刀,用之在脓肿部份的表面上,来回地扫刷数次,在病人不知不觉中,就将脓肿切开排脓。这一种简便的手术操作方法,不但具有强烈的科学性,而又贯注着丰富的人道主义的和保护性医疗制度的精神实质。 相似文献
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动脉导管之結紮或切断,特別是后者,易于发生术中大出血,应予以重視。导管結紮术对細长之动脉导管固然安全可行,但由于少数人发生术后再通或主动脉气管漏等併发病亦应采用切断术,问题在于采取有效措施防止术中流血。根据40例切断术未发生大流血的經驗,作者提出以下綜合措施可以防止术中发生此种意外。一、对年龄較大、或分流量較大、或肺动脉高压、或曾作过結紮术者,采用低温或控制性低血压麻醉。二、一律采用后侧切口。三、对导管及其附近主动脉与肺动脉采用刃器性解剖。四、在解剖导管后壁之前,先于导管上、下方主动脉按放安全阻断带,并充分游离胸主动脉,一旦发生較大出血可及时以鉗夹住主动脉。五、于导管之动脉侧使用Potts-Smith氏鉗,于肺动脉側使用弯形动脉鉗。六、切断导管时,边切边縫,并采用細針細线,注意以垂直方向拉紧連續縫綫。七、縫合后,对断端之出血点采取压迫方法,避免急于按鉗或縫合止血。 相似文献
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UDP-鼠李糖是一种由鼠李糖合成酶(rhamnose synthase,RHM)催化合成的糖苷供体,是合成各种鼠李糖糖苷类次生代谢产物的重要组成之一。该研究从甜橙中首次克隆得到一个RHM基因(CsRHM),并进行生物学信息分析,体外功能鉴定等特异性分析。结果显示CsRHM的开放阅读框为2007 bp,编码668个氨基酸,推测相对分子质量为75.27 kDa,理论等电点为6.97,具有RHM酶家族的特征信号序列(GxxGxxG/A和YxxxK)。多序列对比与系统进化树显示,CsRHM与其他物种的RHM具有同源性。体外酶促反应结果证实CsRHM重组蛋白具有将UDP-葡萄糖转化为UDP-鼠李糖的催化活性,并且明确了其催化的酶动力学参数V_(max)=0.3737μmol·L^(-1)·min^(-1),K_(m)=21.29μmol·L^(-1),K_(cat)=0.24 s^(-1),K_(cat)/K_(m)=1.13×10^(4)s^(-1)·L·mol^(-1)。该研究首次报道了CsRHM,并验证了其体外催化功能,为进一步研究生物合成UDP-鼠李糖奠定基础。 相似文献
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药用植物活性成分在药物研发过程中发挥着举足轻重的作用,利用合成生物学合成这些功效成分已然成为现今的研究热点之一。合成生物学以工程学思想为指导,对天然生物代谢途径进行改造甚至重建,并设计与构建新的标准化的生物元件、组件和系统,其包含了生物化学、分子与细胞生物学、生物信息学等诸多热门学科。中药合成生物学是在合成生物学基础上,设计并构建合成药用植物功效成分的细胞工厂,用来发酵生产植物天然产物的新学科。本文综述了合成生物学的发展、药用植物活性成分细胞合成技术策略、在微生物和模式植物中合成药用活性成分的方法技术以及研究进展。讨论了合成生物学存在的困难并展望了其今后发展策略。 相似文献
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该文旨在通过构建枳实挥发油活性成分-作用靶点网络图及蛋白相互作用(PPI)网络图,分析靶点涉及的功能和通路,探讨枳实挥发油治疗慢性传输型便秘(slow transit constipation,STC)的作用机制。利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)检测枳实挥发油的化学成分;利用PubChem,TCMSP,STITCH,Swiss Target Prediction检索枳实挥发油成分的靶点,通过OMIM,Genecards-Search Resuits,TTD预测和筛选STC的作用靶点;通过Cytoscape 3.7.1构建活性成分-作用靶点和PPI网络图,利用BioGPS数据库对靶点对应的组织分布进行分析,利用R语言进行GO功能、KEGG通路的富集分析,通过Discovery Studio 2.5软件对成分与靶点进行分子对接验证。最终,共检测到枳实挥发油化合物15个,共预测出115个枳实挥发油治疗STC的共同作用靶点。GO富集分析显示枳实挥发油的活性主要涉及血液循环、循环系统、类固醇激素反应、信号通路等生物学过程。KEGG富集通路共23条,其中神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、内分泌抵抗、Ca^2+信号通路、5-羟色胺能突触等通路对STC有显著作用,分子对接结果表明发挥治疗STC的相关靶蛋白有(ACHE,PTGS2,SLC6A2,CNR2)。通过网络药理学揭示了枳实挥发油的多组分、多靶点、多通路的特点,为进一步研究枳实挥发油治疗STC的作用机制提供了新的思路和方法。 相似文献
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引言最近十多年来促肾上腺皮质激素、皮质素及其衍化物(以下简称激素)应用于结核病之报道屡见不鲜。概而言之,激素对结核病影响可分为四个阶段:第一阶段:在抗结核药物未出现之前,已经证实了肾上腺皮质之浸出液对肺结核的病程有良好的影响。当激素发现后,它对机体反应的减轻、促使体温下降、改善患者一般情况,使一些作者认为激素可以用来治疗活动 相似文献