blaCTX-M-55介导的宋内志贺菌耐药机制研究

目的：研究 blaCTX-M-55介导的宋内志贺菌＃1083的耐药机制。方法双纸片协同扩散法验证＃1083是否为产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）菌株;PCR 方法鉴定其耐药基因;接合转移实验验证携带 ESBL 基因的质粒是否具有可转移性;VITEK 2仪器检测菌株对多种抗生素的 MIC 值;基因组测序鉴定介导耐药基因转移的移动元件;引物延伸实验鉴定耐药基因转录起始位点。结果＃1083为 blaCTX-M-55介导产 ESBL 的菌株,携带 blaCTX-M-55的耐药质粒可通过接合转移的方式进入受体菌 EC600,并使受体菌具有相应的耐药谱;介导 blaCTX-M-55转移的转座单元为 ISEcp1-blaCTX-M-55-Δorf477,且其上游的插入序列 ISEcp1为耐药基因提供强启动子区,促进耐药基因表达,且此表达为恒定表达,不受抗生素的诱导作用影响。结论质粒携带的 blaCTX-M-55为＃1083的主要耐药基因,插入序列 ISEcp1介导此基因的表达与传播。     

初发类风湿关节炎患者肠道微生物群落的基因组学特征分析

目的 探究初发类风湿关节炎(RA)患者肠道微生物群落的基因组学(Genomics)特征。方法 收集住院的30例初发类风湿关节炎患者(RA组)和30例健康人(对照组)的晨起粪便,收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,应用ION TORRENT高通量测序平台对16S rDNA基因的V2、V3、V4、V6、V7、V8、V9可变区开展测序,得出2组试验对象的菌群生物信息数据,再基于文献智库信息,对数据进行组间OTU分析、Alpha菌群多样性分析以及LEfSe差异分析。结果 相较于健康对照组,在OTU菌群丰度上,初发RA组呈显著降低。借助Shannon指数等完成稀释曲线,同时分析数据复杂度,结果表明,所测的数据量完整,能够反映样本中各微生物的多样性信息。菌群多样性比较得出：2组多样性指数分析中Chao1指数、Simpson指数、Goods＿coverage指数、Observe＿species指数比较,差异无统计学意义(P>0.05)。与对照组相比,Shannon指数较初发RA组偏小。菌群结构和菌群差异分析得出：2组在门水平和科水平及属水平上,差异具有统计学意义(P<0.05),...     

病原微生物实验室Ⅱ级生物安全柜防护性能评价

目的评价病原微生物实验室Ⅱ级生物安全柜的防护性能。方法采用安德森采样器采样方法和通过相关仪器,以粘质沙雷菌气溶胶为防护对象进行Ⅱ级生物安全柜防护性能评价。结果所评价的36台Ⅱ级生物安全柜下降气流的平均合格率为91.7%,流入气流合格率为43.7%,气流模型合格率为43.9%。人员保护合格率为72.2%,样品保护合格率为88.9%,交叉污染合格率为88.9%。结论所测试的Ⅱ级生物安全柜存在较大的气溶胶泄漏风险,对实验操作人员保护性能较差。     

产碳青霉烯酶KPC-2的肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌的分离与耐药性研究

目的：研究临床分离的1株肺炎克雷伯菌（ KPN）和1株铜绿假单胞菌（ PAE）对碳青霉烯类抗生素的耐药机制。方法利用种属特异基因PCR扩增、MALDI－TOF质谱技术及细菌16S rDNA测序鉴定细菌种属;采用VITEK 2 Compact系统检测细菌对各类抗生素的最低抑菌浓度（ MIC）;应用改良型Carba NP法、质粒抽提、电转化实验、耐药基因PCR扩增及测序,分析细菌编码的β－内酰胺酶基因。结果临床分离的1株KPN和1株PAE及其相应的转化子均产A类酶,PCR扩增测序显示PAE含有blaKPC－2型碳青霉烯酶编码基因,KPN含有blaKPC－2型碳青霉烯酶编码基因和blaSHV型超广谱β－内酰胺酶编码基因。二者的转化子只有blaKPC－2编码基因。结论临床分离的耐碳青霉烯类抗生素的KPN和PAE均携带A类2f组型碳青霉烯酶blaKPC－2编码基因且位于质粒上,而KPN所含的超广谱β－内酰胺酶blaSHV编码基因可能位于不同质粒上,或存在于该菌的染色体上。     

同时产碳青霉烯酶IMP与NDM的肺炎克雷伯菌和霍氏肠杆菌的分离及耐药性研究

目的对分别分离自我国两家医院的多药耐药菌株肺炎克雷伯菌10677和霍氏肠杆菌128379进行耐药机制研究。方法通过16SrDNA鉴定菌种,PCR筛查菌株携带的耐药基因,应用改良Carba NP法检测菌株产碳青霉烯酶的类型,接合转移和电转化试验验证携带IMP和NDM的质粒是否具有可转移性,全基因组测序获得细菌所携带的所有质粒序列,应用RAST、BLAST等对序列进行生物信息学分析。结果 10677和128379两株菌均产B类酶,且均携带碳青霉烯酶基因blaIMP和blaNDM。全基因测序结果显示10677和128379各包含两个分别携带blaIMP-4和blaNDM-1的质粒,分别为p10677-IMP、p10677-NDM、p128379-IMP和p128379-NDM。其中p10677-IMP、p10677-NDM和p128379-NDM可通过接合转移得到相应的接合子,p128379-IMP仅可通过电转的方式得到其电转化子。p10677-IMP和p128379-IMP均为IncN1型质粒,有三个共有的外源插入区,分别为包含有携带blaIMP-4的整合子In823b,IS1插入区,携带qnrS1基因的转座子Tn6292,除此外,p10677-IMP还包括携带fosA5基因的转座子Tn6412区以及IS26插入区。p10677-NDM和p128379-NDM为IncX3型质粒,包含两个共有的外源插入区,分别为ISKox3和携带blaNDM-1的耐药区,此外,p10677-NDM还包含一个独有的插入区ISEhe3。结论质粒p10677-IMP、p10677-NDM和p128379-IMP、p128379-NDM分别介导10677和128379多药耐药且均具有转移性,是这两株耐药菌传播的重要载体。     

病原微生物实验室Ⅱ级生物安全柜防护性能评价

目的评价病原微生物实验室Ⅱ级生物安全柜的防护性能。方法采用安德森采样器采样方法和通过相关仪器,以粘质沙雷菌气溶胶为防护对象进行Ⅱ级生物安全柜防护性能评价。结果所评价的36台Ⅱ级生物安全柜下降气流的平均合格率为91.7%,流入气流合格率为43.7%,气流模型合格率为43.9%。人员保护合格率为72.2%,样品保护合格率为88.9%,交叉污染合格率为88.9%。结论所测试的Ⅱ级生物安全柜存在较大的气溶胶泄漏风险,对实验操作人员保护性能较差。     

ATG5和ATG7在糜烂型口腔扁平苔藓中的表达

目的 探讨ATG5、ATG7在糜烂型口腔扁平苔藓(OLP)组织中表达情况及细胞自噬与口腔扁平苔藓之间的关系.方法 随机将27例患者划分为对照组14例和观察组13例,对照组患者给予复方四环素泼尼松膜进行治疗,观察组患者在对照组基础上加用肿痛安胶囊药粉.治疗前后分别取患者糜烂型OLP部分组织采用免疫组织化学检验并与正常口腔黏膜进行对比.结果 ATG5、ATG7在不同组织中显阳性,但在糜烂型OLP组织表达升高与正常组织表达差异有统计学意义(P<0.05).结论 细胞自噬在糜烂型OLP组织中表现异常且与其恶化相关.     

质粒基因注释可视化系统VPA V1.0的研建

目的 建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布.方法 运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本VPA.pl.结果 构建了质粒基因注释可视化系统VPA,该系统可实现多种类别、不同长度质粒的基因注释可视化...